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enzymologie intra 2 > cours 4 > Flashcards

cours 4 Flashcards

(92 cards)

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1
Q

c’est quoi des protéines G ?

A

des protéines qui se lient au GTP

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Q

comme quoi agissent les protéines G ?

A

comme des interrupteurs moléculaires

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Q

quel est le domaine conservé des protéines g et quels en sont les éléments communs

A

le domaine G.
les éléments en commun sont les boucles P et les Switch 1et 2

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4
Q

quelles sont les super familles de GTPases ?

A
  • les petites GTPase (Superfamille Ras-like)
  • les protéines G Hétérotrimériques
  • les GTPases traductionnelle
  • les dynamines
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Q

les effecteurs secondaires interagissent avec quelle partie des GTPases ?

A

avec les boucles switch 1 et 2 exclusivement lorsque la GTPase est dans l’état actif

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6
Q

par quoi est assisté le cycle des GTPases ?

A

par GEF et GAP

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7
Q

quelle est la fonction de la GEF ?

A

se lie à la gtpase et provoque l’ouverture du site de liaison au nucléotide

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8
Q

quelle est la fonction de la GAP ?

A

accélère l’hydrolyse du gtp en gdp

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9
Q

quelle est la fonction de GDI ?

A

se lie à la gtpase et bloque l’échange du nucléotide

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10
Q

vrai ou faux ? GEF se lie à la GTPase avec une préférence particulière pour l’état du nucléotide ?

A

faux

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11
Q

pourquoi l’hydrolyse du GTP est très lente ?

A

parce que l’eau est un très mauvais nucléophile

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12
Q

c’est quoi le GTPγS ?

A

un analogue non-hydrolysable du GTP

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13
Q

c’est quoi le GDP-AlF4 ?

A

un analogue de l’état de transition de l’hydrolyse du GTP en GDP

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14
Q

quelles sont les molécules dont on a besoin pour effectuer l’étude structurale de l’hydrolyse du GTP ?

A

GTPγS (analogue non-hydrolysable du GTP)
GDP-AlF4 (analogue de l’état de transition de l’hydrolyse)

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15
Q

comment les GAP accélèrent l’hydrolyse du GTP en GDP?

A
  1. en stabilisant les charges du phosphate gamma via une arginine finger
  2. en activant une molécule d’eau par des ponts hydrogène.
  3. en facilitant la catalyse acide-base grâce à une glutamine.
  4. en stabilisant l’état de transition, rendant la coupure du phosphate plus efficace.
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16
Q

vrai ou faux ? les GAP interagissent souvent avec d’autres régions de la GTPase pour leur confier une spécificité

A

vrai

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17
Q

qui sont les inhibiteurs de dissociations des nucléotides ?

A

les GDI

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18
Q

quelle est la particularité du mécanisme des GDI en termes de conservation et de spécificité ?

A

le mécanisme des GDI est conservé, car il existe chez différentes espèces, mais exclusif à certaines familles de GTPases, comme Rho et Rab.

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19
Q

comment les inhibiteurs de dissociations effectuent leurs tâches ?

A

ils vont se lier aux GTPases, puis stabiliser la forme liée au GDP, ce qui va empêcher l’échange du nucléotide

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20
Q

quelle structure adopte en général les petites GTPases ?

A

la structure monomérique

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21
Q

les petites GTPases sont souvent attachés à quoi ?

A

à la membrane

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22
Q

dans quoi sont impliqués les petites GTPases ?

A

dans plusieurs processus cellulaires

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23
Q

dans quelle processus cellulaires sont impliqués les Ras ?

A
  • prolifération
  • croissance
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24
Q

quels sont les processus cellulaires qui implique des Rho ?

A
  • cytosquelette
  • adhésion
  • polarisation
  • motilité cellulaire
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25
dans quelle processus cellulaires sont impliqués les Arf ?
- traffic cellulaire (Golgi, lysosome)
26
dans quelle processus cellulaires sont impliqués les Rab ?
- traffic cellulaire (Endosomal)
27
dans quelle processus cellulaires sont impliqués les Ran ?
- import/export nucléaire
28
quels sont l'un des premiers oncogènes identifiées dans les années 60 ?
Ras
29
de quel virus est issu Ras ?
Rat sarcoma virus
30
chez quel type d’organisme le Ras sarcoma Virus cause-t-il le cancer ?
chez les murins
31
quelles sont les trois isoformes de Ras chez l’humain ?
- HRas - KRas - NRas
32
quelle partie des isoformes de Ras est modifiée par des lipides ?
la queue C-terminale
33
où se situent les principales différences fonctionnelles entre les isoformes de Ras ?
au niveau de la queue C-terminale
34
que fait ras lorsqu’elle est activée ?
elle promeut: - la progression du cycle cellulaire - l’anabolisme - le réarrangement du cytosquelette - la prolifération - la motilité cellulaire
35
combien d’effecteurs secondaires ras peut-elle activer ?
+ de 10
36
sous quelle forme ras est-elle active ?
ras-gtp
37
quel effet a ras sur le cytosquelette ?
elle participe à son réarrangement, influençant la motilité cellulaire
38
quelle est la voie principale par laquelle ras affecte la cellule ?
la voie des map kinases
39
que signifie l’acronyme map dans map kinases ?
mitogen activated protein
40
ras active quelle kinase en premier dans cette voie ?
raf
41
quelle est la cascade de phosphorylation dans la voie des map kinases ?
raf (mapkkk) → mek1/2 (mapkk) → erk1/2 (mapk)
42
quel est le rôle de erk dans cette voie (MAP) ?
erk phosphoryle des cibles en aval qui modifient le programme transcriptionnel et accélèrent le cycle cellulaire, le métabolisme et cause la prolifération et la survie cellulaire
43
quels types de cancers dépendent le plus de ras ?
Pancréas, poumon et colorectal par exemple)
44
quelle est la forme de ras la plus souvent mutée ?
kras
45
quelles autres formes de ras peuvent aussi être mutées ?
h-ras et k-ras
46
quelles sont les positions de mutations les plus fréquentes dans ras ?
g12, g13, r60 et q61
47
par quoi ras est-elle activée ?
par ras gef
48
quels stimuli activent les ras gef ?
les facteurs de croissance
49
par quoi l’inactivation de ras est-elle régulée ?
par les ras gap
50
quelle protéine ras gap est essentielle ?
nf1
51
existe-t-il des gdi connus pour ras ?
non
52
comment une ras gef active-t-elle ras ?
elle se lie en formant une pince autour de ras
53
où se lie switch i dans la gef ?
dans un fossé hydrophobe
54
quel est l’effet de la liaison de switch i à la gef ?
elle diminue l’affinité de ras pour le gdp
55
donne un exemple de ras gef
sos1
56
donne un exemple de ras gap
nf1
57
quel est le rôle des ras gap dans l’hydrolyse du gtp ?
elles accélèrent l’hydrolyse du gtp en formant un berceau sur lequel ras se lie
58
les mutations fréquentes de ras dans le cancer affectent le plus souvent quoi ?
l’hydrolyse du GTP
59
où sont situés les résidus g12 et g13 dans ras ?
dans la boucle p
60
où est situé le résidu q61 dans ras ?
dans la région switch ii
61
quel est l'effet des mutations de RAS dans le cancer ?
elles induisent un état tout le temps actif
62
vrai ou faux ? ras est une cible pharmaceutique
vrai
63
pourquoi est-il difficile de cibler ras avec des médicaments ?
car le site du gtp est lié très fortement au nucléotide
64
quel mutant spécifique de ras est ciblé par le traitement anticancéreux ?
G12C
65
dans quoi sont impliqués les GTPases Rho ?
dans le remodelage du cytosquelette
66
les GTPases Rho sont très similaire à qui ?
aux GTPases Ras
67
comment se compare le taux d’hydrolyse du gtp des gtpases rho par rapport à ras ?
il est plus élevé que celui de ras
68
est ce que les voies des GTPases Rho croisent d’autres voies de signalisations ? si oui, lesquelles ?
celles associés à Ras et d’autres GTPases
69
quelles sont les fonctions des GDI des GTPases Rho ?
- d’inhiber l’échange du GDP - extraire Rho de la membrane cellulaire
70
que sont les GTPases Rab et Arf ?
2 familles de petites GTPases impliqués dans le trafic vésiculaire
71
qu’est ce qui diffère de Rab à Ras et Rho ?
ses régulateurs (GEF,GAP,GDI)
72
à quoi se lie la GTPase Arf ?
à la membrane par une hélice N-terminale
73
quels sont les seules petites GTPases qui ne s’associent pas à la membrane ?
la famille des GTPases Ran
74
dans quoi sont impliqués les GTPases hétérotrimériques ?
dans la signalisation des RPCG
75
de quoi est constitué le complexe formé de 3 protéines des protéines G hétérotrimériques ?
- G alpha: GTPases qui transmet le signal spécifique - G bêta: bêta propeller qui transduit le signal et forme un module avec - G gamma: petite protéine ancrée dans la membrane
76
de quelle type de famille les récepteurs couplés aux protéines G font-ils parties ?
d’une énorme famille de récepteurs hormonaux
77
qu’induit l’activation du RPCG ?
ça va induire l’échange du GTP en GDP qui va dissocier G alpha de G gamma. Par conséquent, les 2 vont activer d’autres effecteurs
78
quand la signalisation des RPCG se termine ?
quand des protéines RGS (GAP des protéines G) induisent l’hydrolyse du GTP dans G alpha
79
quels sont les 4 grandes sous-familles de G alpha ?
- G alpha q - G alpha s - G alpha i - G alpha 12
80
quel est le rôle de G alpha q ?
d'activer la phospholipase C et des canaux calciques
81
quel est le rôle de G alpha s ?
- activer l'adénylate cyclase - créer l'amp cyclique - activer la PKA
82
quel est le rôle de G alpha i ?
- d'inhiber l'adénylate cyclase - signaler via G beta gamma
83
quel est le rôle de G alpha 12 ?
d'activer la signalisation par Rho
84
nomme-moi une des GPCR les plus étudiés ?
la rhodopsine
85
explique moi la transduction du signal visuel via la rhodopsine
1. RPCG est activée par la lumière 2. changement de conformation du récital 3. activation de la translucide qui active une phosphodiestérase 4. conversion du GMP cyclique en GMP 5. La baisse de [GMPc] mène à fermre les canaux ioniques, à polariser la membrane cellulaire et à libérer les neurotransmetteurs
86
quels sont les trois types principaux de récepteurs adrénergiques ?
α1, α2 et β
87
pourquoi une même hormone peut-elle avoir des effets différents sur différentes cellules ?
car les cellules expriment différents types de récepteurs adrénergiques
88
c'est quoi les récepteurs des cannabionoïdes ?
des RCPG qui peuvent signaler via plusieurs voies de signalisation en même temps
89
quelles protéines permet aux RPCG d'aussi signaler via d’autres mécanismes ?
les arrestines
90
que sont les GTPases traductionnelles ?
une famille de GTPases impliquée dans l’initiation, l’élongation et la terminaison de la traduction. également impliquée dans l’assemblage du ribosome (BMS1)
91
qui joue le rôle de la GAP de EF-TU chez les procaryotes ?
le ribosome
92
quel est l’équivalent de la GAP et la GEF chez les protéines hétérotrimérique ?
GAP: RGS GEF: RPCG

enzymologie intra 2 (4 decks)

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