Genetiske tests Flashcards
Elektroforese
-
DNA-sekventering
-
Primere
-
Restriktionsenzymer
-
PCR
Polymerase chain reaction. Opformerer DNA nemt og effektivt til en masse kopier. Sker via. opvarmnings- og nedkølingscyklusser. DNA denatureres og …
Mikroarrays
-
Southern blotting
-
Western blotting
-
Sanger sekventering
-
GWAS
-
Manhattan plot
-
CRISPR
-
Genterapi
-
Koblingsanalyse
-
Genmapning
-
FISH
Fluorescence in situ hybridization.
Teknik hvor en mærket probe hybridiseres til metafase-, profase- eller interfasekromosomer. Kan bruges til at teste for manglende eller yderligere kromosomalt materiale såvel som kromosomomlægninger.
SKY er et eksempel på FISH.
CGH-teknikken
Compartive genomic hybridization.
Tillader detektion af kromosomdubliseringer og deletioner (INDELS) ud fra differentieret mærket DNA fra test- og kontrolkilder, som hybridiseres til prober i mikroarrays.
Bruger DNA-prøve som screening (man behøver ikke vide hvad man kigger efter)
CMA
Cytogenomic microarray.
Tilbyder højere opløsning end CGH og kan detektere duplikationer, sletninger, uniparental disomi og tab af heterozygositet.
HW-ligevægt
Hvis der ikke er nogen evolutionære kræfter i populationen, vil allel- og genotypefrekvenser være konstante.
HW-forudsætninger
- Panmixia - tilfældig parring
- Konstante allel- og genotypefrekvenser over generationer
- Ingen evolutionære kræfter (mutation, selektion, migration og genetisk drift)
- Populationen er uendeligt stor
Naturlig selektion
evolutionær proces, hvor alleler der giver overlevelse (har reproduktive fordele i et miljø) vælges positivt og stiger i frekvens i modsætning til alleer, der giver lavere overlevelse
Genetisk drift
Evolutionær proces, der gær genfrekvenserne større i mindre populationer
- Founder effekt: små stifterpopulationer kan opleve store ændringer i genfrekvenser på grund af deres lille størrelse
- Gen flow: populationer udveksler migranter, der parrer sig med hinanden. Over tid gør gen flow populationer mere genetisk ens.
Ved HW-ligevægt er sammenhængen mellem allelfrekvenserne p og q
p^2 + 2pq + q^2 = 1
Allelfrekvensen af fx p findes ved formlen
p = f(A) = (2·N(AA)+N(Aa)) / 2·(N(AA)+ N(Aa) + N(aa))