Diagnostic moléculaire Flashcards
(110 cards)
1
Q
C’est quoi la première cause identifiable de mort subite chez les jeunes
A
La maladie génétique cardiovasculaire
2
Q
C’est quoi la médecine de précision
A
C’est la médecine personnalisée qui utilise des informations biologiques et des biomarqueurs.
3
Q
C’est quoi la pharmacogénétique
A
C’est la relation et de l’influence du profil génétique d’un patient sur sa réponse aux médicaments. Le choix des médicaments (sélection et la dose) est adapté au profil génétique du patient
4
Q
C’est quoi la oncogénétique
A
C’est les thérapies sont adaptées en fonctions des caractéristiques génétiques de la tumeur et du profil génétique du patient.
5
Q
C’est quoi la cardiogénétique
A
C’est les caractéristiques génétiques du patient servent à guider le traitement et à dépister les membre de la famille à risque
6
Q
C’est quoi un gène
A
C’est l’unité de base de l’hérédité qui représente 2% de notre génome
7
Q
Le génome est encodé par quoi
A
Par les chromosomes nucléaires et mitochondriaux
8
Q
Que sont les chromosomes mitochondriaux
A
Chromosome qui encodent 37 gènes et qui sont transmis par la mère
9
Q
Qu’est ce qui arrive à l’ADN
A
Elle est répliqué lors de la division cellulaire par l’ADN polymérase et sert de matrice pour la transcription en ARN par l’ARN polymérase
10
Q
Que fait l’ARN
A
Elle sert de matrice pour la traduction en protéine par le ribosome
11
Q
Que font les protéines
A
Ils participent à de multiple fonction cellulaires
12
Q
Qu’est ce que le transfert d’information permet
A
Elle permet l’expression du génotype dans le phénotype
13
Q
C’est quoi l’épissage
A
L’ARN est épissé pour former l’ARN messager
14
Q
Le code génétique repose sur quoi
A
Sa repose sur la correspondance des triplets de nucléotides sur l’ARN messager et les aa
15
Q
C’est quoi un génotype
A
C’est l’information codée dans notre génome qui correspond à une composition et séquence génétique spécifique qui est définie par la séquence des deux allèles d’un gène
16
Q
C’est quoi un phénotype
A
C’est la manifestation physique, clinique du génotype
17
Q
C’est quoi un hétérozygote
A
Deux allèle différente
18
Q
C’est quoi un homozygote
A
deux allèle pareille
19
Q
C’est quoi un hémizygote
A
Juste un chromosome
20
Q
C’est quoi la pénétrance
A
C’est le pourcentage d’individus ayant un génotype donné qui présentent le phénotype associé à ce génotype
21
Q
C’est quoi une pénétrance incomplète
A
C’est quand l’individu a le génotype de la maladie, mais l’exprime pas
22
Q
C’est quoi la pénétrance 100%
A
C’est que tous les individus qui ont le génotype on la maladie
23
Q
C’est quoi l’exprésivité
A
C’est la mesure du niveau d’expression d’un génotype au niveau phénotypique
24
Q
Comment fonctionne les maladies autosomique dominante
A
La maladie = un seul allèle muté et si quelqu’un est hétérozygote il est malades, mais si homozygote maladie sévère
25
Comment fonctionne les maladies autosomique récessive
La maladie = un deux allèle muté et si quelqu'un est hétérozygote il est porteurs, mais si homozygote malade
26
C'est quoi l'effet fondateur
C'est une perte de variation génétique qui est fait par un petit groupe qui fonde une nouvelle population
27
C'est quoi l'hérédité mitochondrial
C'est une transmission maternelle non mendélienne, qui arrive lors de la fécondation où le sperme apporte un noyau d'origine paternelle qui va fusionner avec le noyau de l'ovule, d'origine maternelle, mais le cytoplasme est que d'origine maternelle
28
C'est quoi l'hérédité multifactorielle
Dépend de l'érédité et de l'environnement où l'expression d'un certains nombre de caractères est multigénique et multifactorielle selon une distribution normale
29
Que sont les variant génétiques rares
C'est des variant qui peut développé des maladies, qui affectent une énorme ou infime partie de l'ADN, ils sont la source de maladie génétique et peut augmenter ou diminuer la fonction de la protéine encodée
30
Que sont lest types de variant
Variant structuraux, petite insertions ou délétions et changement de nucléotide
31
C'est quoi l'anomalies chromosomiques de nombres
C'est une anomalie affectant le nombre total de chromosomes présents chez un individu
32
C'est quoi une monosomie
C'est une aneuploïdie par défaut, donc absence d'un chromosome
33
C'est quoi une trisomie
C'est une aneuploïdie par excès, donc gain d'un chromosome
34
C'est quoi une délétions
C'est une portion de chromosome manquante ou supprimé
35
C'est quoi une duplication
C'est une portion de chromosome dupliquée, générant du matériel génétique supplémentaire
36
C'est quoi une inversion
C'est une portion du chromosome brisée, tournée tête-bêche et réattachée. le matériel génétique est inversé
37
C'est quoi une insertion
C'est une portion d'un chromosome supprimée d'un chromosome et insérée dans un autre chromosome
38
C'est quoi une translocation
C'est un échange de matériel entre 2 chromosomes non homologues après cassure sur chacun des chromosomes impliqués
39
C'est quoi la mutations ponctuelle faux-sens
C'est un variant qui entraîne le changement d'un codon spécifique d'un aa pour autre aa
40
C'est quoi la mutations ponctuelle non-sens
C'est un variant qui entraîne l'introduction d'un codon stop prématuré
41
C'est quoi la mutations ponctuelle synonyme
C'est un changement d'un nt qui n'entraîne pas de modifications du codon, donc ne change pas l'aa
42
C'est quoi la mutations ponctuelle site d'épissage
C'est un variant qui affecte les sites donneur 5' ou accepteur 3'
43
C'est quoi l'épigénétique
C'est tous facteur pouvant affecter le fonctionnement des gènes sans modification du gènotype
44
C'est quoi le mécanisme épigénétique de la méthylation de l'ADN
C'est une méthylation des dinucléotides CpG. Associée à la répression génique
45
C'est quoi le mécanisme épigénétique de la modifications des histones
C'est une modification au niveau de la queue des histones. associées à la fois à la répression et l'expression des gènes
46
C'est quoi le mécanisme épigénétique de variants localisés au niveaux des histones
C'est un variants qui affectent des régions spécifique dans le génome. associé à une instabilité génomique
47
Les maladies génétique sont associés à quoi
À des variants dans certains gènes spécifiques
48
C'est quoi un cas-index
C'est un diagnostic clinique ou suspecté peut mener à un dépistage génétique pour une recherche de cause génétique
49
Qu'est ce qu'on doit faire quand il y a un résultats positif
Un dépistage en cascade dans la famille pour identifier les individus porteurs et à risque et une prise en charge clinique différentielle selon les résultats de génétique
50
À quoi sert la génétique médicale
diagnostic, prise en charge avec traitement préventifs, détermination risque de récurrence, dépistage en cascade et médecine préventive
51
C'est quoi l'analyse moléculaire
C'est une analyse qui permet d'identifier des modifications dans l'ADN des gènes associés au développement de maladies
52
C'est quoi l'extraction de l'ADN
C'est une méthode qui permet d'isoler l'ADN
53
Que sont les étapes de l'extraction de l'ADN
1. Lyse de la cellule, 2. élimination des protéines, 3. éliminations des autres acides nucléiques et 4. concentrations de l'ADN
54
Comment est ce qu'on contrôle l'extraction
par électrophorèse sur gel d'agarose et par spectrophotométrie ou par fluorescence
55
C'est quoi le séquençage
C'est une méthode qui consiste à déterminer l'ordre d''enchaînement des nucléotides pour un fragment d'ADN donné
56
C'est quoi l'utilité du séquençage
C'est de déterminer la séquence de gènes individuels, de grandes régions, de chromosome ou de génomes entiers
57
Que sont les méthodes de séquençage les plus utilisées dans le domaine diagnostique
Le séquençage direct Sanger et le séquençage en parallèle à haut débit
58
C'est quoi WGS
C'est le séquençage du génome au complet
59
C'est quoi WES
C'est le séquençage de l'exome
60
C'est quoi la cardiomyopathie hypertrophique (CMH)
C'est un épaississement du muscle cardiaque, c'est la 1ère cause de mort chez les moins de 40 ans
61
Que cause la maladie du sarcomère cardiaque
Une perte de l'alignement des myofibrilles
62
Quand est ce que CMH se développe
Peut se développer à tout âge, mais particulièrement à l'adolescence et au début de l'âge adulte
63
C'est quoi la prévalence du CMH
1 individu sur 500 à 1 individu sur 200
64
C'est quoi le mode de transmission du CMH
Autosomique dominant
65
Qu'est ce que la CMH cause
Fatigue, essoufflement à l'effort, angine, palpitations, arythmies, étourdissements, syncopes, œdème aux jambes et mort subite
66
C'est quoi la maladie sarcomérique
C'est un variant pathogéniques dans les gènes qui codent pour le sarcomère cardiaque
67
Qu'est ce qui arrive si pour le CMH une mort subite est considérable
un défibrillateur peut être implanté de façon préventive
68
C'est quoi le syndrome du QT long (SQTL)
C'est une anomalie électriques sur l'électrogramme qui apparaît normalement pendant l'enfance et l'adolescence qui peut causé des risque d'arythmie ventriculaire, de syncope et d'arrêt cardiaque
69
C'est quoi la prévalence du SQTL
1 individu sur 3000 à 1 individu sur 2000
70
C'est quoi le mode de transmission du SQTL
Autosomique dominant
71
Que sont les présentations clinique du SQTL
Allongement du segment QT, présence de symptômes causés par des arythmies ventriculaire et anomalie électriques
72
C'est quoi la canalopathie
C'est un variant pathogénique dans les gènes qui codent pour les canaux potassiques et sodiques: LQT1 et LQT2/KCN = perte de fonction LQT3/ SCN = gain de fonction
73
Comment est ce qu'on confirme SQTL
Près de 30 % des patients ayant un SQTL ont un intervalle QT dans les valeurs de référence. La présence d’un variant causal aide au diagnostic.
74
Que sont les méthodes de préventions du SQTL
défibrillateur, limitation d'activité physiques, arrêt de travail et éviter médicament qui allonge QT
75
C'est quoi le syndrome de Marfan (SM)
C'est un désordre génétique multi systémique qui affecte le tissu conjonctif qui est caractérisé par un dysfonctionnement de la fibrine-1, glycoprotéine de la matrice extra-cellulaire, distribué de façon ubiquitaire
76
C'est quoi la prévalence du SM
1 individu sur 10000 à 1 individu sur 5000
77
C'est quoi le mode de transmission du SM
Autosomique dominant
78
Que sont les présentations clinique du SM
Luette bifide, subluxation du cristallin, grande taille, pectus excavatum ou carinatum, hyperlaxité ligamentaire, anévrisme de l'aorte et dissection aortique, prolapsus de la valve mitrale et pneumothorax spontanés
79
C'est quoi le variant de SM
C'est un variant dans le gène FBN1 qui code pour la fibrilline 1
80
Qu'est ce qui permet d'identifer SM
L’identification d’un variant pathogénique / probablement pathogénique signe le diagnostic du syndrome de Marfan
81
C'est quoi l'étalon d'or pour la génétique
Séquençage du gène FBN1
82
Que cause la mort subite cardiaque
Les anomalies cardiaque non-structurelles correspondent aux arythmies héréditaires et les anomalies cardiaques de structure correspondant aux maladies de la structure de la cellule musculaire cardiaque
83
C'est quoi la prévalence de la mort subite cardiaque
la mort subite cardiaque représente près de 15 à 20 % de tous les décès et près de 4% de ces morts sont inexpliquées
84
C'est quoi l'autopsie moléculaires
C'est une analyse génétique post-mortem qui permet d'identifier des modifications dans l'ADN des gènes associés à la mort subite cardiaque
85
C'est quoi le but de l'autopsie moléculaires
Identifier un (des) déterminants génétiques pouvant expliquer la cause
du décès et identifier les membres de la famille à risque
86
C'est quoi la dyslipidémies
C'est un groupe hétérogène de désordres fréquents du métabolisme du cholestérol
présentant des niveaux circulants anormaux de lipides et lipoprotéines
87
C'est quoi l'hypercholestérolémie familiale (HF)
C'est un désordre génétique du métabolisme des lipides associé à une élévation des concentration du cholestérol LDL (LDL-C)
88
Qu'est ce qu'une concentration élevée de LDL-C cause
Elle entraînent le développement prématuré de maladies cardiovasculaires athérosclérotiques (MCVAS)
89
C'est quoi la prévalence du HF
Hétérozygote 1/250 et homozygote 1/16000 à 1/30000
90
C'est quoi le mode de transmission de HF
Semi-dominant ou autosomique récessif
91
Que sont les présentations clinique du HF
Élévation des niveaux de LDL-C, xanthomes tendineux, au niveau des jointures, xanthélasmas et ars cornéens
92
Comment fonctionne la transmission autosomique récessif
hétéro = porteurs, homo = HFho
93
C'est quoi la particularité de HF au Québec
Effet fondateur = 1/81 à 1/250, LDLR variant majoritaire
94
C'est quoi l'objectif du traitement de l'HF
Abaisser le cholestérol et prévenir/repousser la survenue de MCVAS, avec une diète, statine, ezetimibe, inhibiteur de PCSK9, séquestrant d'acide biliaire et aphérèse plasmatique
95
C'est quoi l'hyperchylomicronémie familiale (CMF)
C'est un désordre génétique lié à une perte d'activité de la lipoprotéine lipase et l'élévation des Tg à jeun secondaire à une accumulation de lipoprotéines riches en Tg
96
C'est quoi le mode de transmission de CMF
Autosomique récessif
97
C'est quoi la prévalence du CMF
1/1000000
98
Que sont les présentations clinique du CMF
Élévation de Tg, xanthomes éruptifs, lipémie rétinienne, douleurs abdominales, hépatomégalie, splénomégalie et pancréatites aigues
99
C'est quoi la particularité de CMF au Québec
Effet fondateur = 1/10000
100
Que sont les traitements de la CMF
diète stricte et thérapies géniques
101
C'est quoi la dystrophie musculaire de Duchenne (DMD)
C'est maladie neuromusculaires qui cause une atrophie et faiblesse musculaires progressive dues à une dégénérescence progressive des muscles squelettiques, lisses et cardiaques et un défaut de la protéine dystrophine qui est exprimé dans les muscles squelettiques
102
C'est quoi le mode de transmission de DMD
Récessif lié à l’X
103
C'est quoi la prévalence du DMD
1/3500
104
Que sont les présentations clinique du DMD
faiblesse musculaires, signes de Gowers, déficience intellectuelle
105
Que sont les variants de DMD
Larges délétions dans le gène DMD, larges duplications et petites insertions/délétions ou SNPs
106
C'est quoi le gène DMD
C'est le plus long gène humain et présentent une grande variété de
variants
107
C'est quoi la fibrose kystique (FK)
C'est une maladies autosomique récessives fatales qui cause une désordre multi systémique qui affecte principalement les systèmes pulmonaire, gastrointestinal et reproductif qui est caractérisée par un dysfonctionnement du canal chlore CFTR qui provoque une augmentation de la viscosité du mucus et son accumulation dans les voies respiratoires et digestives
108
C'est quoi la prévalence du FK
1 sur 2000 à 3000
109
Que sont les présentations clinique du FK
Troubles respiratoire, production insuffisante d'enzymes digestives pancréatique, insuffisance du pancréas exocrine, méconium iléus et obstruction de l'iléus distal, maladies biliaire et infertilité
110
C'est quoi la base moléculaires de FK
1600 mutation du gène CFTR qu9i code pour la protéine CFTR
