Cours 7- La réplication de l'ADN

Question 1

Comment se nomme la première étape du cycle cellulaire chez la bactérie?

Answer 1

La réplication du chromosome bactérien.

Question 2

Nommez les 3 étapes de la réplication du chromosome

Answer 2

1- initiation
2- élongation
3- terminaison

Question 3

Nommez les 8 étapes du cycle cellulaire bactérien

Answer 3

1- Croissance
2- Masse d'initiation
3- Réplication- initiation
4- Réplication-élongation
5- Réplication- terminaison
6- Décaténation
7- Ségrégation/septum
8- Division

Question 4

De quel côté tourne la double hélice?

Answer 4

Du côté droit.

Question 5

Comment se nomment les carbones du sucre de l’ADN?

Answer 5

Prime

Question 6

Où est attaché la base sur le désoxyribose?

Answer 6

Sur le carbone 1’

Question 7

Où sont attachés le ou les P sur le désoxyribose?

Answer 7

En carbone 3’ ou carbone 5’.

Question 8

Expliquez la biosynthèse des dNTP.

Answer 8

1- La ribonucléotide réductase réduit (enlève l’O’) en position 2’ du ribose dans un NDP, pour faire un dNDP
2- La kinase ajoute un phosphate pour faire un dNTP

Question 9

Expliquez la biosynthèse du dTTP.

Answer 9

1- La dUDP phosphatase donne le dUMP.

2- Le 5-méthyl est ajouté au d-UMP par la thymidylate synthétase via le tétrahydrofolate.

Question 10

D’où provient le tétrahydrofolate?

Answer 10

Il provient du dihydrofolate, via la dihydrofolate réductase

Question 11

Qu’est ce que la réplication semi-conservative?

Answer 11

Chacune des branches qui sort du complexe de réplication possède un vieux brin conservé et un nouveau brin.

Question 12

Comment se nomme la structure où survient la réplication?

Answer 12

La fourche de réplication

Question 13

Comment se nomme l’enzyme qui effectue la polymérisation de l’ADN?

Answer 13

La polymérase ADN

Question 14

Quelle est l’action de la polymérase ADN?

Answer 14

Elle attache le premier phosphate du dNTP au carbone 3’ du nt suivant, ce qui mène également au relâchement des 2 derniers phosphates du 1er nucléotides pour fournir l’énergie nécessaire à la polymérisation

Question 15

Vrai ou faux. Sur le brin matrice, l’ADN polymérase se déplace dans le sens 5’-3’.

Answer 15

Faux. Elle se déplace dans le sens 3’-5’, ce qui permet de lier les dNTP du nouveau brin dans le sens 5’-3’.

Question 16

Comment se nomment les polymérases qui participent à la synthèse normale de l’ADN?

Answer 16

Polymérase I et Polymérase III

Question 17

Quelle polymérase possède des rôles accessoires dans la réplication de l’ADN?

Answer 17

La polymérase I

Question 18

Quelle polymérase fait partie d’un gros complexe de protéines?

Answer 18

La polymérase III

Question 19

Comment la polymérase III est-elle ancrée à l’ADN, et quel est l’effet de cette liaison?

Answer 19

Par la sous unité DnaN (ou béta-clamp, sliding clamp). Cela lui permet de synthétiser l’ADN très efficacement, avec très peu d’interruptions .

Question 20

Vrai ou faux. Les amorces sont faites d’ADN.

Answer 20

Faux. Ce sont des petits ARNs.

Question 21

Comment se nomme la primase qui synthétise les amorces lors de la réplication de l’ADN?

Answer 21

DnaG

Question 22

Quelle polymérase remplace les amorces d’ARN par de l’ADN?

Answer 22

La polymérase I

Question 23

Quelle activité enzymatique particulière possède la polymérase I, et que lui permet-elle de faire?

Answer 23

Une activité exonucléase 5’ vers 3’. Cette activité lui permet d’enlever les ribonucléotides ayant été incorporé pour faire l’amorce.

Question 24

Vrai ou faux. Les polymérases ADN et ARN sont capables de séparer les brins d’ADN.

Answer 24

Faux. Seulement les polymérases ARN peuvent le faire.

Question 25

Quel est le rôle et DnaB, et comment fait-elle ce rôle?

Answer 25

DnaB est une ADN hélicase, donc elle sépare les brins d'ADN en avant de la polymérase III. Pour ce faire, elle s'attache fortement au brin discontinu.

Question 26

Comment sont reliées entre-elles 2 polymérases?

Answer 26

Via la clamp loader

Question 27

Nommez 2 rôles des protéine SSB.

Answer 27

1- Interaction avec l'ADNsb pour empêcher la refermeture des brins séparés par DnaB 2- Maintient de l'intégrité de l'ADNsb (protection)

Question 28

Quel est le rôle de l'ADN gyrase?

Answer 28

C'est une ADN topoisomérase, qui enlève le surenroulement positif généré en avant de la fourche de réplication.

Question 29

Qu'arrive-t-il si le surenroulement positif n'est pas retiré dans l'ADN?

Answer 29

La progression de la fourche sera empêchée.

Question 30

Qu'est ce que la fonction editing de la polymérase?

Answer 30

C'est une activité exonucléase 3' vers 5', qui permet à la polymérase de reculer et d'enlever les nucléotides incorporés par erreurs, donc de corriger les erreurs de réplication.

Question 31

Quelles polymérases possèdent la fonction editing?

Answer 31

Pol I et III (DnaQ)

Question 32

Quelles polymérases sont des error prone polymérases? Qu'est ce que cela veut-dire?

Answer 32

Pol IV et pol V. Ces polymérases n'ont pas d'activité de correction, et vont augmenter le nombre de mutations.

Question 33

Nommez 4 obstacles à la réplication de l'ADN

Answer 33

1- Protéines attachées à l'ADN 2- Surenroulement positif en excès 3- Dommages encombrants à l'ADN 4- Cassures

Question 34

La polymérase III gère différemment les différents obstacles s'ils se trouvent sur le brin continu ou discontinu. Quelles sont les différences?

Answer 34

Brin discontinu : La pol III peut sauter par dessus les obstacles Brin continu : On a besoin d'une nouvelle polymérase III

Question 35

Qu'est ce qui voyage plus vite? La transcription ou la réplication?

Answer 35

La réplication voyage 20x plus vite.

Question 36

Quelles collisions sont les plus dommageables? Les collisions face à face ou les collisions co-directionnelles?

Answer 36

Les collisions face à face

Question 37

Qu'est ce que le surenroulement négatif?

Answer 37

L'énergie emmagasinée dans l'ASDN tend à dérouler la double hélice et compacter l'ADN. Cela facilite l'ouverture des brins pour initier la réplication et la transcription.

Question 38

Qu'est ce que le surenroulement positif?

Answer 38

La tension dans l'ADN tend à enrouler davantage la double hélice, et les brins d'ADN sont plus difficile à séparer. Le surenroulement positif est généré par la réplication.

Question 39

Quelle est l'activité de l'enzyme topoisomérase?

Answer 39

Activité de cassure de brins, passage de brins et refermeture (ligation).

Question 40

Vrai ou faux. La topoisomérase participe à toutes les étapes de la réplication.

Answer 40

Vrai.

Question 41

Par quoi est régulé le surenroulement du chromosome bactérien?

Answer 41

Par les activités opposées de la gyrase et de la topoisomérase I

Question 42

Qu'est ce qui est absolument essentiel lors de l'initiation de la réplication (en lien avec la topologie de l'ADN) ?

Answer 42

Le surenroulement négatif de l'ADN par la gyrase est nécessaire, avec DnaA, pour séparer les brins d'ADN à OriC, afin d'initier la réplication.

Question 43

Par quel enzyme sont enlevées les pré caténanes?

Answer 43

Topoisomérase IV

Question 44

Quel est le problème au niveau de la terminaison de la réplication, en ce qui concerne la topologie de l'ADN?

Answer 44

Les 2 fourches convergentes à la région ter entraînent une très forte accumulation de supertours positifs qui ne peuvent pas être enlevés par la gyrase, car l'espace est trop restreint.

Question 45

Le surenroulement négatif favorise-t-il la caténation ou la décaténation?

Answer 45

La décaténation

Question 46

À quel moment est-ce que la réplication du chromosome se termine?

Answer 46

Lorsque les 2 fourches initiées à OriC se rencontrent dans la région Ter

Question 47

Comment la terminaison est-elle restreinte aux séquences ter?

Answer 47

Grâce au système Tus/ter, qui bloque les fourches d'une manière unidirectionnelle.

Question 48

Quel est l'avantage d'avoir la terminaison aux séquences ter?

Answer 48

Facilite le couplage avec la ségrégation des chromosomes.