Fundamentos de PCR Flashcards

1
Q

qué es una PCR?

A

reacción en cadena de polimerasa

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2
Q

quién introdujo la PCR y en qué año?

A

Mary Mullis en 1983

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3
Q

técnica de replicación in vitro de una molécula de ADNg

A

PCR

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4
Q

por qué se delimita la longitud del fragmento que se quiere replicar en una PCR?

A

primers o cebadores u oligonucleótidos

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5
Q

qué es el ADNg?

A

ADN genómico normal

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6
Q

PCR convencional

A
  • amplificación de una región genética específica
  • evaluación —> gel de agarosa o acrilamida
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7
Q

PCR cualitativo

A
  • identifica presencia o ausencia de un fragmentos específico
  • dx de enfermedades infecciosas
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8
Q

PCR semicuantitativo

A
  • permite conocer niveles de expresión de un gen (ARNm) (biopsias)
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9
Q

PCR cuantitativo

A
  • mide cantidad de microorganismos en ARNm
  • como referencia —> curva con muestras con concentraciones conocidas
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10
Q

PCR múltiple

A
  • amplificación de varias regiones génicas en una sola PCR
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11
Q

cuáles son los principios básicos de una PCR?

A
  • complementaridad
  • dirección 5’ —> 3’ (3’ debe de estar libre)
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12
Q

cuáles son las 3 etapas de una PCR?

A

desnaturalización
replicación
elongación

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13
Q

qué componentes se requieren para la PCR?

A

ADN
PRIMERS
DNA polimerasa
dNTPs
Magnesio (cofactor)

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14
Q

la DNA polimerasa ocupa de manera indispensable el __

A

magnesio

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15
Q

qué son los dNTP’s?

A

desoxinucleótidos libres en forma trifosfatada

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16
Q

cuál es la función de los dNTP’s?

A

estabilidad
formar enlace fosfodiester (nucleótido - nucleótido)

17
Q

con 50-200mM (dNTP’s) se sintetiza —>

A

6.5-25 mg de ADN

18
Q

a cuántos grados y por cuánto tiempo se desnaturaliza el ADN? inicio

A

95°C
5 min

19
Q

cuáles son los 3 ciclos de amplificación en la PCR?

A

desnaturalización (95°, 30s)
alineamiento (50-60°, 30-40s)
extensión (72°)

20
Q

a cuántos grados es la amplificación final?

21
Q

a cuántos grados es el almacenamiento temporal de la PCR?

22
Q

cuándo se ponen los primers?

A

en el alineamiento

23
Q

cuántos ciclos de amplificación son?

24
Q

cuántas copias de DNA se pueden obtener una sola hebra?

25
cómo es el proceso de visualización de amplificación PCR punto final?
1. agarosa/acrilamida 2. gel a la cámara y buffer de corrimiento 3. pipetear muestras y marcador 4. corrimiento 5. comparar bandas de muestras vs marcador PM
26
quién describió una la PCR en tiempo final y en qué año?
Higuchi 1992
27
cómo se le llamó a la adaptación que hizo Higuchi?
PCR tiempo real/cuantitativa
28
en la PCR de tiempo real se va observando el crecimiento de __
la curva de amplificación
29
cuál es la ventaja de la PCR en tiempo real?
la puedes usar como cuantitativa o cualitativa
30
cuáles son los pasos de la PCR en tiempo real?
Amplificación: - desnaturalización - alineamiento - extensión Detección por fluorescencia - SYBER green * TaqMan
31
SYBER GREEN es un intercalante y se inserta al __
medio de la cadena
32
SYBER GREEN más usado
bromuro de etidio
33
para qué se usa TAQMAN?
identificar SNPs
34
la sonda de TAQMAN es __ para una región que quieras identificar
específica
35
función principal de SYBR GREEN
expresión
36
cuáles son los 2 fluoróforos que tienen las sondas?
VIC FAM
37
cuáles son las ventajas de PCR en tiempo real?
- calcula eficiencia de reacción - no es necesario correr geles de agarosa - mas rápida y eficienciente
38
cuáles son las aplicaciones de la PCR en tiempo real?
análisis de expresión (cáncer) investigación (polimorfismos asociados a enferemdades) *estudios caso-control* dx de enfermedades (SARS-COV2)