Genética

Question 1

Tipos de SNVs (3)

Answer 1

• Raras (muy patogénicas o beningnas) - MAF 1%
• Comúnes (mayoría beningnas y pocas patogénicas) - MAF >5%
• Baja frecuencia - MAF 1-5%

Question 2

¿Cuántas mutaciónes de novo hay por generación?

Answer 2

40-60

Question 3

Número del genoma

Answer 3

3*10^9

Question 4

¿De dónde vienen la mayor cantidad de mutaciones (madre o padre)?

Answer 4

Padre (4:1) porque el proceso de espermatogenesis ocurren más proliferaciones de células y por ende son más susceptibles a mutaciones.

Question 5

Transiciones

Answer 5

Purina por purina o piramidina por piramidina (más comunes que transversiones)

Question 6

Transversiones

Answer 6

De purina a piramidina o viceversa.

Question 7

¿Cuál es la transición más común?

Answer 7

C > T porque en muchas s la ctosina esta metilada

Question 8

Mutaciones sinónimas

Answer 8

Codifican misma proteína (a veces puede afectar velocidad a la que se produce proteína)

Question 9

Mutaciones mis-sense

Answer 9

Se cambia un Aa por otro y puede cambiar conformación de proteína

Question 10

Mutaciones nonsense

Answer 10

El cambio causa un codón de parada prematuro wue crea una proteína truncada

Question 11

Códones de parada

Answer 11

UAG, UGA, UAA

Question 12

Frameshifts

Answer 12

Cambian marco de lectura entonces proteína a partir de ese punto estará mal programada. Tmb puede causar que aparezcan varios codones de parada y proteína quede truncada.

Question 12

¿Cuándo se ve inafectado el marco de lectura?

Answer 12

Cuando insertas o borras tres neuclótidos (o múltiplos de tres)

Question 13

Primeros y últimos neuclótidos en el intrón

Answer 13

GU y AG

Question 14

¿Cuál es el lugar de branching?

Answer 14

Adenina A después de tracto de polipirimidinas

Question 15

U2 se una a…

Answer 15

A (branching)

Question 16

U2AF se une a…

Answer 16

AG

Question 17

U1 se une a…

Answer 17

Reconoce sitio de splicing 5’ y se une a GU

Question 18

ISE

Answer 18

tenciador de intrones

Question 19

ISS

Answer 19

silenciador de intrones

Question 20

ESE

Answer 20

Receptor para la proteína SR que abilita la unión de U1

Question 21

ESS

Answer 21

Receptor para la proteína hnRNP que compite con U2AF for AG

Question 22

Sitio críptico de splicing

Answer 22

Cuando AG o GU son destruidas las que están en el sitio críptico entrán en acción. Si no hay sitio críptico entonces se puede exonizar el intrón o ionizar el exón.

Question 23

Mutaciones de pérdida de función

Answer 23

Mutaciones de cambio de sentido, sin sentido, deleción o frameshifts. Pueden llevar a inactivación epigenética o aberración cromosómica.

Question 24

Herencia de mutaciones de pérdida de función

Answer 24

Recesiva

Question 25

Mutaciones de ganancia de función

Answer 25

Causan que gen haga algo distinto o se descontrole. Alelo de pittsburgh, mutacion FGFR en achondroplasia y fusión de genes que llevan a cancer.

Question 26

Herencia de ganancia de función

Answer 26

Dominante

Question 27

En pérdida de función no hay dominancia recesiva en...

Answer 27

habloinsuficiencia y dominancia negativa en colágeno

Question 28

¿A que tejidos afectan las mutaciones de genoma mitocondrial?

Answer 28

Tejidos con gran gasto de energia. También afectan sobre todo a cadena respiratoria

Question 29

Tipos de genes en genoma mitocondrial

Answer 29

RNA (2), tRNA (22) y parapeptidos (13)

Question 30

Herencia mitocondrial

Answer 30

Herencia maternal porque el espermatozoide no tiene mitocóndrias y todas las del embryo vendrán del óvulo.

Question 31

Heteroplasmia

Answer 31

Número de ADN donde esta presente la mutación mitocondrial y por ende si la mujer presenta o no clínica de la enfermedad y la probabilidad de que la pase (baja si no esta en 100% de las cadenas)

Question 32

Estudio heredabilidad familia

Answer 32

Se estudia la prevalencia de una enfermedad en la población general y en los parientes de aquellos que tienen la enfermedad (subpoblación). Si el porcentaje es más alto en grupo familiar entonces gen influye desarrollo de enfermedad.

Question 33

Riesgo relativo de hermanos (fórmula)

Answer 33

Prevalencia de población familiar/prevalencia de población general

Question 34

Estudios de gemelos heredabilidad

Answer 34

Se estudia las tazas de concordancia entre gemelos monozigóticos y dizigóticos y se calcula la heredibilidad. h=2x(Cmz-Cdz)

Question 35

Heredabilidad para rasgos cuantitativos

Answer 35

Se compara una enfermedad en padres y hijos en un gráfica. Se edibuja una recta de regresión y entre mayor el coeficiente, mayor la heredibilidad.

Question 36

GWAS

Answer 36

Permite ver cuáles son los genes implicados y variables genéticas en enfermedades complejas de mucha variabilidad.

Question 37

Cohortes GWAS

Answer 37

Tienen que haber dos, uno de pacientesy uno de individuos sanos (sin la enfermedad): Por lo menos 1000 personas por grupo.

Question 38

¿Cuántos SNPs se estudian en el GWAS y por qué?

Answer 38

Se estudian entre medio millon y 1millon de SNPs ya que estos se encuentran en bloques haplotipicos. Al estudiar un SNP tienes la información de todo ese bloque.

Question 39

Todo el genoma (SNPs) esta formado por...

Answer 39

bloques (haplotipos)

Question 40

Problema del GWAS

Answer 40

Usa variantes comúnes y las raras son las que normalmente llevan la enfermedad (de menor MAF)

Question 41

Manhattan Plot

Answer 41

Se agarra la información del GWAS y se ordena en orden cromosómico. Para cada SNP calculas el valor P y los alelos relacionados a la enfermedad. Si valor P < 1*10-7/8 entonces probablemente sea el SNP que aumenta el riesgo.

Question 42

Polygenic risk scores

Answer 42

FUTUTO DE GENÉTICO. Podrás calcular el riesgo genético que tienes referente a tus variantes genéticas. Al grupo de salud le interesa reconocer a las personas con riesgos muy altos de dasarrollar la enfermedad.