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MMD1048, module 1 : LET'S GO!!! > Cours 4 > Flashcards

Cours 4 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un “PAS”?

A

plan d’analyse statistique : document qui définit les principales analyses statistiques

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2
Q

Le PAS…

Il est obligatoire dans une __________ et dans le ____________. Dans les articles scientifiques, une très brève description est de rigueur. Il y a ___________ d’analyser les données qui risquent d’aboutir chacune à des __________. Le PAS assure une certaine ___________ dans l’analyse et prévient la ___________ dans le choix des analyses et dans l’impact de ce choix sur les résultats. Le PAS est généralement écrit et défini avant ___________ et donc avant d’avoir vu ___________ (car le tripotage de données est très ______________ en pratique). Pour assurer l’objectivité des analyses (et restreindre le tripotage de données) lors de la publication des résultats d’un essai clinique, les revues avec un facteur d’impact _________ exigent une copie du _______ à la soumission de l’article ainsi que la _____________.

A
  • demande de subvention
  • protocole de l’étude
  • plsrs façons
  • résultats différents
  • objectivité
  • subjectivité
  • l’exécution de l’étude
  • les résultats
  • fréq
  • élevé
  • PAS
  • date où il a été scellé/finalisé.
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3
Q

Qu’est-ce qu’un “problème de multiplicité”?

A

Quand on a initialement un nombre de catégories pour un ECR, et qu’on fait du tripotage de données en créant des sous-catégories après avoir testé, pour affirmer notre hypothèse.

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4
Q

Le PAS (suite)…

Dans les demandes de subvention, l’espace étant limité, il n’est pas possible d’inclure le ___________. Les PAS des articles se concentrent principalement sur l’analyse se rapportant _________. Dans les contextes d’homologation, le PAS est ___________ (_____-_____ pages). Le PAS décrit les __________ seulement et ne donne aucun _________ (car il est écrit avant le début de l’étude). C’est un plan d’architecte pour les analyses statistiques afin de répondre à la Q de recherche et aux questions secondaires.

A
  • PAS au complet
  • au CRP
  • bcp + long
  • 50
  • 300
  • méthodes analytiques
  • résultat
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5
Q

Quelles sont les 6 sections concernant le contenu d’un PAS?

A
  • Section 1 : détails administratifs (promoteur, chercheur principal, auteur du PAS, etc.)
  • Section 2 : résumé de l’étude et de la Q de recherche

Section 3 : design et méthodes de l’étude (randomisation, insu, etc.)

Section 4 : principes statistiques utilisés

Section 5 : pop de l’étude

Section 6 : description des analyses statistiques prévues

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6
Q

Qu’est-ce qu’une “variable”?

A

caractéristique socio-démographique ou clinique mesurée sur chaque participant/patient de l’étude

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7
Q

Les variables…

L’essai clinique typique va mesurer ____________ de variables par patient. Elle peut être mesurée ___________ durant l’étude car elle est constante (ex : homme/femme) ou ___________ durant le suivi du patient afin de permettre de déterminer son évolution (ex : taux de cholestérol). Le nom variable indique que la caractéristique varie entre les patients et/ou varie durant le suivi. C’est cette variation qui est au centre de __________. Typiquement, les variables sont mesurées selon un ____________ d’évaluation ; une cédule de visite.

A
  • plusieurs centaines, voire milliers
  • qu’une seule fois
  • à plsrs reprises
  • l’erreur aléatoire
  • protocole fixe
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8
Q

Au recrutement avant la randomisation et le début des interventions, les variables mesurées lors des essais cliniques sont…? (5)

(cette évaluation au recrutement se nomme la “baseline” en anglais).

A
  • variables socio-démographiques

Ex : identifiant unique, genre, âge, éducation, ethnicité, région, site, etc.

  • variables d’expositions

Ex : intervention, usage tabac, caféine, etc.

  • variables cliniques

Ex : tension artérielle, IMC, grade du cancer, médicamentation concomitante, etc

  • autres variables potentiellement associées au CRP

Ex : biomarqueurs

  • facteurs de confusion connus (variables généralement associées au CRP)
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9
Q

Durant le suivi, après la randomisation et le début des interventions, les variables mesurées lors des essais cliniques sont selon la __________. Il y a 7 types de variables :

  • __________
  • __________
  • __________
  • __________
  • __________
  • __________
  • __________
A
  • cédule de visite
  • CRP
  • variable d’exposition (intervention/traitement reçu)
  • critères secondaires
  • variables d’innocuité
  • variables de mécanisme (ex : taille de la tumeur d’un cancer, pharmacodynamique, pharmacocinétique, etc.)
  • variables d’adhérence
  • autres variables selon le contexte
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10
Q

Une étude peut avoir plsrs CRP mais typiquement…?

A

3 ou moins.

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11
Q

Qu’est-ce la variable de “critères secondaires”?

A

Variable sur laquelle l’intervention pourrait avoir un impact.

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12
Q

La variable d’adhérence…

L’adhérence au traitement ou à une intervention est une variable ___________ dans un ECR. Afin qu’un participant/patient puisse bénéficier d’un traitement (si le traitement est efficace), il doit avoir utilisé le traitement selon ____________. L’adhérence partielle ou la non-adhérence peut avoir une __________ sur les résultats (ex. on pense que l’innocuité est nulle car aucun patient n’a utilisé le médicament). L’adhérence se mesure soit par des __________________ (ex : avez-vous pris votre traitement ?) et/ou par un ____________ des fioles retournées. Il existe d’autres méthodes pour mesurer l’adhérence.

A
  • importante
  • l’intention du protocole
  • influence substantielle
  • évaluations auto-rapportées par le patient
  • comptage de pilules
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13
Q

Les variables et la cédule de visite d’un ECR sont svt…?

A

résumées à l’aide d’une matrice.

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14
Q

Le premier diagramme à produire lors de la présentation des résultats d’un ECR.

A

diagramme CONSORT

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15
Q

Signification de “CONSORT”.

A

CONsolidated Standards Of Reporting Trials

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16
Q

V/F?

Le CONSORT est un organisme qui fait la promotion de la transparence dans la publication des résultats des études cliniques.

A

V!

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17
Q

Le diagramme CONSORT permet de…? (4 choses)

A
  • identifier rapido combien de participants/patients ont été approchés
  • combien ont participé à l’étude
  • combien ont été perdus durant le suivi
  • combien ont été inclus dans l’analyse principale sur le CRP
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18
Q

Qu’est-ce qui est un très bon indicateur de la qualité d’une étude (dans le diagramme CONSORT)?

A

les pertes au suivi

plus il y a de pertes au suivi, plus la validité interne de l’étude est affaiblie

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19
Q

% de pertes au suivi considéré comme relativement faible.

A

10% (de pertes au suivi)

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20
Q

% de pertes au suivi considéré comme très grand.

A

25% (de pertes au suivi)

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21
Q

Que veut dire analyse ITT?

A

analyse sous l’intention de traiter (en anglais : intention-to-treat analysis ou ITT)

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22
Q

Que veut dire analyse ITP?

A

analyse sou l’intention du protocole (en anglais : per protocol analysis ou PPA)

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23
Q

L’analyse ITT…

L’analyse ITT provient du besoin d’un __________ des conditions d’__________ dans l’analyse principale d’un ECR. Clairement, on peut fausser ou amplifier les _________ d’une étude en excluant les patients du groupe expérimental qui ne répondent pas bien au traitement et ceux du groupe placebo qui répondent bien au traitement. L’ITT ne permet aucune _________ de patients dans les analyses principales : un patient recruté et randomisé est de facto inclus dans l’analyse principale. Un des avantages de l’ITT c’est qu’elle préserve l’intégrité de la _________ et donc de la protection contre les ____________.

A
  • encadrement formel
  • exclusions
  • résultats
  • exclusion
  • randomisation
  • biais de confusion
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24
Q

V/F?

Bien souvent, les deux analyses (ITT et ITP) ne seront pas incluses ensemble dans les publications.

A

F! (elles le seront)

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25
Q

L’analyse ITT (suite)…

Par contre, l’ITT n’est pas la panacée. Premièrement, ce n’est pas facile d’______________. Pour ce, on doit avoir mesuré le CRP sur _____________. L’ITT ne permet pas de valeurs manquantes sur le ______. L’ITT va également plus loin en analysant le CRP selon la randomisation prévue _________; ceci, dans le but de décourager les abus au niveau de l’allocation des patients au traitement.

Les opposants à l’ITT disent que l’ITT ____________ de la réponse en ___________ le bénéfice et en ___________ l’innocuité. Ce qui est vrai. Depuis quelques années, on commence à voir des analyses __________. Ces analyses permettent quelques ____________.

A
  • inclure tous les patients randomisés
  • tous les patients randomisés
  • CRP
  • à l’origine
  • dilue l’amplitude
  • sous-estimant
  • surestimant
  • mITT (modified ITT)
  • exclusions très spécifiques
26
Q

Juste à lire pour comprendre la phrase “L’ITT sous-estime le bénéfice et sur-estime l’innocuité”

Par exemple, les participants qui ne sont pas adhérents au traitement, il faut les garder dans l’analyse principale quand même, et ne pas les exclure. Puisque ces patients n’ont pas utilisé le traitement, ils ne peuvent pas en bénéficier s’il s’avère efficace. À l’extrême, on voit qu’aucun bénéfice ne peut être observé si aucun patient n’utilise le traitement; ceci, même si le traitement expérimental est réellement efficace. À l’inverse, l’innocuité du traitement sera similaire à celle du groupe placebo, si personne ne l’utilise. Donc, dilution à zéro du bénéfice et surestimation de l’innocuité.

A

GO!

27
Q

L’analyse ITP…

L’analyse en ITP va permettre d’exclure _________ et _________ de l’analyse principale. Par contre, ces exclusions seront ____________ avant le _______ de l’étude (afin de prévenir abus). L’analyse selon l’ITP a pour but d’inclure slmt le patient « ______ » : soit, celui qui utilise le __________ tel que prescrit, vient à ___________ prescrites par le protocole, et adhère à toutes les autres ________ de l’étude. En bout de ligne, ceux qui sont le plus susceptibles de ____________. Typiquement, on s’attend à des résultats plus __________ que ceux obtenus sous l’ITT. Par contre, l’ITP expose l’étude au __________ car, plus il y a d’exclusions, plus on s’éloigne de la ____________ et de la ____________. De façon générale, les conclusions obtenues par les analyses selon l’ITT et l’ITP peuvent être ___________ ou __________.

A
  • certaines conditions
  • types de patients
  • définies a priori dans le PAS
  • début
  • parfait
  • traitement
  • chacune des visites
  • procédures
  • répondre au traitement
  • favorables
  • biais de confusion
  • randomisation initiale
  • comparabilité des groupes
  • similaires
  • diffs
28
Q

La validité interne de l’analyse selon l’TT est donc (inférieure/supérieure) à celle de l’analyse selon l’ITP.

A

sup!

29
Q

Qu’est-ce qui est + simple à faire au sens pratique du terme : analyse ITT ou ITP?

A

ITP

ex. ITT, si un patient s’absente pour la prise de données, c’est foutu

30
Q

L’_____________ donne un premier coup d’œil sur les résultats d’un ECR. Elle utilise des _________, des _________ et des ______ pour présenter un ________ des données. Elle permet de décrire la __________________ pour l’étude. De plus, elle permet d’entrevoir certains problèmes dans les __________ et/ou des problèmes de ___________ entre les groupes. Enfin, elle fournit des estimations __________ de la _______________.

A
  • analyse descriptive
  • tableaux
  • diagrammes
  • figures
  • résumé
  • pop de participants recrutés
  • données (données manquantes/aberrantes)
  • comparabilité
  • ponctuelles
  • réponse à la question de recherche clinique
31
Q

L’analyse descriptive (suite)…

Pour comparer les groupes, il est nécessaire de faire une présentation permettant __________ cette comparaison en mettant les groupes __________. Généralement, la __________ d’un article présente les statistiques descriptives des variables mesurées à la ___________ (statistiques socio-démographiques et cliniques). En pratique, on n’inclut pas _____________ (bcp trop et espace est limité dans articles). Typiquement, on doit inclure quelques variables __________. Les autres variables à inclure sont celles qui décrivent la __________ des participants/patients et celles qui sont modérément ou fortement ________ avec le _____ (connues de la littérature). Ces dernières variables sont nécessaires afin de déterminer le __________. L’analyse descriptive des autres variables (non incluses dans la Table 1) est effectuée mais _________.

A
  • facilement
  • côte à côte
  • première table
  • visite de recrutement
  • toutes les variables disponibles
  • socio-démographiques
  • présentation clinique
  • associées
  • CRP
  • risque de biais de confusion
  • exclue de la Table 1
32
Q

À la fin de l’étude, les données sont vérifiées et validées. C’est ce qu’on appelle les __________. Il y aura une étape où les ___________ seront calculées. Ces variables s’ajouteront à la base de données de l’ECR. Un exemple d’une variable dérivée est l’indice de masse corporelle (masse/grandeur).

A
  • données brutes

- variables dérivées

33
Q

Les analyses descriptives permettent de _________ l’information afin de faciliter l’interprétation et de faire émerger des tendances/associations. Clairement, un résumé implique qu’il y a une ___________. Il y a différentes façons de résumer l’information d’une variable mais principalement on peut les regrouper en 2 groupes comme suit :

  • ____________ (ex.______)
  • ____________ (ex.______)

Il y a moins de perte d’information lorsqu’on examine la __________ d’une variable. Par contre, l’espace restreint dans les articles scientifiques ne permet pas l’ajout des distributions.

A
  • résumer
  • perte d’information
  • mesure de tendance centrale (ex. moyenne) et de dispersion (ex. étendu, écart-type)
  • distribution présentée à l’aide d’une figure (ex. histogramme)
  • distribution
34
Q

Les dimensions…

Une table ou une figure peut avoir _________ dimension(s). Par exemple, la Table 1 de l’ECR VOICE comporte 2 dimensions : variables au recrutement (1ère dimension) tabulées par groupe d’exposition (2e dimension). Une analyse descriptive _________ utilise une seule dimension, ________ deux dimensions, et _________ plusieurs dimensions. L’ajout de plusieurs dimensions permet de déterminer les _________________.

De façon générale, plus il y a de dimensions plus la table/figure est __________.

A
  • plusieurs
  • univariée
  • bivariée
  • multivariée
  • différences/tendances/associations
  • informative
35
Q

Le diagramme en boîte…

L’IQR est ____________ (IQR = _____ - _____); c’est-à-dire, la ________ des observations se trouvent entre __________. La ligne rouge au centre représente la ________ (Q___, le ___e quartile). Certains logiciels vont ajouter une ligne pour la ________. Le diagramme en boîte n’inclut pas __________. Le diagramme en boîte est aussi connu sous le nom de __________. L’IQR et l’écart-type sont des mesures de _________. On peut également présenter le diagramme en boîte par ________.

A
  • l’intervalle interquartile
  • Q3
  • Q1
  • moitié
  • Q1 et Q3
  • médiane
  • 2
  • 2
  • moyenne
  • l’écart-type
  • diagramme de quartiles
  • dispersion
  • groupe
36
Q

Il est nécessaire d’inclure au moins une autre dimension dans un ECR : les ___________

A

groupes d’interventions.

37
Q

La distribution de l’âge peut être visualisée à l’aide d’un ___________.

A
  • histogramme
38
Q

On peut utiliser un histogramme en miroir pour présenter les histogrammes par _________.

A

groupe d’interventions

39
Q

La distribution et les statistiques descriptives sont ___________. L’histogramme est plus _________ mais plus _________ tandis que les statistiques descriptives sont __________ mais peuvent masquer des __________.

A
  • complémentaires
  • qualitatif
  • informatif
  • quantitatives
  • informations importantes
40
Q

Y a-t-il un danger à utiliser uniquement des statistiques descriptives?

A

Oui (ex. avec le même diagramme en boîte, on peut faire plsrs distributions).

41
Q

V/F?

Les valeurs manquantes sont un problème important pour un ECR (risque de biais de confusion).

Il est donc important de communiquer cette information à travers les statistiques descriptives (plus particulièrement, la Table 1).

A

V!

42
Q

Parmi les choix suivant de stats :

  • proportion
  • centile
  • IQR
  • moyenne
  • écart-type
  • diagramme en boîte
  • histogramme

Lequel/lesquels peut-on utiliser pour une variable…

dichotomique

A

proportion

43
Q

Parmi les choix suivant de stats :

  • proportion
  • centile
  • IQR
  • moyenne
  • écart-type
  • diagramme en boîte
  • histogramme

Lequel/lesquels peut-on utiliser pour une variable…

catégorique

A

proportion

44
Q

Parmi les choix suivant de stats :

  • proportion
  • centile
  • IQR
  • moyenne
  • écart-type
  • diagramme en boîte
  • histogramme

Lequel/lesquels peut-on utiliser pour une variable…

ordinale

A

tout sauf moyenne et écart-type (logique, car chiffres pas IMP : c’est l’ordre qui l’est)

si bcp de valeurs possibles, proportions ne seront pas utilisées

si peu de valeurs possibles, centiles ne seront pas utilisés

45
Q

Parmi les choix suivant de stats :

  • proportion
  • centile
  • IQR
  • moyenne
  • écart-type
  • diagramme en boîte
  • histogramme

Lequel/lesquels peut-on utiliser pour une variable…

continue

A

tout sauf proportion

46
Q

L’IQR et l’écart-type sont des mesures de ___________ tandis que la médiane et la moyenne sont des mesures de __________. Les centiles correspondent à des valeurs qui ________ les observations en ___________. Le centile correspond à la proportion des valeurs __________ à une valeur _________. La médiane (Q2) représente le ____e centile; le 1er quartile (Q1), _____e centile; et le 3e quartile (Q3), ____e centile. L’IQR est l’intervalle entre Q1 et Q3; ____ % des patients auront des valeurs dans cet intervalle (25e - 75e centile, par définition).

A
  • dispersion
  • tendance centrale
  • divisent
  • 100 parts égales
  • inférieures ou égales
  • valeur déterminée
  • 50
  • 25
  • 75
  • 50
47
Q

La (médiane/moyenne) est plus robuste que la (médiane/moyenne) car elle est moins sensible aux _________ et aux __________. Une distribution est symétrique si elle est miroir par rapport à sa _________ (sinon elle est asymétrique). La distribution observée d’une variable se visionne avec l’____________. En pratique, une distribution observée (un histogramme) est rarement purement _________.

A
  • médiane
  • moy
  • valeurs extrêmes
  • distributions asymétriques
  • moyenne
  • l’histogramme
  • symétrique
48
Q

Le mode représente la valeur _____________ dans une distribution. Il peut donc avoir ____________ dans une distribution. En pratique, on utilise le mode pour décrire de façon __________ une distribution observée. Une distribution multi-modale implique que la distribution possède plusieurs _________. Une distribution unimodale est une distribution avec seulement une bosse prédominante.

A
  • la plus fréq
  • plus d’un mode
  • qualitative
  • bosses
49
Q

Les variables avec des __________ sont difficiles à décrire de façon descriptive, principalement à cause de la __________, et ce, autant pour les mesures de tendance centrale que pour les mesures de dispersion (y compris les diagrammes en boîte et les histogrammes). Les ________ sont le plus svt utilisés pour décrire ce type de variable. Les ___________ sont le plus souvent utilisées pour illustrer les variables sur des temps d’incidence.

A
  • temps d’incidence
  • censure (administrative)
  • centiles (Q1, médiane, Q3)
  • courbes de Kaplan-Meier
50
Q

On présente les variables de nature dichotomique ou catégorique (ou ordinale si peu de valeurs possibles) à l’aide d’un _________. Les proportions notées dans ces tableaux qui sont pertinentes sont les proportions selon la __________.

A
  • tableau de contingence

- colonne (et non la rangée!)

51
Q

Les CRP utilisés dans les ECR sont souvent des __________. Ce type de donnée s’appelle aussi __________ dans la littérature. Le nom porte un peu à confusion car il ne s’applique pas seulement à des CRP concernant le _______. La difficulté première avec ce type de données c’est qu’elles ne sont que ___________ (donc difficile d’utiliser les autres méthodes décrites). Les méthodes d’analyse pour ce type de données sont hors de la portée du cours MMD 1048. Plutôt, le cours se concentre sur l’interprétation des résultats des ___________.

A
  • temps d’incidence
  • durée de survie
  • décès
  • partiellement observées
  • courbes de Kaplan-Meier (KM)
52
Q

La courbe de Kaplan-Meier (KM) débute toujours à ______ (ou à ____ %) car les études d’incidence recrutent toujours des participants/patients qui n’ont pas encore éprouvé l’événement (ex : décès, infection au VIH) et qui sont à risque durant le suivi. La forme _________ est aussi typique, mais les marches deviennent moins perceptibles (plus/moins) le nombre de patients et de cas incidents sont _________.

A
  • 100 % (si on mesure le risque de non apparition)
  • 0% (si on mesure le risque d’apparition)
  • en escalier
  • plus
  • importants
53
Q

Aller lire “écart type” sur document Word!

A

GO!

54
Q

Aller lire “tableau de contingence” sur Word!

A

GO!

55
Q

Aller lire “cote” sur Word!

A

GO!

56
Q

Aller lire “proportion d’une variable dichotomique” sur Word!

A

GO!

57
Q

Aller lire toute dernière section du cours 4, sous “suivi partiellement observé” sur Word!

A

GO!

58
Q

Les courbes de KM sont très utilisées pour comparer…?

A

les temps d’incidence pour deux groupes ou plus

59
Q

Aller lire toute dernière section du cours 4, sous “comparaison de 2 groupes”!

A

GO!

60
Q

Aller lire toute dernière section du cours 4, sous “croisement des courbes”!

A

GO!

MMD1048, module 1 : LET'S GO!!! (4 decks)

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