Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

Bioorganinė chemija > DNR > Flashcards

DNR Flashcards

(48 cards)

Start Studying
1
Q

Kas yra genas?

A

u should know that

DNR dalis, koduojanti biologiškai aktyvaus produkto sintezę.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Fosfodiesterinis ryšys:

A

Ryšys, kuriuo sujungta nukleotidų seka, skaitoma 5’ - 3’ kryptimi.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

DNR pirminė struktūra:

A

deoksiribonukleotidai, sujungti 3’ - 5’ fosfodiesteriniais ryšiais, seka.
Tai nuoseklus monomerų išsidėstymas polinukleotidinėje grandinėje.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

DNR pirminės sekos nustatymo būdai

A

Klasikiniai - cheminis (Maxam-Gilbert) ir fermentinis (Sanger);

Naujos kartos sekoskaita: fermentinių/ biofizikinių aukšto našumo metodų kombinacijos;

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

DNR pagal Watson ir Crick modelį:

A
  1. Dvi polinukleotidinės grandinės. Antilygiagrečios.
  2. Bazės nukreiptos į spiralės vidų. Bazių plokštumos lygiagrečios viena su kita ir statmenos į spiralės ašį.
  3. A-T; G-C.
  4. Spiralės žingsnis - 3,4 nm.ž, nuotolis tarp bazių plokštumų 0,34 nm. Spiralės žingsnyje telpa 10 bazių porų.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Kiek vandenilinių ryšių sudaro timinas su adeninu?

A

2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Kiek vandenilinių ryšių sudaro citozinas su guaninu?

A

3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Spiralės stabilumą palaikantys veiksniai:

A
  1. Vandeniliniai ryšiai tarp bazių;
  2. Hidrofobinė sąveika
  3. Stekingo sąveika - jėgos papildomai stabilizuojančios grandinę
  4. Baziniai baltymai
  5. Dvikrūviai katijonai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

G-quadruplex svarba:

A

būdinga g turtingoms sekoms, stabilizuoja vienvalenčiai metalo jonai, gali susidaryti iš 1 ar daugiau skirtingų grandinių, svarbus telomerose, genų promotoriuose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

A formos DNR sukimas yra:

A

Dešininis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Kiek laipsnių pasuktos A formos DNR bazių porų plokštumos, dvigubosios grandinės ašies atžvilgiu?

A

20

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Kur gali būti aptinkama A formos DNR?

A

Gram-teigiamų bakterijų sporose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Kokio sukimo yra Z formos DNR?

A

Kairiojo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Kokius griovius turi Z formos DNR?

A

Gilų mažąjį griovį, o didžiojo nėra.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Kiek laipsnių apverstos Z formos DNR poros?

A

180

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Ko neturi žiedinė (ciklinė) DNR molekulė?

A

laisvų 5’ ir 3’ galų.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Ko reikia, kad susidarytų superspiralizuota DNR?

A

fermentai topoizomerazės, ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Kaip vadinama E. coli topoizomerazė, katalizuojanti superaspiralizaciją?

A

DNR giraze

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Kas yra nukleosoma?

A

DNR ir histonų kompleksas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Kaip vadinamas reiškinys, kuomet natyvios DNR sugertis yra mažesnė, negu denatūruotos DNR?

Study These Flashcards
A

Hiperchrominiu efektu

21
Q

Kas vadinama DNR lydimosi temperatūra Tm?

Study These Flashcards
A

Temperatūra, kuriai esant pusė DNR molekulės yra viengrandė, o kita pusė dvigrandė.

22
Q

Kodėl DNR yra timinas?

Study These Flashcards
A

Jei DNR būtų uracilas, jis DNR dvigubėjimo metu hibridizuotųsi su adeninu.
Deamininti citozinai taip pat hibridizuotųsi su adeninu.
Genetinis kodas redukuotųsi iki 2 nukleotidų

23
Q

Kodėl DNR yra timinas iš bazių perspektyvos?

Study These Flashcards
A
  1. Darytų įtaką G-C bazių porų kiekiui
  2. Ilgainiui visos G-C bazių poros būtų prarastos
24
Q

Kas gali blokuoti bazių porų susidarymą?

25
Kas įvyksta purinų žiede, jiems reaguojant su nesočiasiais aldehidais?
Susidaro tretinis aminas prie pirmo N atomo purino žiede, tada prie jo susidaro OH grupė, o pakaitas R lieka apačioje. (Gali būti ir atvirkščiai)
26
Kokie yra DNR pažeidžiantys junginiai? (ALKILINANTYS)
Dimetilnitrozaminas, dimetilsulfatas, azoto garstyčios, 5-adenozilmetioninas
27
Kokie yra DNR pažeidžiantys junginiai? (AZOTO R. PREKURSORIAI)
NaNO2, NaNO3, nitrozaminas
28
Busulfano ypatybės:
1. Naudojamas gydyti leukemijai 2. Labai toksiškas 3. Pagrindinis veikimo mechanizmas - alkilinimas ir crosslinking
29
Kas yra ftakvuilozidas?
Kancerogenas, aptinkamas paparčio lapuose, sukelia virškinimo trakto auglius.
30
Kas yra alfatoxin b1?
Natūralus, labai stiprus kancerogenas, gaunamas iš aspergillus flavus.
31
Kokias funkcines grupes būtina blokuoti oligodeoksiribonukleotidų cheminėje sintezėje?
-NH2 grupes heterociklinėse bazėse (A, C, G) - deoksirobozės 5' arba 3' OH grupes - fosfatus (monoesteriuose ir diesteriuose)
32
Kokie turi būti reikalavimai oligodeoksirbonukleotidų sintezės funkcinių grupių blokuotėms?
- selektyviai įvedamos - stabilios cheminės sintezės metu - selektyviai pašalinamos
33
Kokie yra oligodeoksiribonukleotidų sintezės būdai?
1. Fosfodiesterinis metodas 2. H-fosfonato/fosfatotriesterinis metodas 3. Fosfotriesterinis metodas 4. Fosfitinis/ fosforamiditinis metodas
34
Ko reikia fosfodiesterinio metodo sintezei?
Blokuoto nukleozido/nukleotido su laisva 3'-OH grupe; Blokuoto nukleotido su laisva 5' fosfatine grupe.
35
Fosfodiesterinio metodo (khorana) sintezės blokuotės?
-Nukleozidinio komponento 5' -OH grupei - p-dimetoksitrifenilmetanas -Nukleotidinio komponento deoksiribozės 3' -OH grupė acetilinama: -CO-CH3 -Heterociklinių bazių (A, C, G) amino gr. acilinamos: CO-CH(CH3)2
36
Fosfodiesterinio (khorana) metodo sintezės aktyvatoriai?
- DCC -TPS -MS
37
Kokia kryptimi ilginama oligonukleotidinė grandinė?
5'->3' kryptimi
38
Kokie yra fosfodiesterinio metodo (khorana) trūkumai?
- grandinės šakojimasis, pašalinės reakcijos su fosfato liekana - ilginant grandinę kiekvieno etapo metu gaunamos vis mažesnės išeigos -brangu, daug laiko ir reagentų sunaudoja
39
Kaip pašalinamos tritilinės blokuotės?
20% CH3COOH arba CF3COOH
40
Kaip pašalinamos acetilinės blokuotės?
konc. NH3 (aq)
41
Kokie junginiai ir kodėl naudojami fosfitiniame/fosfodiamiditiniame metode?
III valenčio fosforo junginiai, kurie yra labai aktyvūs, todėl tarpnukleotidinis ryšys susidaro greitai ir efektyviai.
42
Kokia bazė naudojama nukleotidiniam komponentui pasigaminti?
N-etil-N,N-diizopropilaminas (Hunig bazė)
43
Kietafazės sintezės privalumai:
1. Lengva atskirti sintetinamą oligonukleotidą nuo reakcijos mišinio 2. Galima naudoti perteklius reag ir kondensuojančio reag. 3.Galima atlikti viską viename inde 4. Galima automatizuoti
44
Kas kietafazėje sintezėje prijungta prie pirmojo nukleozido?
5' OH pozicijoje prijungta DMT; 3' OH pozicijoje prijungta CPG (kietas nešiklis)
45
Kam kietafazėje sintezėje reikalinga "capping" reakcija, kurios metu vyksta acilinimas?
Tam, kad nesureagavę nukleotidai nedalyvautų tolimesnėse sintezės reakcijose. Taip pat pašalina pašalinę r. Guanozino depurinizaciją.
46
Kokie reagentai gali būti naudojami H-fosfonato/fosfatotriesteriniame metode nukleozidų sujungimui?
Pivaloilchloridas, 2,4,6-triizopropilbenzensulfonilchloridas (TPS-Cl)
47
Sintetinių oligonukleotidų panaudojimas?
Pradmenys DNR padauginimui PGR ar sekoskaitoje; Mutacijų įvedimui genų inžinerijos būdu Kaip analitiniai įrankiai genų terapijai genomų rekonstrukcijai
48
Fotolitografinės DNR sintezės principas?
Didelio kiekio oligonukleotidų sintezė, šviesos kontroliuojama, vyskta per fotolitografinę kaukę.

Bioorganinė chemija (2 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions