I.2. Microscopie et préparation des échantillons Flashcards

1
Q

réfraction d’un rayon lumineux

A

dévié à l’interface entre les deux milieux par arpport à sa direction d’incidence
quand passe d’un milieu à l’autre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

indice de réfraction

A

mesure combien un milieu ralentit la vitesse de la lumière

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

la direction et l’angle de déviation sont déterminés par

A

les indices de réfraction des deux milieux formant l’interface

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

lentille convexe

A

focalise des rayons lumineux en un point spécifique, le foyer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

distance focale

A

distance entre le centre de la lentille et le foyer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

la puissance d’une lentille dépend de

A

la distance focale

plus la distance focale est courte, plus on agrandit un objet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

5 types de microscopes optiques

A
à fond clair
à fond noir
à contraste de phase
confocal
à fluorescence
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

microscope composés

A

image agrandie est formée par 2 lentilles ou plus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

microscope à fond clair

A

utilise la lumière
permet d’observer des objets ou des être vivants entre 1µm et 1mm
miroirs pour dévier les rayons lumineux dans la trajectoire choisie
image foncée sur fond brillant

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

résolution d’un microscope

A

capacité d’une lentille à séparer ou distinguer des petits objets qui sont près l’un de l’autre, donc à rendre l’image plus nette

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

formule résolution d’un microscope

A

d=0.5gamma / n sin teta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

ouverture angulaire

A

teta

moitié de l’angle du cône de lumière qui vient de l’échantillon et pénètre dans la lentille

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

ouverture numérique

A

n sin teta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

objectif à immersion

A

huile à immersion à un indice de réfraction similaire au verre, donc augmente la résolution car on substitue l’air pour l’huile

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

distance de travail

A

distance entre la surface antérieure de la lentille et la surface de la lame couvre-objet/l’échantillon après la mise en point

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

microscope à fond noir

A

autour de l’échantillon apparait noir, tandis que l’objet est brillant
utilisé pour observer des organismes vivants non colorés ou peu contrastés

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

microscope à contraste de phase

A

transforme de légères différences d’indice de réfraction et de densité cellulaire en différences d’intensité lumineuses observables
bon pour cellules vivantes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

microscope confocal

A

rayon laser focalisé touche un point de l’échantillon

ordinateur compile les images générées pour reconstruire une image 3D

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

microscope à fluorescence

A

éclaire l’échantillon avec une lumière UV, violette ou bleue
échantillons contrastés par un colorant appelé fluorochrome
image de l’objet résultante de la lumière fluorescente émise par le spécimen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

buts de la préparation des échantillons

A

augmenter la visibilité
accentuer les particularités morphologiques spécifiques
préserver les échantillons en vue d’études ultérieures
fixés et colorés

21
Q

fixation d’un échantillon

A

procédé par lequel les structures internes et externes des cellules et des organismes sont conservées et fixées en place

22
Q

2 types de fixation

A

à la chaleur

chimique

23
Q

fixation à la chaleur

A

conserve la morphologie générale mais pas les structures intracellulaires

24
Q

fixation chimique

A

protège les structures cellulaires fines et la morphologie des microorganismes plus grands et plus délicats

25
Q

coloration

A

rend les structures internes et externes de la cellule plus visibles en augmentant le contraste avec l’arrière-plan

26
Q

deux propriétés en communes à tous les colorants

A

possèdent des groupes chromophores

peuvent se lier au cellules par interactions ionique, covalente ou hydrophobe

27
Q

groupes chromophores

A

doubles liaisons conjuguées, donnent la couleur au colorant

28
Q

coloration simple

A

un seul colorant est utilisé

basique ou acide

29
Q

colorant basiques

A

possèdent des charges positives qui se fixent à des molécules chargées négativement
crystal violet, bleu de méthylène, safranine

30
Q

colorants acides

A

possèdent des charges négatives qui se fixent à des molécules chargées positivement
éosine, rose bengale

31
Q

coloration différentielle

A

distingue les microorganismes sur la base de leur coloration

Gram, acido-alcoolo-résistante

32
Q

coloration gram

A

méthode de coloration la plus largement utilisée en bactériologie
divise les bactéries en gram + (violet) et gram - (rouge)

33
Q

4 étapes coloration gram

A

fixation
coloration primaire (violet de cristal)
lavage et décoloration
contre coloration (safranine)

34
Q

coloration alcoolo-résistante

A

particulièrement utile pour identifier des espèces acido-alcoolo-résistantes de genre Mycobactérium
rouge = acido-alcoolo-résistante
bleu = non acido-alcoolo-résistante

35
Q

3 étapes de coloration alcoolo-résistante

A

chauffage avec mélange de fushine basique et phénol
décoloration avec un mélange alcool-acide
contre coloration avec bleu de méthylène

36
Q

coloration négative

A

on utilise souvent de l’encre de chine ou de la nigrosine pour révéler les capsules qui entourent certaines bactéries

37
Q

coloration des endospores

A

coloration de Shaeffer-Fulton

endospores apparaissent vertes/bleu dans une cellule rouge/rose

38
Q

coloration des flagelles

A

un mordant est utilisé afin d’épaissir les flagelles avant de les colorer

39
Q

microscopie électronique

A

un faisceau d’électrons est utilisé pour produire une image
la longueur d’onde d’un faisceau d’électron est plus courte que celle de la lumière, résultant en une meilleure résolution

40
Q

différents outils de microscopie électronique

A

microscope électronique à transmission (TEM)
microscope électronique à balayage
cryotomographie électronique
microscope à balayage de sondes

41
Q

microscopie électronique à transmission

A

électrons sont diffractés lorsqu’ils traversent l’échantillon
faisceau d’électrons focalisé par lentilles magnétiques pour former une image visible agrandie de l’échantillon sur un écran fluorescent
doit être sous vide
échantillons très fins

42
Q

ombrage métallique

A

TEM

échantillon enduit d’une fine couche de métaux lourds

43
Q

cryodécapage

A

TEM

échantillons congelés sont fracturés le long des lignes de plus grande fragilité

44
Q

microscopie électronique à balayage

A

produit une image à partir des électrons réfractés par la surface de l’objet plutôt qu’à partir des électrons transmis
produit une image 3D de la surface du micro-organisme avec une grande profondeur de champ

45
Q

photomultiplicateur

A

dans électronique à balayage

amplifie la lumière des électrons secondaire et donne l’effet de profondeur

46
Q

cryotomographie électronique

A

échantillons plongés dans un liquide très froid et observés alors qu’ils sont encore congelés
préserve l’état natif des structures cellulaires

47
Q

2 types de microscopie à balayage de sonde

A

à effet tunnel

à force atomique

48
Q

microscope à effet tunnel

A

détermine les caractères de surface en balayant la surface de l’objet avec une sonde ponctuelle
grossissements de 100 milions
atomes

49
Q

microscope à force atomique

A

déplace une sonde effilée à la surface de l’échantillon tout en maintenant constant la distance entre la pointe de la sonde et cette surface
étude de surfaces qui ne conduisent pas bien l’électricité