Final - Chapitre 9 - Régulation eucaryote

Question 1

la transcription peut être régulée à tous les niveaux… l’étape la plus sensible est

Answer 1

l’initiation de la transcription

Question 2

comme chez les procaryotes, les protéines régulatrices sont des … et des …. de la transcription

Answer 2

répresseurs et activateurs

Question 3

v ou f, les séquences régulatrices sont homogènes chez l’homme

Answer 3

faux, certaines proches, certaines loin

Question 4

v ou f, les actions des protéines régulatrices ne sont pas complexifiées par des caractéristiques additionnelles des cellules et des gènes eucaryotes

Answer 4

faux, sont complexifiées

Question 5

v ou f, chez les eucaryotes, les sites de liaison des régulateurs de transcription ne sont pas nécessairement distribués de manière homogène sur le promoteur

Answer 5

vrai

Question 6

décris enhancer

Answer 6

séquence d’ADN qui fixe des facteurs régulateurs de transcription, a pour conséquence d’augmenter la transcription de gènes situés en aval ou en amont. Les enhancers peuvent agir à une grande distance des gènes

Question 7

décris isolateur

Answer 7

élément spécifique d’ADN contrôlant l’activation des activateurs. Situé entre un enhancer et un promoteur, un isolateur inhibe l’activation du gène induite par l’activateur

Question 8

lors de l’analyse du promoteur de Flowering Locus T, l’analyse par délétion ou ajout de séquences régulatrices permet quoi

Answer 8

de mieux comprendre les fonctions des promoteurs et de les délimiter

Question 9

afin de pouvoir étudier les séquences régulatrices, on utilise les gènes rapporteurs… c’est quoi

Answer 9

gènes qui codent les protéines dont la présence se mesure facilement - remplacement de la région codante par une enzyme (compose lumière, composé coloré, détectable par les Ac)

Question 10

v ou f, le gène rapporté doit être familier au génome de l’organisme modifié

Answer 10

faux, doit être étranger

Question 11

si on ajoute une étiquette à une protéine, qu’est-ce qu’on observe

Answer 11

la protéine de fusion

Question 12

les activateurs et les répresseurs sont modulaires, composés d’un…

Answer 12

domaine liant l’ADN et d’un domaine d’activation ou d’inhibition

Question 13

qu’est-ce que Gal4

Answer 13

active la transcription des enzymes nécessaire au métabolisme du galactose chez la levure

Question 14

que se passe-t-il si on lie seulement le premier 1/3 N-terminal de Gal4?

Answer 14

La protéine produite lie normalement l’ADN, mais n’active pas la transcription

Question 15

à quoi sert le domaine de liaison à l’ADN dans les protéines régulatrices

Answer 15

cibler la région activatrice de la protéine sur le promoteur

Question 16

les eucaryotes ont différents domaines capables de reconnaitre l’ADN, la majorité est formée …

Answer 16

d’hélice qui s’insère dans le sillon majeur (comme hélice-coude-hélice bactérienne)

Question 17

homéodomaine

Answer 17

constitué de plusieurs hélices : une reconnait la séquence d’ADN dans le sillon majeur et les autres servent au bon positionnement sur la charpente

forme souvent des hétérodimère

En fonction du contexte cellulaire et des protéines partenaires, les homéoprotéines peuvent agir comme des activateurs ou des répresseurs de la transcription. Lorsqu’elles se lient à l’ADN, elles influencent l’activité des ARN polymérases et d’autres protéines impliquées dans la transcription.

Question 18

le doigt de zinc

Answer 18

utilise un atome de zinc pour stabiliser l’hélice alpha qui s’insère dans le sillon majeur de l’ADN

Question 19

concernant le doigt de zin, il fait des liaisons avec quels aa

Answer 19

cystéine et histidine - modifie la structure 3D de la protéine régulatrice

Question 20

v ou f, une protéine régulatrice peut contenir plusieurs doigts de zinc les unes à la suite des autres… allongeant d’autant la séquence d’ADN reconnue

Answer 20

vrai

Question 21

v ou f, il y aucun autre motif que le doigt de zinc qui utilise le zinc

Answer 21

faux, d’autres motifs utilisent le zinc, mais toujours pour stabiliser leur structure

Question 22

l’agrafe à leucine

Answer 22

formée de 2 longues hélices alpha qui s’insèrent dans deux sillons majeurs voisins (un demi-tour entre eux)

Question 23

comment est induite la dimérisation dans l’agrafe à leucine

Answer 23

dimérisation est induite par une autre région au sein de ces mêmes hélices : dans cette région, elles forment des courts tronçons bispiralés au sein desquels les deux hélices restent associées par des interactions hydrophobes entre des résidus leucine (ou autres résidus hydrophobes) espacés de façon appropriée

Question 24

v ou f, les agrafes à leucine peuvent former des homo ou hétérodimères

Answer 24

v

Question 25

hélice boucle hélice

Answer 25

ressemble à l'agrafe à leucine, mais elle est formée par 4 hélices alpha qui sont reliées via une région relâchée (boucle)

Question 26

comment se fait l'association entre les deux sous-unité de l'hélice boucle hélice

Answer 26

régions riches en leucines présentes sur les deux hélices (celle qui lie l'ADN et la plus petite)

Question 27

comment définir les domaines activateurs

Answer 27

sur la base de leur contenu en aa

Question 28

comment est-ce que les domaines activateurs peuvent recruter la polymérase

Answer 28

à travers le complexe médiateur ou des facteurs généraux de la transcription

Question 29

but pour les domaines activateur de recruter des facteurs modificateurs des histones

Answer 29

altérer la chromatine pour permettre l'accès à des sites de liaison spécifique sur l'ADN

Question 30

v ou f, les activateurs agissent souvent directement sur l'ARNpol

Answer 30

faux, rarement

Question 31

3 façons des répresseur d'agir

Answer 31

1. interférer avec les activateurs : compétition 2. interagir avec le complexe d'initiation (à travers le complexe médiateur) et inhibter la transcription 3. compacter la chromatine et rendre les gènes inaccessibles (complexes remodelants)

Question 32

que cause la méthylation (transcription)

Answer 32

répression : queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d'hétérochromatine

Question 33

que cause l'acétylation ou la phosphorylation de la charge +

Answer 33

l'ADN peut être déroulé plus facilement

Question 34

la méthylation se fait généralement sur quelles bases

Answer 34

C ou A

Question 35

lors de la division cellulaire, les groupements méthyles sont maintenus et leur présence active la méthylation du brin complémentaire v ou f

Answer 35

vrai

Question 36

v ou f, les histones formant les nucléosomes ne peuvent pas être modifiés de manière post-trad

Answer 36

faux, peuvent

Question 37

acétylation des histones se fait par...

Answer 37

histone acétyl transférase (recruté par des activateurs sur des régions précises de l'ADN)

Question 38

l'addition d'un groupement acétyle peut créer un site de liaison pour des protéines contenant des...

Answer 38

bromodomaines

Question 39

qu'est-ce qu'un bromodomaine

Answer 39

motif de 4 hélices alpha capable de s'attacher sur des histones acétylées

Question 40

une des sous-unité de ce facteur général de transcription contient un bromodomaine - peut se lier plus facilement à un promoteur sur un nucléosome acétylé

Answer 40

TFIID

Question 41

comment sont recrutés les facteurs remodeleurs de la chromatine

Answer 41

facteurs de transcription queues N-terminales (des histones)

Question 42

v ou f les complexes remodeleurs de la chromatines ont besoin d'ATP

Answer 42

v, énergie utilisée pour permettre une redistribution des liens entre l'ADN et les histones

Question 43

par quoi sont tenus les nucléosomes (liens)

Answer 43

liens H

Question 44

v ou f , les nucléosomes peuvent être transférés vers un autre brin

Answer 44

vrai

Question 45

comment est-ce que l'ADN peut être légèrement déroulé

Answer 45

par glissement

Question 46

certains gènes sont maintenus silencieux par méthyloation de l'ADN de quelle région

Answer 46

promotrice

Question 47

v ou f l'ADN des régions euchromatiques est souvent méthylé

Answer 47

faux, l'ADN des régions hétérochromatiques

Question 48

v ou f, les séquences méthylées ne sont pas reconnues par des protéines spécifiques

Answer 48

faux, elles le sont

Question 49

les séquences méthylées sont reconnues par des protéines spécifiques qui recrutent quoi qui rendent la région impossible à transcrire

Answer 49

des histones méthylases et des histones désacétylases

Question 50

v ou f, un même facteur peut agir sur plusieurs gènes et la plupart des gènes eucaryotes sont sous le contrôle de multiples éléments

Answer 50

v

Question 51

plusieurs gènes sont sous le contrôle d'un même facteur. En absence du glucose, les opérons Lac et Gal sont activés par CAP

Answer 51

contrôle combinatoire

Question 52

deux conditions sont nécessaires pour obtenir la pleine expression des opérons Lac (présence lactose et absence glucose) ou Gal (présence galactose et absence glucose)

Answer 52

intégration du signal

Question 53

contrôle de l'expression génique : le développement des 4 parties de la fleur est la présence coordonnées de..

Answer 53

différents facteurs de transcription bien spécifiques

Question 54

des groupes de gènes peuvent être sous le contrôle d'un même élément en plus d'avoir une régulation spécifique pour chacun d'entre eux. Cette région contient des éléments activateurs, inhibiteurs et même isolateurs

Answer 54

LCR (locus control region)

Question 55

la liaison des protéines à LCR permet quoi

Answer 55

dérouler localement la chromatine pour accéder aux gènes

Question 56

locus (eucaryote)

Answer 56

emplacement physique précis et invariable sur un chromosome

Question 57

opéron (procaryote)

Answer 57

unité fonctionnelle de gènes qui opèrent sous le signal d'un même promoteur

Question 58

donne un exemple de gènes sous le contrôle de région LCR

Answer 58

globine : chaque gène n'est exprimé qu'à un moment précis du développement

Question 59

un être humain a environ cmb de types de cellules

Answer 59

200

Question 60

v ou f les 200 types de cellules de l'être humain dérivent de deux oeufs fécondés

Answer 60

faux, un seul

Question 61

le génome d'un invertébré compte 15 000-20 000 gènes, celui d'un vertébré en compte combien

Answer 61

30 000 à 40 000

Question 62

% du génome exprimé dans un type cellulaire donné

Answer 62

7-8%

Question 63

des types cellulaires différents expriment À LA FOIS deux types de gènes

Answer 63

gènes communs gènes qui les rendent spécifiques

Question 64

v ou f, une cellule mammifère typique exprime des récepteurs pour plus d'une dizaine de molécules (signaux) dont la fonction première est de réguler l'activité de facteurs de transcription

Answer 64

faux, plus d'une centaine

Question 65

les signaux (molécules) hydrophiles sont interceptés par

Answer 65

récepteurs membranaires

Question 66

les signaux (molécules) hydrophobes sont captés par

Answer 66

récepteurs nucléaires

Question 67

RTKs

Answer 67

large groupe de récepteurs liant des facteurs de croissances ou autres petites protéines

Question 68

comment sont les récepteurs RTKs inactifs

Answer 68

monomériques

Question 69

comment activer RTK

Answer 69

liaison à molécule signal entraîne dimérisation activation du domaine kinase phosphorylation des résidus tyrosine reconnaissance des récepteurs phosphorylés et activation des protéines intracell activation de la voie de signalisatgion Ras-MAPK

Question 70

suite à l'activation de RTK, que se passe-t-il

Answer 70

SH2 domaine de GRB2 se lie à RTK activé et SH3 se lie avec la protéine sos sos = GEF (guanine-nucléotide exchange factor) : catalyse l'échange du GDP pour une GTP, active Ras

Question 71

effet de l'activation de Ras sur la cellule

Answer 71

activation de la voie MAPK

Question 72

l'activation de MAPK par Ras s'effectue comment

Answer 72

série de phosphorylations successives, chacune activant une kinases capable à son tour de phosphoryler et activer la suivante dans la chaine

Question 73

v ou f, ce sont tous les récepteurs tyrosine-kinase qui déclenchent une cascade MAPK

Answer 73

faux

Question 74

Voie Notch-Delta

Answer 74

influence de l'expression génique des cellules voisines en produisant des protéines de signalisation extracell

Question 75

les protéines de signalisation extracell sont synthétisées dans une cellule puis elles sont... (2 options)

Answer 75

placées à la membrane plasmique sécrétées dans la matrice extracell

Question 76

voie Notch-Delta : les molécules de signalisation qui restent à la surface de la cellule émettrice contrôlent l'expression des gènes comment

Answer 76

physiquement en contact direct. : contact cellule à cellule

Question 77

explique la voie Notch-Delta dans le développement neuronal

Answer 77

neuroblastes expriment Delta (transmembranaire) les cellules épidermiques expriment Notch

Question 78

Qu'est-ce que Notch

Answer 78

récepteur hétérodimérique à un passage transmembranaire

Question 79

lorsque Notch est absent, il y a différencition en neurones ou en cellules de l'épiderme

Answer 79

en neurones

Question 80

lorsque Notch est absent, l'activateur de la transcription Su(H) forme une complexe avec les protéines...

Answer 80

hairless, groucho et CtBP complexe réprime la transcription des gènes en aval qui sont des répresseurs de la différenciation neuronale

Question 81

Quand Notch est activé, il déloge quoi

Answer 81

les protéines liées à Su(H) et la transcription des gènes (répresseur des gènes neuronaux) est activée... différenciation en cellule de l'épiderne

Question 82

processus permettant à la cellule de devenir hautement spécialisée

Answer 82

différenciation cellulaire

Question 83

processus de développement des structures d'un organisme au cours de son embryogenèse

Answer 83

morphogenèse

Question 84

pourquoi la régulation de la transcription ?

Answer 84

réponse à une modification de l'environnement processus de développement de l'organisme

Question 85

à quoi mène la liaison au ligand dans la voie de signalisation Notch-Delta

Answer 85

clivage protéolytique de la portion intracell qui passe alors à l'intérieur du noyau et régule la transcription des gènes de réponse (déloge les protéines liées à Su(H)) bloque la différenciation en neurones promeut la différenciation en cellule de l'épiderme