לחלבון DNA- פרק 6 - איך תאים קוראים את הגנום: מ

Question 1

איך התא מזהה
mRNA
משל?

Answer 1

בזכות החלבונים שאין בה
כמו
נוכחות 
snRNA
מעידה על RNA
שעדיין בתהליכי ספלייסינג

Question 2

מה קורה לחלקי
RNA
שלא מיועדים לייצוא ולתרגום?

Answer 2

מעוכבים בגרעין
בו הם נגרטים ע"י קומפלקס 
EXOSOME
שבתוכו מלא אקסונוקליאזות
שהן בכיווניות של 
5'
ל-
3'

Question 3

איפה אפשר לפרק חלקי
RNA
בתא?

Answer 3

ב-EXOSOME
ע"י אקסונוקליאזות
5'
ל
3'

Question 4

מי אחד החלבונים שנקשר ל-
mRNA
עם הגחתה מהפולימראז?

Answer 4

hnRNP
חלק מהחלבונים האלו פותחים
את מבנה ה-
hairpin
כדי לאפשר ספליסינג

Question 5

איזה מול’ עוברות חופשי דרך ה-

NPC?

Answer 5

קטנות מ-
60,000
קילודלתון

Question 6

מה צורת ה-
RNA
הכי נפוצה בתא?

Answer 6

rRNA
הכי נפוץ בתא
80%

Question 7

מי מסנתז
RNA
ריבוזומלי
באאו’ \ פרו’?

Answer 7

פרו’-
כולם ע”י אותו פולימראז

באאו’-
ריבוזומלי מסונתז ע”י
רנ”א פולימראז 1

Question 8

כמה תתי סוגים של
rRNA
יש באא’?

Answer 8

4 סוגים

3 מהם נוצרים מפרקורסור יחיד
ע”י רנ”א פולימראז 1

הרביעי
5S
ע”י רנ”א פולימראז 3

Question 9

מי עושה מודיפיקציות על הפרקורסור של רנ”א ריבוזומלי?

Answer 9

הכוונה ע"י 
Guide RNAs
שממקמים את ה-
snoRNAs
בגרעינון

Question 10

האם גודל הגרעינון הוא אחיד בין התאים?

Answer 10

לא
הוא משתנה
בהתאם לכמות החלבון שהתא צריך לייצר

אפילו משתנה באותו התא

Question 11

איפה מורכב
U6-snRNP
ולאיזה תהליך הוא קשור?

Answer 11

קשור לספלייסינג

מורכב בריבוזום

Question 12

איזה חלבונים מורכבים בריבוזום?

Answer 12

טלומאראז

SNP

tRNA

Question 13

איזה גופים אפשר למצוא בגרעין התא?

Answer 13

גרעינון
Cajal Bodies
Interchromatine Cluserts (“speckles”)

הסברה היא שמטרתם של גופים אלו היא לצרף יחד רכיבים, בצורה מהירה מכרגיל

Question 14

Cajal Bodies

מה זה?

Answer 14

אתרים שבהם
snRNP
snoRNP
עוברים הבשלה סופית

בהם ממוחזרים
snRNP

Question 15

Interchromatine Cluserts ("speckles")
מה זה?

Answer 15

מאגרים של 
snRNPs
בשלים ושל רכיבי עיבוד של 
RNA
מוכנים לשימוש 
לצורך יצירת 
mRNA

Question 16

איפה מורכב
U4/U6 SnRNP
ומה המטרה של כך?

Answer 16

מתרחש בגופי כחל

זה קורה במהירות גדולה פי 10
מאשר בכלל הגרעינון

Question 17

איך מונעים תרגומן של מול’
mRNA
פגומות?

Answer 17

ה-
5’-CAP
וזנב פולי A
מסמנים שזאת מול’ תקינה לתרגום

Nonsense mediated mRNA Decay
מונע טרמינציה מוקדמת

Question 18

Nonsense mediated mRNA Decay

מה זה?

Answer 18

במצב תקין, כאשר קצה 5’
מבצבץ החוצה מחוץ לגרעין
הריבוזום פוגש ומתחיל לתרגם אותה

בכל נק’ אקסון הריבוזום מסיר קומפלקס חלבוני המצוי שם שנקרא
EJC

בד"כ באקסון האחרון אין עוד חלבונים
אם הריבוזום מגיע לקודון 
STOP
כאשר יש עוד
EJC 
על ה-
mRNA
סימן שזהו קודון טרמינציה שגוי
והמול' נגרטת

Question 19

איזה כוח מקדם קיפול תקין?

Answer 19

החלבון מעוניין לקבל קונפורמציה בעלת האנרגיה החופשית הנמוכה ביותר

Question 20

מה גורם לחלבון לקבל צורה תקינה?

Answer 20

חלבון מקבל את צורתו הקומפקטית כאשר שיירים הידרופוביים מתכנסים אל תוך פנים
הליבה. בנוסף, אינטראקציות לא-קוולנטיות רבות בין חלקי המולקולה מעניקות לה את
צורתה.

Question 21

Hsp60

פרטי

Answer 21

חלבונים היוצרים מבנה של חבית (צ’פרונין) שמהווה תא בידוד לצורך
קיפול חלבונים
התא מדופן בח”א הידרופיליות, ונסגר במכסה תוך צריכת
ATP

Question 22

Hsp70

פרטי

Answer 22

מונומרים שנקשרים לשרשרת של 4-5 ח”א הידרופוביות. כשהם קושרים
ATP
החלבון משתחרר ומקבל צ’אנס להתקפל כראוי

Question 23

מי מבין השאפרונים פנוי קודם?

Answer 23

HSP70
ואחריהם
HSP60

Question 24

איפה מצוי פרוטאוזום ובאיזה כמות?

Answer 24

מצוי בעותקים רבים בציטוזול ובגרעין, 
והוא גם דואג לגרוט חלבונים לא -תקינים שנכנסו ל-
ER
למרות שהוא לא נמצא ב-
ER

Question 25

מה מידת הפרוססיביות של הפרוטאוזום?

Answer 25

לפרוטאוזום פרוססיביות גבוהה. הסובסטרט שלו נשאר קשור אליו עד שהוא הופך כולו לפפטידים קצרים.

Question 26

מה מבנה הפרוטאוזום?

Answer 26

``` הליבה: 4 טבעות שכ"א מהן היא מחומשת זו יח' 20S בפרוטאוזום ``` המכסה: יח' 19S עשוי טבעת בעלת 6 יח'

Question 27

מה תפקיד המכסה של הפרוטאוזום ואיך הוא פועל?

Answer 27

``` הטבעת של מכסה הפרוטואוזום פותחת את החלבון לפני הכנסתו, תוך הידרוליזה של ATP ה-CAP הוא סוג של unfoldase ```

Question 28

מה הסימון התאי לפירוק בפרוטואוזום?

Answer 28

שרשרת יוביקוויטין המחוברת לשייר | ליזין 48

Question 29

מה קובע את כמות החלבון בתא?

Answer 29

מה שקובע את כמותו של כל חלבון בתא, זה האיזון בין קצב הסינתזה שלו לבין קצב פירוקו.

Question 30

איזה בקרה יש על שליחת חלבונים לפרוטואוזם?

Answer 30

הפעלתו של E3 יוביקוויטין ליגאז ע"י פוספורילציה \ ע"י קשירת מולקולה יצירת סמן לדגרדציה בחלבון עצמו ביקוע קשר בפפטיד וחשיפת קצה N טרמינלי המזוהה במיוחד על ידי E3

Question 31

מה השם המלא של E3 | או מה תפקידו?

Answer 31

E3 Ubiquiton Ligase

Question 32

איך אפשר להפעיל את | E3 Ubiquiton Ligase

Answer 32

פוספורילציה או קשירת מול' ל-E3 כמו למשל זרחון APC שמשמיד ציקלינים

Question 33

איך אפשר לסמן חלבון לדגדרציה?

Answer 33

( ע"י זרחון, או חשיפת אזור שבו יש סימן | לדגרדציה)

Question 34

איזה קצה במיוחד מזוהה ע"י | E3?

Answer 34

קצה N | טרמינלי