DNR replikacija Flashcards

1
Q

centrinė genetikos dogma

A

dnr replikacija > transkripcija > transliacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

DNr replikacija -

A

procesas, kurio metu iš vienos originalios dnr molekulės susidaro dvi identiškos dnr kopijos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

dvigrandininės dnr komplementarumo pagrindas

A

AT/GC taisyklė. bazes jungia vandeniliniai ryšiai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

DNR polimerazė katalizuoja

A

fosfoddiesterinės jungties susidarymą tarp prijungiamo dezoksinukleozidtrifosfato
vidinio fosfato ir ankstesniojo
dezoksinukleotido pentozės 3’-OH grupės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

vykstant dnr polimerazės reakcijai, du paskutinieji nukleotido fosfatai yra

A

atpalaiduojami pirofosfato forma PPi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

kurprasideda bakterijų dnr sintezė

A

replikacijos pradžioje (ori sritis)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kaip vyksta dvikryptė sintezė

A

dnr sintezė vyksta į priešingas chromosomos puses nuo replikacijos pradžios

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

kada baigiasi bakterijų dnr sintezė

A

kai replikacinės šakutės susitikinka priešingoje bakterinės chromosomos pusėje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kas yra oriC

A

dnr replikacijos pradžia E.coli bakterijose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

trys sekos, randamos oriC srityje, reikalingos jos funkcionavimui:

A
  • AT turtingas regionas
  • DnaA dėžutės sekos
  • GATC metilinmo regionas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

ką skatina dnaA baltymų prisijungimas prie dnaA dėžutės regiono

A

skatina didelio dnaA baltymų komplekso formavimąsi (20-40 dnaA baltymo molekulių)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

ką skatina HU ir IHF baltymų prisijungimas

A

skatina DNR regiono apsivyniojimą aplink dnaA baltymų kompleksą; dėl šios priežasties atsiskiria komplementariosios grandinės ties AT turtingu regionu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

kaip dnaB baltymas prijungiamas prie AT regiono?

A

dnaA ir dnaC baltymų pagalba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

dnaB sudaryta iš //// ir naudoja ////

A

šešių subvienetų ir naudoja ATP energiją

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

ką daro praimazė

A

sintetina trumpus RNR pradmenis, kurie inicijuoja dnr sintezę

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

dnr helikazė + praimazė =

A

praimosoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

ką daro ssb baltymas

A

jungiasi prie viengrandininės dnr ir laiko svi grandines išsiskyrusias

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

ką daro dnr polimerazė I

A

pašalina rnr pradmenis ir užpildo susidariusius tarpus dnr

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

kokį aktyvumą turi dnr polimerazė I

A

5’-3’ egzonukleazinį aktyvumą

20
Q

ką daro dnr ligazė

A

katalizuoja fosfodiesterinės jungties susidarymą, tokiu būdu sujungdama dnr fragmentus

21
Q

ką daro topoizomerazė

A

keliauja prieš helikazę ir atpalaiduoja superpiralizuotą dnr

22
Q

dnr polimerazės I sandara ir funkcija

A

sudaryta iš vieno polipeptido.
pašalina RNR pradmenis ir pakeičia juos DNR

23
Q

dnr polimerazės III sandara ir funkcija

A

sudaryta iš 10 skirtingų subvienetų. Jų kompleksas vadinamas DNR pol III holoenzimu.
alfa subvienetas sintetina DNR

24
Q

DNR pol II, IV, V funkcija

A

dnr reparacija ir pažeistos dnr replikacija

25
dnr pol III beta subvienetas yra
žiedo formos ir vadinamas prisitvirtinančiu baltymu
26
y subvnt reikia
beta subvnt prisikabinti prie dnr, vadinamas pritvirtinančio baltymo pakrovėju
27
δ, δʹ, ψ subvienetų reikia
optimaliai alfa ir beta subvnt funkcijai palaikyti
28
jei trūksta beta subvieneto, tai
DNR pol III nukrenta nuo DNR šabloninės grandinės po to, kai polimerizuojama keliasdešimt nukleotidų. Polimerizacijos greitis ~ 20 nukleotidų per sekundę
29
jei yra beta subvienetas, tai:
DNR pol III išsilaiko ant šabloninės grandinės tol, kol yra polimerizuojama iki 50,000 nukleotidų. Reakcijos greitis yra ~ 750 nukleotidų per sekundę
30
ką daro baltymas tus
jungiasi prie ter sekų ir gali sustabdyti replikacijos šakučių judėjimą
31
kas yra katenanai
po dnr replikacijos gaunamos dvi persipynusios žiedinės molekulės. tai trumpalaikė dnr replikacijos struktūra
32
kas atskirias katenanus
dnr topoizomerazės II
33
ką daro DAM metilazė
atpažįsta5’-GATC-3’ sekas ir prijungia metilo grupę prie adenino bazės
34
kas yra ARS
dnr replikacijos pradžia mielėse
35
kas lemia dnr replikacijos pradžią gyvūnuose
chromatino struktūra ir baltymų modifikacijos
36
kas vyksta G1 fazės metu
formuojasi prereplikacinis kompleksas preRC
37
kas yra preRC susirinkimo ir dnr replikacijos inciatorius
pradžios atpažinimo kompleksas ORC
38
kokių baltymų prisijungimą skatina ORC
Cdc6, Cdt1, MCM helikazės
39
kas vyksta S fazės metu
preRC tampa aktyvia replikacijos sritimi dėl preRC fosforilinimo
40
kas vyksta dėl preRC fosforilinimo
- iš komplekso atsipalaiduoja Cdc6, Cdt1 ir ORC -inicijuojamas papildomų replikacijos veiksnių bei DNR polimerazių susirinkimas - MCM helikazė pradeda judėti dviem kryptymis, vyksta dvikryptė DNR replikacija
41
ką daro eukariotų y dnr polimerazė
dalyvauja mitochondrijų dnr replikacijoje
42
ką daro alfa, e, delta dnr polimerazės
dalyvauja branduolio dnr replikacijoje
43
alfa dnr polimerazės funkcija
sintetinti trumpą RNR-DNR pradmenį (10 RNR nukleotidų ir 20-30 DNR nukleotidų)
44
ε (epsilon) DNR polimerazė atsakinga už
pirmaujančios DNR grandinės sintezę
45
δ (delta) DNR polimerazė atsakinga už
vėluojančios DNR grandinės sintezę
46
Eukariotuose RNR pradmenys pašalinami
su flap endonukleaze