Genetik Flashcards
Transposons
Retrotransposons
Genetische Einheiten, die zwei Proteine (Reverse Transkriptase und Integrase) codieren.
Target site duplication
duplicate copies on both sides of insert due to insertion of transposons/retrotransposons => enzymes ckeave unequally?
Genetischer Fussabdruck
Durch Transposons und Retrotransposons => Verdoppelung der Zielsequenz im Genom (LTR?)
Durch Transposons…
Verlängert sich die Distanz von zwei Genen
Unequal Crossing Over
Führt zu Genomverkleinerung
=> sehr nahe oder verwandte sequenzen (z.B. Retrotransposons) können zu Fehlpaarung führen
Eines der neuen Chromosomem grösser, eines kleiner
=> wenn essentiell: letal
Oder: im gleichen Chromosom zwei ähnliche Sequenzen
eines linear, reduziert auf eines der beiden Elemente
eines kreisförmig => geht verloren
SSA
Synthesis dependent strand annealing => schneller mechanismus um ds Brüche zu reparieren
Fehleranfällig!
Transposon hüpft raus => doppelstrangbruch
Exonclease produziert 3’-Überhänge
Annealing der Stränge an kurzer homologer sequencen
Überhänge verdaut, einzelstrangbrüche repariert
=> verlust Genomgrösse
Dynamisches Gleichgewicht von Genomen
Gene da und erhalten, aber unterschiedlich in Distanz => versch. Intergene sequenzen => einfluss dieser repetitiver DNA auf Genregulation
Modellpflanzen Eigenschaften
kleines, diploides genom
Kurze Generationszeit
Grosse Samenproduktion
Kleine, anspruchslose Pflanzen
Nahe verwandte Kulturpflanzen oder selbst eine Kulturpflanze
Arabidopsis thaliana
Zweikeimblätterige Modellpflanze
Reis
Einkeimblättrige Modellpflanze
C-value-paradox
Enorme Varianz der Genomgrösse in organismen ähnlicher Komplexität
LTR
Long terminal repeat
Enthalten promotor/downstream sequenzen => nicht proteinkodierend
Sind bei frisch transponiertem Element identisch
Repetitive Elemente
Sind keinem Selektionsdruck ausgesetzt
Basic Substitution rate
6.5*10^-9
