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Biocell > Cours 9 > Flashcards

Cours 9 Flashcards

1
Q

Comment est-ce que les compartiments cellulaires sont entourés par la membrane?

A

Par le trafic vésiculaire

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Q

Comment les vésicules transportent les protéines d’un endroit à un autre?

A

Les moteurs protéiques et des filaments cytosquelettiques polaires.

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3
Q

Comment les vésicules naissent et que font ils rendus à leur destination?

A

Ils naissent par bourgeonnement et, arrivés à leur destination, ils font la fusion membranaire.

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4
Q

Quels sont les trois choses que le trafic vésiculaire crée?

A

-Le chargement d’une cargaison

-La formation de vésicules à partir d’une membrane donneuse

-La fusion de ces vésicules avec une membrane cible

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5
Q

Quels sont les trois types de vésicules recouvertes de trois protéines différentes?

A

COPI, COPII, clathrin

(COP stands for coat protein)

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6
Q

Comment sont formées et acheminées les vésicules COPII?

A

Ils sont formés à partir du RER et sont acheminées vers le Golgi.

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7
Q

Qui est la GTPase monomérique qui permet le transport de protéines? Comment est elle activée?
Comment s’insère-t-elle dans la membrane?

A

Il s’agit du Sar1
Elle est activée par une GEF
Insertion dans la membrane grâce à un hélice alpha amphiphile.

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8
Q

Que doivent faire les COPII après qu’ils bourgeonnent?

A

Elles doivent se fusionner à une membrane cible.

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9
Q

Que lient et que forment les protéines Sec23/24?

A

Ils lient le Sar1GTP et un récepteur de cargaison pour former l’intérieur du manteau protéique des COPII.

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10
Q

Quels sont les deux types de protéines utilisés pour le ciblage?

A

Les Rabs (GTPase de type RAS) et les SNAREs (protéines de fusion)

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11
Q

La Rab-GTP s’insère dans la membrane de COPII lorsqu’elle est activé par quoi?

A

Lorsqu’elle est activée par un GEF membranaire situé sur la membrane donneuse.

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12
Q

Que font les Rabs et les SNAREs ensemble?

A

Ils participent au ciblage d’autres vésicules (COP-I et clathrine)

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13
Q

Le récepteur de la Rab est situé sur quelle membrane?

A

La membrane cible (acceptrice de la vésicule)

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14
Q

Que sont les SNAREs?

A

Ils sont des protéines membranaires qui se trouvent sous forme de paires complémentaires pour fusionner des membranes.

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15
Q

Quels sont les deux types de SNARE?

A
  1. v-SNARE (sur la membrane de la vésicule)
  2. t-SNARE (dans la membrane cible)
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16
Q

Que fait en sorte que les deux couches externes des v/t-SNARE fusionnent?

A

Sans de l’eau, car la liaison est tellement forte qu’elle expulse l’eau.

Ils poussent les molécules d’eau vers l’extérieur pour se rapprocher de plus en plus jusqu’à la formation d’une tige qui va permettre la fusion des membranes

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17
Q

Une fois que la vésicule a fusionné avec la membrane cible, il faut dissocier la paire de SNAREs(v-SNARE et t-SNARE). Que faut-il pour briser la liaison?

A

Il faut l’énergie de l’hydrolyse d’ATP pour les dissocier.

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18
Q

Par quelles vésicules une partie des protéines retournent au RER? Que font les autres qui ne retournent pas?

A
  1. Via les vésicules de COPI
  2. ils poursuivent vers le médiane-golgi et le trans-golgi
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18
Q

Les vésicules COPII fusionnent avec quel partie du golgi?

A

Le cis-golgi.

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19
Q

Que se passe-t-il dans la médiane-golgi

A

La maturation de leurs sucres

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20
Q

Que se passe-t-il dans le trans-golgi?

A

Les protéines sont triées et emballées

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21
Q

Quels sont les deux destinations finales du trans-golgi

A

L’endosome/lysosome (vésicules de clathrine)

La membrane plasmique (vésicules de COPI)

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22
Q

Qu’utilisent de différent les COPI des COPII?

A

Les protéines de recouvrement (leur formation commence par l’activation de ARF1 au lieu de Sar1)

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23
Q

Dans le cis-golgi, les manteaux de COPI se forment autour de quelles types de protéines?

A

Les protéines transmembranaires ayant la séquence KKXX en Cterminale

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24
Q

Comment se nomment les récepteurs qui font partie de ces protéines transmembranaires?

A

les KDEL

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25
Q

De quel façon est le retour des lipides et des protéines du cic-Golgi au RE?

A

Il est constitutif (alors continuel) et nécessite les rab-snares appropriés.

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26
Q

Pourquoi le RE ne s’en occupe pas de trier les protéines?

A

Car le cis-golgi s’en occupe.

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27
Q

Quels sont les deux modèles de mécanisme de transport des protéines à travers les différentes parties du Golgi?

A

Le modèle de transport de vésicules
Le modèle de maturation des citernes

Ou bien les deux mélangés

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28
Q

Que fait le modèle de transport de vésicules ?

A

Les citernes ne bougent pas

Les protéines voyagent d’une citerne à l’autre via les vésicules (antérograde et rétrograde)

29
Q

Quel est le rôle de la matrice extra-golgienne? (3)

A

Elle est responsable de l’intégrité structurale du Golgi,

elle aide au transport

et positionne le Golgi dans la cellule.

29
Q

Que fait le modèle de maturation des citernes?

A

Il y a une maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elle contiennent.

Le transport rétrograde est fait par les vésicules

30
Q

Comment se nomment les protéines qui constituent majoritairement la matrice extra-golgienne

A

Les golgines

31
Q

Comment fonctionnent les golgines?

A

Elles s’allongent pour former un filet qui exclut la majorité des organites

32
Q

Comment les golgines s’insèrent dans la membrane?

A

Via leur c-terminal et l’extrémité n-terminale peut se retrouver beaucoup plus loin dans le cytoplasme.

33
Q

Pourquoi la structure de super-hélice peut être rompue?

A

Pour permettre plus de flexibilité

34
Q

Les différents types de golgines peuvent lier les protéines d’identité vésiculaire (vésicules comme Rab, Arf). Ainsi, les golgines sont recrutées à qui et que font-ils dans le cytoplasme?

A

Ils sont recrutées à des citernes spécifiques

Ils pêchent ces vésicules spécifiques dans le cytoplasme

35
Q

Pourquoi les scientifiques ont décidé d’utiliser la mitochondrie pour évaluer les golgines?

A

Car la mitochondrie ne se lie généralement pas à des vésicules, alors lorsqu’elle se lie, c’est à cause de les golgines.

36
Q

L’attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine peut mener à quelles deux choses?

A
  • la fusion membranaire (les golgines qui interagissent avec les SNAREs)
  • la stabilisation de la matrice externe du Golgi (l’empilement des citernes)

En d’autres mots,
Différents golgines se lient à des choses pour fusionner ou pour stabiliser la matrice externe.

37
Q

Les protéines arrivent au golgi ayant une glycosylation fournie par le RER. Que veut cela dire par rapport à leurs unités?

A

Qu’elles ont toutes la même unité préformée lié aux Asn (asparagine) composée de GlcNac et mannose

38
Q

Les différentes enzymes golgiennes travailleront sur l’unité de ASN de quelle façon? Pour former quoi?

A

De façon séquentielle

Pour former une unité de sucre différente

38
Q

comment fonctionne le cycle de substrat/produit des enzymes?

A

Chaque produit est reconnu comme le substrat pour la prochaine enzyme.

39
Q

Que fait une tomographie immunoélectrique? (il y en a deux)

A

Ça localise l’enzyme mannosidase par les anticorps couplés à des particules d’or

Modélisation de l’appareil de golgi en 3D

40
Q

Quels sont les 5 raisons pour faire maturer les sucres?

A

Ciblage (du lieu d’appartenance de la protéine)

Solubilité (augmentée pour aider le repliement en milieu aqueux)

Couche protectrice (résistance aux protéases)

Adhérence (jonctions)

Signalisation intercellulaire (antigènes et globules blancs)

41
Q

Quels sont les deux possibilités du voyage des protéines à partir du trans-golgi?

A

Vers la membrane plasmique

Vers les endosomes-lysosomes

42
Q

Comment se fait le voyage des protéines à partir du transgolgi vers la membrane plasmique?

A

Par les vésicules de COPI ayant les Rabs et SNAREs appropriés.

43
Q

Comment sont ciblés les protéines à partir du trans-golgi vers la membrane plasmique?

A

Par un sucre complexe

44
Q

Comment se fait le voyage des protéines à partir du transgolgi vers les endosomes-lysosomes?

A

par des vésicules de clathrine ayant les Rabs et SNAREs appropriés.

45
Q

Comment sont ciblés les protéines à partir du trans-golgi vers les endosomes-lysosomes

A

Par un sucre riche en mannose phosphaté

46
Q

Comment se nomme la concentration des protéines cargo en une seule vésicule?

A

Le retrait des membranes

47
Q

Que font et de quoi sont faits les membranes récupérées du retrait de membranes?

A

Ils sont faits de clathrine et ils retournent au Golgi. La cellule recycle sa clathrine.

48
Q

Comment se nomment les deux voies pour les vésicules sécrétoires?

A

Les voies constitutives et des voies contrôlées (attendent un signal).

49
Q

Chez les vertébrés, le golgi est adjacent à qui,
il s’accroche à qui

A

Le golgi est adjacent au MTOC

Il s’attache aux dynéines

50
Q

Chez les plantes, le Golgi nécessite quelle interaction pour se positionner et se déplacer?

A

Grâce à l’interaction de la matrice extra-golgienne avec l’actine-F et la myosine

51
Q

Qu’est-ce qui se passe durant la mitose chez le Golgi et ses citernes?

A

La phosphorylation des protéines de la matrice extra-golgienne va bloquer la voie de sécrétion et va défaires les citernes en petites vésicules

52
Q

Comment la distribution du golgi est fait lors de la mitose?

A

À l’aide du fuseau mitotique et les dynéines

53
Q

Quelle est la particularité du blocage de la voie de sécrétion lors de l’apoptose?

A

C’est irréversible, les protéines de la matrice vont être dégradés

54
Q

Qu’est le lysosome?

A

Site intracellulaire de digestion

55
Q

Décrit la formation du lysosome (4)

A

Des vésicules de clathrine partent du golgi ou de la MP (contiennent des hydrolases acides)

Il sont acheminées vers les endosomes

L’endosome devient acide (grâce à l’ATPase de type V) et accumule les hydrolases acides

il se transforme en lysosome

56
Q

Que lient et que forment les protéines Sec13/31

A

Ils se lient par dessus Sec23/24 et forment l’extérieur du manteau protéique.

56
Q

Comment sont étiquetées les protéines destinées au lysosome/endosome?

A

Avec un mannose-6-phosphate, synthétisé par deux réactions en série

57
Q

Grâce à ___, les vésicules de clathrine se forment autour de leur cargaison. Comment se fait-il?

A

Adaptines

Elles lient le récepteur de mannose6phosphate d’un côté et la clathrine de l’autre côté

58
Q

Comment s’appèle une unité de clathrine?

A

Une triskèle

59
Q

Qu’est-ce qui est nécessaire pour faire le pincement final dans le trans-golgi? De où vient l’énergie pour se faire?
Expliquer la marche à suivre.

A

Une dynamine (GTPase) qui va détacher la vésicule de la membrane (ce qui expose les Rabs et SNAREs en enlevant la clathrine qui va aller être recyclée) et la protéine se tord grâce à l’énergie de l’hydrolyse de GTP.

60
Q

Le transport des hydrolases acides est unidirectionnel. Pourquoi?

A

Le récepteur de mannose6phosphate ne fonctionne pas dans un milieu acide,

Une phosphatase acide va enlever le p du m6p dans le lysosome

61
Q

Définir l’endosome

A

C’est un endroit qui recoit les vésicules de clathrine du golgi et de la membrane plasmique.

62
Q

Que font les endosomes

A

Ils trient les molécules reçues de clathrine et recyclent les récepteurs avant la digestion.

63
Q

Quels sont les deux moyens d’endocytose et expliquer les.

A

La pinocytose: ingestion des molécules solubles en utilisant les puits comme intermédiaires dans la formation de clathrine

L’endocytose par récepteurs: tire profit de la pinocytose grâce aux adaptines

64
Q

L’ingestion des grosses particules nécessite la formation de _____ qui entoure la proie. Définir ce processus

A

Pseudopodes et phagocytose

65
Q

Comment se fait la phagocytose?

A

La cellule se contracte (avec actine et myosine) d’un côté

Cytoplasme de l’autre coté (où se forment les pseudopodes)

Les filaments d’actine forme un filet qui donne une direction au mouvement du cytoplasme (on crée les pseudopodes)

66
Q

Quel organite fait la digestion chez les plantes? Pourquoi?

A

La vacuole, car il n’y a pas de lysosomes

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