Genetiske tests Flashcards

1
Q

Elektroforese

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

DNA-sekventering

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Primere

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Restriktionsenzymer

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

PCR

A

Polymerase chain reaction. Opformerer DNA nemt og effektivt til en masse kopier. Sker via. opvarmnings- og nedkølingscyklusser. DNA denatureres og …

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Mikroarrays

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Southern blotting

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Western blotting

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Sanger sekventering

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

GWAS

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Manhattan plot

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

CRISPR

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Genterapi

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Koblingsanalyse

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Genmapning

A

-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

FISH

A

Fluorescence in situ hybridization.
Teknik hvor en mærket probe hybridiseres til metafase-, profase- eller interfasekromosomer. Kan bruges til at teste for manglende eller yderligere kromosomalt materiale såvel som kromosomomlægninger.
SKY er et eksempel på FISH.

17
Q

CGH-teknikken

A

Compartive genomic hybridization.
Tillader detektion af kromosomdubliseringer og deletioner (INDELS) ud fra differentieret mærket DNA fra test- og kontrolkilder, som hybridiseres til prober i mikroarrays.
Bruger DNA-prøve som screening (man behøver ikke vide hvad man kigger efter)

18
Q

CMA

A

Cytogenomic microarray.
Tilbyder højere opløsning end CGH og kan detektere duplikationer, sletninger, uniparental disomi og tab af heterozygositet.

19
Q

HW-ligevægt

A

Hvis der ikke er nogen evolutionære kræfter i populationen, vil allel- og genotypefrekvenser være konstante.

20
Q

HW-forudsætninger

A
  1. Panmixia - tilfældig parring
  2. Konstante allel- og genotypefrekvenser over generationer
  3. Ingen evolutionære kræfter (mutation, selektion, migration og genetisk drift)
  4. Populationen er uendeligt stor
21
Q

Naturlig selektion

A

evolutionær proces, hvor alleler der giver overlevelse (har reproduktive fordele i et miljø) vælges positivt og stiger i frekvens i modsætning til alleer, der giver lavere overlevelse

22
Q

Genetisk drift

A

Evolutionær proces, der gær genfrekvenserne større i mindre populationer

  • Founder effekt: små stifterpopulationer kan opleve store ændringer i genfrekvenser på grund af deres lille størrelse
  • Gen flow: populationer udveksler migranter, der parrer sig med hinanden. Over tid gør gen flow populationer mere genetisk ens.
23
Q

Ved HW-ligevægt er sammenhængen mellem allelfrekvenserne p og q

A

p^2 + 2pq + q^2 = 1

24
Q

Allelfrekvensen af fx p findes ved formlen

A

p = f(A) = (2·N(AA)+N(Aa)) / 2·(N(AA)+ N(Aa) + N(aa))

25
``` Genotypefrekvenserne for F(AA) F(Aa) F(aa) findes ved ```
``` F(AA) = p^2 F(Aa) = q · p F(aa) = q^2 ```
26
Chi-i-anden formel
Summen af (observerede-forventede)^2 / forventede
27
Betinget sandsynlighed bruges ved...
1. Nedsat penetrans | 2. X-bunden recessiv sygdom, hvor mor er bærer og har raske drenge
28
Multiplikationsprincippet
-
29
Bayes formel
-
30
Ved betinget sandsynlighed opstilles skema, hvor der udregnes følgende for de to mulige genotyper
1. Sandsynlighed for apriori genotype 2. Den betingede sandsynlighed Fx for, at individets afkom er rask givet apriori genotypen (logik) 3. Den fælles sandsynlighed - vha. multiplikationsreglen 4. Posterior sandsynligheden (gunstige/mulige)
31
Apriori genotype
Genotype opnået via fornuften. For at afgøre dette kigger man på individets forældre
32
Genmapning
-
33
Koblingsanalyse
-