Nukleorūgštys I

Question 1

Kokia pentozių forma vyrauja nukleotiduose?

Answer 1

beta-furanozės forma

Question 2

Kokios dažniausiai konformacijos yra ribofuranozės žiedas?

Answer 2

voko

Question 3

Kokią konformaciją gali įgyti ribofuranozės žiedas?

Answer 3

twisted

Question 4

Kaip išsidėstę atomai ribofuranozės voko konformacijoje vienoje plokštumoje?

Answer 4

2’ endo ir 3’ endo

Question 5

Kiek ribofuranozės twisted konformacijoje yra atomų vienoje ploštumoje?

Answer 5

3. 2’ endo 3’ exo ir 2’ exo ir 3’endo

Question 6

Kokie atomų išsidėstymai aptinkami ribofuranozės žiedo konformacijose RNR ir A formos DNR? B formos?

Answer 6

RNR ir A formos DNR - North (3’endo), B formos DNR - South (2’endo)

Question 7

Koks ryšys yra nukleoziduose?

Answer 7

beta-N-glikozidinis

Question 8

Ar tiesa, kad nukleozidų struktųroje esančios heterociklinės bazės sugeria UV šviesą?

Answer 8

Taip (Sugertis priklauso nuo tirpalo pH)

Question 9

Kokios formos nukleozidų anomerai randami gamtoje?

Answer 9

beta

Question 10

Kokia konformacija vyrauja nukleorūgštyse?

Answer 10

Anti, dėl sterinių trukdžių

Question 11

Kas yra ciklinis nukleotidas?

Answer 11

Kuriuose fosforo rūgštis yra esterifikavusi monosacharido 5’ ir 3’ hidroksigrupes.

Question 12

Kuris nukleotidas labiausiai absorbuoja UV?

Question 13

Kiek tautomerų turi adenozinas?

Answer 13

5

Question 14

Kiek tautomerų turi guanozinas?

Answer 14

4

Question 15

Kiek tautomerų turi uridinas?

Answer 15

3

Question 16

Kiek tautomerų turi ksantozinas?

Answer 16

4

Question 17

Kiek tautomerų turi citodinas?

Answer 17

5

Question 18

Kiek tautomerų turi oksitiaminas?

Answer 18

3

Question 19

Fiziologinėmis sąlygomis nukleobazės yra..?

Answer 19

Neutralios

Question 20

Koks nukleotidinis kofaktorius svarbus aktyvuojant karboksirūgštis, riebalų rųgščių sintezei ir energijai išgauti?

Answer 20

KoA

Question 21

Kurioje pozicijoje pirimidino žiede prijungiamas halogenas vykdant halogeninimą? (vandenyje)

Answer 21

-5

Question 22

Kiek bromo atomų prijungiama pirimidino brominimo reakcijoje?

Answer 22

2

Question 23

Halogeninimas vyksta lengviau su:
a) Guanozinu
b) Adenozinu

Answer 23

a) Guanozinu

Question 24

Kurioje padėtyje purinų žiede prijungiami halogenai?

Answer 24

C8 (ir jie čia gali būti pakeisti kitais pakaitais)

Question 25

Kokie reikalavimai keliami nukleozidų nitrinimui?

Answer 25

1. Aukšta temperatūra; 2. Angliavandenių dalies hidroksigrupės turi būti apsaugotos nuo oksidacijos.

Question 26

Nuo ko labiausiai priklauso pirimidino ir purino darinių metilinimo reakcijos su diazometanu?

Answer 26

Nuo reakcijos sąlygų

Question 27

Kaip mažėja nukleozidų polinkis sąveikauti su diazometanu vandens-eterio tirpaluose?

Answer 27

guanozinas=uridinas>citidinas>adenozinas

Question 28

Kokie dar reagentai be diazometano naudojami pirimidino, purino (bazių) metilinimui?

Answer 28

metilo jodidas, dimetilsulfatas

Question 29

Kurie nukleotidai esant neutralioje terpėje metilinami, o kurie nesimetilina?

Answer 29

Reaguoja: guanozinas, adenozinas ir citidinas. Nereaguoja: uridinas, timidinas

Question 30

Kuo skiriasi nukleozidų acilinimas švelniomis ir intensyviomis sąlygomis?

Answer 30

Švelniomis sąlygomis - acilinasi tik aminogrupės; Intensyviomis sąlygomis - ne tik heterociklo amino grupė bet ir heterociklinis azotas. Esant dideliam anhidrido pertekliui acilinasi ir ribozės -OH grupės.

Question 31

Kaip acilinasi ribozės hidroksi grupės, naudojant (CH3CO)2O perteklių ir naudojant ekvimoliarinį anhidrido kiekį?

Answer 31

Naudojant perteklių - acilinamos visos pentozių hidroksigrupės: 5', 3', ir 2'. Naudojant ekvimoliarinį - acilinama tik 5'.

Question 32

Kas susidaro nukleotidų acilinimo metu?

Answer 32

Anhidridas su fosfato grupe, kuris lengvai hidrolizuojasi.

Question 33

Nukleozidų deacilinimo palyginimas, esant amoniakui ir stipriai šarminėje terpėje. Kas atsitinka su ribozių esteriniais ryšiais tomis pačiomis sąlygomis?

Answer 33

Esant NH3, nukleozidų amido jungtis lengvai nutrūksta, o šarminėje terpėje (pH>12) išlieka stabili. Ribozės esterinius ryšius lengvai suardo tiek šarmai, tiek amoniakas.

Question 34

Hidrinimas pirimidino nukleoziduose?

Answer 34

Lengvai hidrinasi, gaunamas 5,6-dihidro darinys, katalizatoriai: Rh/Al2O3/Pt/Pd

Question 35

Kaip hidrinasi purino nukleozidai?

Answer 35

Su Rh/Al2O3/Pt/Pd nesihidrina, u dumb hoe look at the structure

Question 36

Kaip vyksta nukleozidų reakcijos su nitritine rūgštimi?

Answer 36

Nukleozidai turintys amino grupių heterocikle reaguoja su HNO2, kurios metu susidaro diazonio druska, kuri lengvai disocijuojasi, vandeninėje terpėje sudarydama hidroksi darinį.

Question 37

Kokie yra pagrindiniai glikozidinio ryšio sudarymo ypatumai?

Answer 37

1. Bazių regioselektyvumas, alpha, beta anomerų santykis. 2. Naudojant elektronų donorines grupes, pvz acetil, dominuos beta anomeras. Tai neveikia su deoksiriboze. 3. Norint gauti alpha anomerus, reikia naudoti nukreipiančias pap. reakcijas.

Question 38

Vieno puodo reakcija

Answer 38

1. Sililintos heterociklinės bazės yra jautrios hidrolizei 2. TFA, TMSCl ir HMDS derinys sukuria trimetilsililtrifluoracetatą in situ, kuris atlieka tiek heterociklo sililinimą, tiek vėlesnį jo sujungimą su cukrumi.

Question 39

Kas vyksta transglikozilinimo reakcijos metu?

Answer 39

Cukraus fragmentas perkeliamas nuo vienos heterociklinės bazės prie kitos. Cheminis/fermentinis Išeiga priklauso nuo termodinaminės pusiausvyros.

Question 40

Nukleotidų sintezės trūkumai?

Answer 40

Nukleozidų fosforilinimas yra Se reakcija, o fosforo rūgštis ar kt. fosforo jung. nėra elektrofiliški, todėl fosfato molekulėje įvedami pakaitai, kurie atitraukia elektronus.

Question 41

Kaip vyksta nukleozidų fosforilinimas halogenų anhidridais (POCl3)?

Answer 41

Tarpinis reakcijos produktas - POCl2 (kuomet atskyla HCl), šis produktas hidrolizuojamas atskylant likusiems chlorams prie fosfato. Būtina blokuoti ribozės hidroksi grupes. Yra metodas ir be blokuočių - su trimetil/etil fosfatu.

Question 42

Kokia yra trialkil fosfato įtakafosforilinimo reakcijai?

Answer 42

Susidaro nukleozido kompleksas, kurio 5' OH grupė tampa labiau nukleofiliška. Propil ir didesnės grupės trukdo šio komplekso susidarymui.

Question 43

Sintezė per cycloSal tarpinį produktą

Answer 43

Naudojami modifikuoti salicilo rūgšties esteris/anhidridas; Fosforo jung. yra V ar III valentingumo.

Question 44

Tiesioginiam fosfato prijungimui prie nukleozido reikia:

Answer 44

prie 5' grupės prijungti gerai atskylančią grupę pvz toluensulfonilo TsO. Reakcijos išeiga žiauriai mid.

Question 45

Kaip vadinami fermentai, katalizuojantys nukleozidų fosforilinimo reakcijas?

Answer 45

Kinazėmis. Jos fosforilina tik 5' OH gr.

Question 46

Kas naudojama kaip fosfato grupės donoras fermentinėje nukleozidų fosforilinimo sintezėje?

Answer 46

ATP (dažniausiai)