Intra 3 - Biosynthèse des acides aminés Flashcards

1
Q

Quels sont les rôles des acides aminées (3)?

A

Éléments de construction pour les protéines qui se renouvellent sans cesse

Éléments de construction pour d’autres molécules contenant de l’azote

Source énergétique

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2
Q

Quels sont les 3 grands processus du catabolisme des acides aminés?

A

La désamination

Le cycle de l’urée

Le catabolisme du squelette carboné en intermédiaires du métabolisme central

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3
Q

Quel processus utilisent l’énergie produite par la formation d’intermédiaires métaboliques (2) ?

A

La gluconéogénèse et la formation d’acétyl-CoA

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4
Q

Vrai ou Faux? Les acides aminés sont uniquement glucoformateurs ou cétogènes.

A

Faux, les acides aminés sont cétogènes, bivalents ou glucoformateurs.

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5
Q

Quels acides aminés forment le pyruvate?

A

Alanine, Cystéine, Glycine, Sérine, Thréonine, Tryptophane

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6
Q

Comment les corps cétoniques contribuent au cerveau?

A

Jusqu’à 60% de l’apport énergétique

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7
Q

Expliquer la dégradation de l’alanine en pyruvate?

A

Simple transmination

Enzyme: Alanine aminotransférase

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8
Q

Expliquer la dégradation de la sérine en pyruvate?

A

Simple déamination avec la pyridoxine comme cofacteur

Enzyme: Sérine déshydratase

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9
Q

Expliquer la dégradation de la cystéine en pyruvate?

A

Voie plus complexe libérant du souffre

Puis azote libéré par déamination

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10
Q

Expliquer la dégradation de la glycine en pyruvate?

A

Deux voies de dégradation:

Transformé en sérine

Dégradé en CO2, avec transfert d’un CH3 au THF

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11
Q

Expliquer la dégradation de la thréonine en pyruvate?

A

Acide aminé bivalent

Dégradé en glycine et acétyl-CoA

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12
Q

Quel est le cofacteur de la sérine déshydratase?

A

Le pyridoxal phosphate (PLP), un dérivé de la pyridoxine

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13
Q

Comment fonctionne le pyridoxal phosphate?

A

Le PLP est un puit d’électron qui sert de receveur et de donneur de groupe aminé.

Il est temporairement transformé en pyridoxamine phosphate (PMP).

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14
Q

Quelle est la base de Schiff?

A

Un groupe fonctionnel imine (C=N), auquel l’azote est lié a un groupement aryl ou alkyl.

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15
Q

Quelle rupture est facilitée par la base de Schiff?

A

La rupture de différentes liaisons au C alpha, dans différentes enzymes

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16
Q

Vrai ou Faux? La liason à rompre par la base de Schiff se trouve dans le plan parralèle à celui du cycle PLP.

A

Faux, c’est le plan perpendiculaire

17
Q

Décrivez le mécanisme de la sérine déshydratase (4)?

A
  1. Formation de la base de Schiff sérine-PLP
  2. Départ de l’atome H du carbone alpha de la sérine (H recouvre les orbitales pi du PLP)
  3. Élimination du groupement OH du carbone beta
  4. Hydrolyse de la base de Schiff pour regénérer le PLP-enzyme
18
Q

Combien de réactions sont nécessaires pour dégrader la phénylalanine et la tyrosine?

A

6 réactions enzymatiques

Enzyme: phénylalanine hydroxylase, ayant comme cofacteur la bioptérine

19
Q

Dans combien de réactions sont impliquée la bioptérine?

A

6 réactions d’oxydation enzymatiques

20
Q

Vrai ou Faux? La bioptérine est une vitamine.

A

Faux, on peut la synthétiser

21
Q

Quels sont les intermédiaires du métabolisme de la sérine et de la méthionine (2)?

A

Tétrahydrofolate
S-adénosylméthionine

22
Q

Comment est produit la S-adénosylméthionine?

A

Uniquement par la dégradation de la méthionine

23
Q

Quel produit est recyclé pour regénérer la méthionine?

A

L’homocystéine

24
Q

Comment est utilisé le Tétrahydrofolate?

A

Source de carbone

25
Q

Combien d’acides aminés sont considérées comme essentiels?

A

10, la moitié

26
Q

Comment sont synthétisés les acides aminés essentiels?

A

Par les plantes et les microorganismes, et sont présents dans les protéines végétales et animales

27
Q

Comment sont synthétisés les acides aminés non essentiels?

A

Par notre organisme

28
Q

Quelles sont les acides aminés essentiels?

A

Arginine
Histidine
Isoleucine
Leucine
Lysine
Méthionine
Phénylalanine
Thréonine
Tryptophane
Valine

29
Q

Quels sont les intermédiaires métaboliques permettant la synthèse des acides aminés non essentiels (4)?

A

Oxaloacétate
a-cétoglutarate
Pyruvate
3-Phosphoglycérate

30
Q

Quelle est la sources d’azote permettant la synthèse des acides aminés non essentiels (2)?

A

De l’échange du groupement azoté d’un autre acide aminé (transamination)

De l’ajout de l’azote venant de l’ammoniac

31
Q

Quels acides aminés sont synthétisés par des réactions d’amination à une seule étape (transamination ou amidation) (5)?

A

Alanine, Asparagine, Aspartate, Glutamate, Glutamine

32
Q

Expliquer la synthèse de l’alanine?

A

Simple transamination

Enzyme: Alanine aminotransférase

33
Q

Expliquer la synthèse de l’aspartate?

A

Simple transamination

Enzyme: Aspartate aminotransférase

34
Q

Expliquer la synthèse du glutamate?

A

Plein d’aminotransférase

Enzymes: Alanine aminotransférase et Aspartate aminotransférase

35
Q

Expliquer la synthèse de l’asparagine?

A

Transfert d’azote via un mécanisme différent

Enzyme: Asparagine synthétase (avec ATP)

36
Q

Expliquer la synthèse de la glutamine?

A

Transfert direct d’un groupement ammoniac libre

Point de contrôle dans le métabolisme de l’ammoniac

Enzyme: Glutamine synthétase (avec ATP)

37
Q

Quelles enzymes sont impliquées dans la synthèse de la sérine?

A
  1. 3-phospohoglycérate déshydrogénase
  2. Phosphosérine aminotransférase
  3. Phosphosérine phosphatase
38
Q

Quel est le substrat de la synthèse de la sérine?

A

3-phospohoglycérate

Intermédiaire de la voie de dégradation du glucose