Från gen till protein 1 Flashcards
(33 cards)
Vad är det centrala dogmat?
Linjär överföring av information från DNA till protein (med vissa undantag)
Vad står DNA för?
Deoxyribonucleic acid
Hur ser dubbel- och enkelsträngat DNA ut?
Dubbel: Adenin, Guanin, Cytosin och Tymidin. Ribosgrupp saknar en hydroxylgrupp på kol 2.
Enkel: Adenin, Guanin, Cytosin och Uracil. Ribosgrupp har en hydroxylgrupp på kol 2. Mindre stabil än DNA, benägen att degraderas
När är CDK inaktivt?
När det inte associeras med ett cyklin
Vad för cellcykeln framåt i G1 fasen?
Cyklin D CDK4/6
Vad är ansvarigt för att deaktivera restriction point i G1 fasen av cellcykeln?
Cyklin E CDK2
Vad triggar DNA syntesen i cellcykeln?
Cyklin A CDK2
Vad triggar mitos i cellcykeln?
Cyklin B CDK1
Vad är replication origin? Vad händer där?
Regionav DNA där replikationen startar, aktiveras i sena G1 fasen efter restriction point. Initiatorproteiner fosforyleras av cyklin E/CDK2 i slutet av G1. Fosforylerade initiatorproteiner binder till replication origins i DNA. Replication origins är primade. DNA replikation maskineriet binder till initiatorproteiner vid replikationsorigin.
Vad är relikationsgaffel aktivering? Vad händer där?
Cyklin A-CDK2 aktivitet triggar replikationsgaffelformation. Replikationsgaffeln är ett multiprotein komplex som använder DNA som ett template för att syntetisera en ny strand. Kravet på två cyklin säkerställer att DNA replikation bar sker en gång per cellcykel. Cyklin E fosforyleras av cyklin A-CDK2 aktivitet triggar dess degradering.
Vad är replikationsbubblan? Vad händer där?
Replikationsbubblan formas vi replikationsorigin. Bubblan består av ett multippelprotein enzym komplex som inkluderar DNA polymeras. Fosforylation av cyklin A-CDK2 triggar aktivering av replikation. Replikationsgafeln rör sig i båda riktningarna bort från origin.
Vad är leading strand? Vad händer där?
En kort RNA primer placeras av enzymet primas. Primern ger en 3´OH grupp från polymeras att jobba från. Polymeras använder fria nukleotider för att bygga en ny DNA sträng genom att använda en föräldersträng som mall. Helikas använder energi från ATP för att bryta H bindningar mellan helixen och separerar strängarna. Topoisomeras 2 frisätter stress då replikationsgafflen går framåt. Det klipper DNA för att ta bort uppbyggnaden av spänning.
Vilket håll syntetiserar DNA polymeras DNA?
I 5´till 3´riktning, den kan inte sytetisera DNA i den andra riktningen
Vad är lagging strand? Vad händer där?
På lagging strand rör sig gaffeln och polymeraset i samma riktning. RNA primas tillverkar kontinuerligt korta RNA primers för lagging strand. Flertalet DNA polymeraser arbetar i andra riktningen från replikationsgaffeln. Lagging strand innehåller segment av DNA-RNA som kallas okazaki fragment. Efter polymeras når en RNA primer faller den av. RNA primers tas bort av nukleaser och specialliserade polymeraser fyller i luckorna. Ryggraden sluts av DNA ligaser.
Vad är topoisomeras inhibitatorer? Hur fungerar dom?
Det är en klass av anti-cancer droger. De integrerar med DNA:t och förhindrar topoisomeras från att lindra uppbyggnaden av stress vid replikationsgaffeln.
Normala VS cancerceller i cellcykeln?
I normala celler aktiveras checkpoints och DNA kan repareras. I cancerceller funkar inte check points och DNA tas isär under S fasen
Vad är DNA proofreading? Hur fungerar det?
DNA polymeras har 3´-5´nukleas aktivitet. Om DNA polymeras gör ett misstag kan det ta bort mismatched baser och adderar de korrekta baserna. DNA polymeras kan göra misstag men de repareras oftast.
Hur kan strålning ge DNA skador?
Högenergisk strålning bryter sockerfosfat ryggraden hos DNA helix vilket ger fria DNAslut.
Olika typer av DNA skada?
Ensträngade brytningar eller dubbelsträng brytningar. De fria DNA sluten rekryterar DNA skaderespons proteiner
Vad aktiveras vid DNA skada och vad händer?
p53 är ett av proteinerna som aktiveras som respons till skada. Om reparationen är mild eller modererad kan p53 aktivera p21 för att stoppa cellcykeln och DNA repareringsgener. Om skadan är för stor kan p53 trigga apoptos.
UV och DNA skada?
Promotar formationen av tymin dimers på intilliggande tyminrester i DNAsträngen. Intilliggande tyminer tvärlänkas till varandra och producerar en utbuktning i DNA ryggraden känt som bulky lesion. Förvrängningen i DNA ryggraden käns igen av DNA skadesignalerings komplex. De tvärlänkade tyminerna tas bort av DNA repareringkomplex och ersätts av polymeras.
Vad är melanin och hur skyddar det DNA?
Melanin är ett mörkt pigment som syntetiseras från tyrosin. Melanin absorberar UV. Melanocyter syntetiserar melanin i huden. Melaningranulat sekreteras av melanocyter och tas upp av epitelceller. Melaningranulat finns runt kärnan i epitelceller. UV-strålning som går genom epidermis absorberas av melanin vilket förhindrar de från att nå DNA i kärnan.
Vad orsakar hudcancer?
Orsakars av en mutation i epidermis eller dermis celler. För mycket exponering för solen innebär en större risk pga DNA skada som orsakars av UV-strålning. Om UV skadat DNA inte repareras blir det mutationer i proto-oncogener och tumör suppressor gener. En melanocyt som blir cancer kallas melanom.
Vad gör cancerframkallande ämnen?
Främjar mutationer genom att reagera/binda med DNA direkt och producerar lesions eller direkt skada.