Le microbiote Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le Human Microbiome Project?

A

Une analyse de la composition génétique de la population microbienne qui vit sur et dans les adultes en santé (microbiome)

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Q

Quel est le ratio bactéries : cellules humaines?

A

10 : 1

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3
Q

Le foetus vit dans un milieu (1), ce qui signifie qu’il (2)

A
  1. Stérile

2. N’y a pas de bactéries

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4
Q

Quel est le point de départ de la formation du microbiote de tout humain?

A

À la naissance, le bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère: c’est le début de la colonisation de sa peau et de son système digestif par une flore normale

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5
Q

Pourquoi dit-on que le microbiote est modulé au fil de la croissance d’un enfant?

A

Puisque l’enfant entre en contact avec d’autres personnes et des bactéries de son environnement (ex: jouet qui tombe par terre, manger/boire, mettre les doigts dans la bouche)

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6
Q

Qu’est-ce que le microbiote?

A

L’ensemble des micro-organismes (bactéries) qui résident sur un site donné: la peau, les narines, le tractus GU, le tractus GI…

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7
Q

Le microbiote est constituée des bactéries que l’on peut…

A

… faire pousser

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8
Q

Qu’est-ce que le microbiome?

A

L’ensemble des micro-organismes et de leurs gènes (matériel génétique) qui résident sur un site donné (la majorité des bactéries ont du matériel génétique)

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9
Q

Quels sont les 2 types de microbiome?

A
  • Microbiome central (core microbiome)

- Microbiome secondaire

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10
Q

Quel microbiome a la plus grande variété d’espèces entre le microbiome central et le microbiome secondaire?

A

Le microbiome secondaire

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11
Q

Qu’est-ce que le microbiome central?

A

Espèces bactériennes présentes chez >95% des personnes humaines à un site donné (représente la majorité des bactéries à un site donné)

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12
Q

Qu’est-ce que le microbiome secondaire?

A

Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre

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13
Q

Chaque espèce du microbiome secondaire est en […] par rapport au microbiome central

A

Plus petite quantité

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14
Q

Qu’est-ce qui pourrait faire en sorte que le microbiome de 2 personnes se ressemble?

A

+ on a de choses en commun, + on a un microbiome semblable (par exemple, le microbiome a plus de chances d’être semblable si 2 personnes viennent de la même famille, mangent les mêmes repas…)

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15
Q

Je ne pense pas que ce soit à savoir par coeur, ce sont seulement des exemples

Quels seraient 3 exemples d’espèces bactériennes du microbiome central que l’on retrouve au niveau de la peau?

A
  • Staphylococcus epidermidi
  • Corynebacterium
  • Propionibacterium
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16
Q

Je ne pense pas que ce soit à savoir par coeur, ce sont seulement des exemples

Quels seraient 3 exemples d’espèces bactériennes du microbiome central que l’on retrouve au niveau de la bouche?

A
  • Streptococcus
  • Neisseria
  • Corynebacterium
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17
Q

Je ne pense pas que ce soit à savoir par coeur, ce sont seulement des exemples

Quels seraient 3 exemples d’espèces bactériennes du microbiome central que l’on retrouve au niveau du côlon?

A
  • Escherichia coli
  • Enterococcus
  • Bacteroides
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18
Q

Je ne pense pas que ce soit à savoir par coeur, ce sont seulement des exemples

Quel serait un exemple d’espèce bactérienne du microbiome central que l’on retrouve au niveau du vagin?

A

Lactobacillus

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19
Q

La peau joue un rôle de […] très important

A

Protection

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20
Q

Le microbiote cutané varie selon 2 choses, quelles sont-elles?

A
  • Le site

- Le sexe

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21
Q

Le microbiote cutané est influencé par 2 choses, quelles sont-elles?

A
  • La présence ou non de glandes sébacées

- L’humidité

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22
Q

Classer les régions suivantes en ordre croissant du nombre de microorganismes par mL: IG, côlon, salive, estomac

A

Estomac: 10^3/mL
IG: 10^4/mL
Salive: 10^9/mL
Côlon: 10^11/mL

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23
Q

Pourquoi l’estomac est-il l’endroit du tractus GI où l’on retrouve le moins de bactéries?

A

L’acidité gastrique

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24
Q

Quel est l’impact de la prise d’antiacides sur le microbiote?

A

Quand on prescrit des antiacides, on interfère avec le microbiote puisqu’en élevant le pH de l’estomac, on fragilise les patients à certaines infections

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25
Q

Le microbiote du tractus GI varie en diversité et en quantité de bactéries selon le…

A

… segment du tube digestif

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26
Q

Combien de bactéries le tractus digestif contient-il?

A

10^14

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27
Q

Combien d’espèces de bactéries le tractus digestif contient-il?

A

Plus de 500

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28
Q

La majorité des >500 espèces de bactéries retrouvées dans le microbiote du tractus digestif sont-elles cultivables en laboratoire?

A

Non

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29
Q

Comment identifie-t-on principalement les >500 espèces de bactéries du microbiote du tractus digestif?

A

Par séquençage moléculaire

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30
Q

Si on souhaite identifier une infection détectée, peut-on faire une coloration Gram sur n’importe quel segment prélevé? Pourquoi?

A

Non, cela ne permet pas toujours d’évaluer quelle bactérie a causé une infection puisque certaines régions, comme la gorge et les selles, ont déjà beaucoup de bactéries

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31
Q

Le microbiote humain sain varie grandement… (3)

A
  • … d’une personne à l’autre
  • … d’une région géographique à l’autre (notamment influencé par l’alimentation)
  • … en fonction de l’âge
32
Q

Qu’arrive-t-il si un nouveau-né naît par césarienne?

A

Il ne peut pas avoir le microbiote du vagin de sa mère

33
Q

Quelle est la solution au manque de transmission du microbiote vaginal lors d’un accouchement pas césarienne?

A

Prendre une partie du microbiote de la mère et le mettre sur la bouche du bébé

34
Q

Mise à part la méthode d’accouchement, quelle autre variable peut avoir un impact sur la composition du microbiote d’un nourrisson?

A

Le fait d’être allaité ou non

35
Q

Que se passe-t-il avec le microbiote à l’âge adulte?

A

Il se stabilise (en composition)

36
Q

Que se passe-t-il avec le microbiote en âge avancé?

A

Il recommence à changer (comme lors de l’enfance)

37
Q

Quelles sont les 4 caractéristiques du microbiote pendant l’enfance?

A
  • Les nouvelles souches remplacent les anciennes (à quelques exceptions près qui restent les mêmes que celles d’origine)
  • Augmentation rapide de la diversité
  • Très instable
  • Change en fonction de la diète et des maladies vécues
38
Q

Classer en ordre croissant de diversité (noter que A = allaitement, V = accouchement vaginal et C = accouchement pas césarienne)

AV
AC
V
C

A

C - AC - V - AV

39
Q

Quels sont les 3 grands rôles du microbiote intestinal?

A
  • Fonctions métaboliques
  • Stimulation de l’immunité innée
  • Prévention de la colonisation par des bactéries pathogènes
40
Q

Fonction métabolique du microbiote intestinal: en quoi cela consiste-t-il?

A

Le microbiote métabolise certains nutriments plus facilement, ce qui les rend disponibles aux cellules hôtes

41
Q

Quel serait un exemple de mécanisme précis qui décrit la fonction de métabolisme du microbiote intestinal? (2 étapes)

A
  1. De grosses molécules d’hydrates de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate, butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes
  2. Les acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate, limitent la croissance de certaines bactéries indésirables
42
Q

Quelles sont les 3 moyens du microbiote intestinal pour protéger contre certaines infections entériques?

A
  • En tapissant la muqueuse (rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
  • En stimulant la production de mucine, d’IgA et des peptides anti microbiens (AMPs)
  • En stimulant la production d’IL-22 et d’IL-1β
43
Q

Quelle est la conséquence de la production d’IL-22 comme mécanisme de protection du microbiote intestinal contre certaines infections entériques?

A

Augmentation de la résistance des cellules épithéliales

44
Q

Quelle est la conséquence de la production d’IL-1β comme mécanisme de protection du microbiote intestinal contre certaines infections entériques?

A

Augmentation du recrutement de cellules inflammatoires

45
Q

Quels sont les 4 facteurs externes qui influencent (débalancent) le microbiote?

A
  • Hygiène personnelle (savon, d.odorant, rince-bouche, douche vaginale)
  • Diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) +/- diversifiée
  • Eau (avec chlore ou eau de puits)
  • Prise d’antibiotique
46
Q

Qu’est-ce qu’une dysbiose?

A

Un débalancement de la flore intestinale normale

47
Q

Quels seraient 5 exemples de dysbiose (altération de la flore intestinale normale)?

A
  • Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
  • Colite ulcéreuse (maladie inflammatoire de l’intestin)
  • Maladie cœliaque (entéropathie au gluten)
  • Vaginite à candida
  • Obésité
48
Q

Quelles sont les 3 étapes mécanistiques de la diarrhée à clotridioides difficile?

A
  1. La prise d’antibiotiques altère la flore normale du côlon
  2. Prolifération du C. difficile (perte de la compétition alimentaire)
  3. C. difficile produit des toxines responsables de la diarrhée liquide
49
Q

Mécanisme #1 pour le développement d’une colite ulcéreuse: la bactérie (1) prolifère et produit une (2) qui dégrade la couche de (3)

A
  1. Akkermansia muciniphila
  2. Sulfatase
  3. Mucine
50
Q

Mécanisme #2 pour le développement d’une colite ulcéreuse: augmentation de (1) qui produit des (2) inductrices d’(3)

A
  1. Provitellaceae
  2. Chemokines
  3. Inflammation
51
Q

En quoi une dysbiose peut causer de l’obésité?

A

Certains patients ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables

52
Q

Quels sont 4 facteurs d’exposition précoce menant à la formation du microbiote? (résumé/rappel de ce qui a été vu plus tôt)

A
  • Naissance par voie vaginale
  • Diète
  • Exposition à des antibiotiques
  • Microbes de l’environnement
53
Q

Une dysbiose peut être causée par 3 choses (3 types de maladies), quelles sont-elles?

A
  • Maladie du système immunitaire
  • Maladie intestinale
  • Maladie métabolique
54
Q

Une symbiose du microbiote gastro-intestinal permet 3 choses, quelles sont-elles?

A
  • Tolérance immune
  • Homéostasie intestinale
  • Métabolisme sain
55
Q

La manipulation du microbiome humain à des fins thérapeutiques serait un…

A

… traitement prometteur pour certaines maladies

56
Q

Quel serait un exemple de maladie pour laquelle la manipulation du microbiome à des fins thérapeutiques serait très prometteuse?

A

La diarrhée à C. difficile (réfractaire au traitement standard)

57
Q

En quoi consiste le nouveau traitement pour la diarrhée à C. difficile et quelle est son efficacité?

A

Transplantation de selles, efficace à 40-96%

58
Q

Qu’est-ce que les probiotiques?

A

Un mélange de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin

59
Q

Quel type de bactéries la majorité des probiotiques contiennent-ils?

A

Des bactéries Gram +

60
Q

Quels seraient 2 exemples de bactéries Gram positif que l’on retrouve dans les probiotiques?

A
  • Bifidobacterium

- Lactobacillus

61
Q

Quel serait un exemple de levure que l’on retrouve dans les probiotiques?

A

Saccharomyces

62
Q

Quelle est la condition pour qu’un probiotique soit efficace?

A

Il doit pouvoir se rendre à l’intestin

63
Q

Quels sont les 3 facteurs qui font varier l’efficacité d’un probiotique?

A
  • Les microorganismes choisis
  • La dose
  • La survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité)
64
Q

Chez quels patients observe-t-on des pouchites?

A

Les patients ayant une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale (ces patients n’ont plus de côlon, donc leur iléon est branché sur leur rectum)

65
Q

Quelle est la conséquence d’une colectomie avec anastomose iléo-rectale?

A

Puisque le côlon absorbe naturellement l’eau, les selles sont très liquides, ce pourquoi on met une poche

66
Q

Qu’est-ce qu’une pouchite?

A

Une inflammation de la poche (du réservoir) des patients ayant eu une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale

67
Q

Quel est l’avantage procuré par les probiotiques dans un cas pouchite?

A

Ils permettent d’enlever l’inflammation de la pouchite

68
Q

Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?

A

Une maladie qui touche l’intestin

69
Q

Chez qui observe-t-on des entérocolites nécrosantes?

A

Les enfants nés prématurément (à moins de 37 semaines de grossesse)

70
Q

Quelles sont les 3 manifestations d’une entérocolite nécrosante?

A
  • Gonflement de l’abdomen
  • Sang dans les selles
  • Air dans la paroi de l’intestin
71
Q

Quelles sont les 3+1(?) facteurs qui peuvent mener à une entérocolite nécrosante?

A
  • Pédisposition génétique
  • Intestin immunoréactif
  • Réponse inflammatoire immature
  • Dysbiose du tractus GI?
72
Q

Quel est le taux de mortalité associé à l’entérocolite nécrosante?

A

20-30%

73
Q

Quelles sont les 2 indications des probiotiques?

A
  • Pouchite

- Prévention de l’entérocolite nécrosante chez le prématuré

74
Q

Quelles sont les 2 contre-indications des probiotiques?

A
  • Prévention ou traitement de la DACD

- Patients immunosupprimés

75
Q

Peut-on donner n’importe quel probiotique à n’importe quel patient?

A

Non, car tous les probiotiques ne sont pas égaux