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biologie moléculaire & médicale > Maladies infectieuses > Flashcards

Maladies infectieuses Flashcards

1
Q

Maladies infectieuses
Agents pathogènes en cause (4)

A

Virus
Bactéries
Parasites
Champignons

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2
Q

Maladies infectieuses; Modes de transmission (2)

A

Direct: Contact peau à peau, contact muqueuse, contact avec du sang
Indirect: Aérosols, gouttelettes, surfaces ou aliments contaminés

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3
Q

Maladies infectieuses
On peut définir différentes catégories de maladies infectieuses (5)

A

Infections transmissibles sexuellement et par le sang (ITSS)
Infections respiratoires et saisonnières
Infections nosocomiales/infections résistantes (dans hôpitale)
Infections par des pathogènes entériques (intestinales)
Infections vectorielles et zoonoses (ex: moustique, puce)

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4
Q

L’étude des maladies infectieuses est coordonnée au Québec par l’INSPQ/LSPQ. Ils divisent ce champ d’expertise en 4 domaines:

A
  1. Immunisation
  2. ITSS et biovigilance
  3. Infections nosocomiales et risques infectieux en milieu de soins
  4. Surveillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses
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5
Q

TAAN veux dire?

A

techniques d’amplification des acides nucléiques (TAAN)

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6
Q

Avantages des méthodes TAAN en infectiologie

  1. Mé….
  2. Appl…
A
  1. Méthode de choix en identification de microorganismes
  2. Applications diverses
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7
Q

Désavantages des méthodes TAAN en infectiologie

  1. Qu…
  2. Qu’est-ce qu’on…
  3. Asp…
A
  1. Questionnements et indications cliniques
  2. Qu’est-ce qu’on cherche à identifier?
  3. Aspects de laboratoire
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8
Q

Les infections respiratoires sont c________, ont des caractères souvent s_____________et sont responsables d’infections n__________ et c_____________.

A

Les infections respiratoires sont courantes, ont des caractères souvent saisonniers et sont responsables d’infections nosocomiales et communautaires.

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9
Q

Infections respiratoires, populations à risque (5)

3 premier évident
4e logique
5e fourre tout

A
  1. Nouveaux-nés
  2. Personnes agées
  3. Femmes enceintes
  4. Patients immuno(déprimé/supprimé)
  5. Patients ayant certains facteurs de risque
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10
Q

Infections respiratoires, SAG: Syndrome d’allure grippale
Quels en sont les 4 signes classiques?

A
  1. Fièvre
  2. Toux
  3. Fatigue extrême
  4. Douleurs articulaires/musculaires
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11
Q

Respiratory syncytial virus (RSV) affecte plus quel population?

A

Les enfants

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12
Q

Les infections respiratoires atteignent leur pic vers saisons?

A

Automne et hiver

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13
Q

Causant des infections respiratoires:

Donne moi trois virus

Donne moi trois bactérie

A
  1. RSV Respiratory scyncytial virus
  2. Influenza A/B
  3. Adénovirus
  4. Staphylococcus aureus
  5. Bordetella pertussis
  6. Chlamydia pneumoniae
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14
Q

% de population canadienne infecté au moin 1 fois par SRAS-CoV-2?

A

60%

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15
Q

SRAS-CoV-2, transmission?

A

Principalement une transmission personne-à-personne par gouttelette-contact

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16
Q

SRAS-CoV-2, Infectiosité
La probabilité de transmission est plus grande lorsque la charge virale est le plus élevé (Ct < ?)

La probabilité de transmission devient basse à un Ct de combien?

A

Cycle treshold de < 24

Ct ≥ 30

17
Q

SRAS-CoV-2, Infectiosité

Infectiosité débute environ ___ jours avant le début des Sx

Le pic d’infectiosité est à ____ jours avant et ____ jours suivant
l’apparition des Sx.

L’infectiosité est quasi-nulle __-___ jours après le début des Sx

La médiane de clairance virale est de ___ jours

A

2.3 jours

0.7 jours et 2 jours

7-10 jours

30 jours

18
Q

SRAS-CoV-2, SŜ à la présentation initiale:
1. Symptômes…
2. Symptômes…
3. Symptômes…
4. Symptômes…

A
  1. Symptômes respiratoires
  2. Symptômes généraux
  3. Symptômes GI
  4. Symptômes neurologiques
19
Q

SRAS-CoV-2, SŜ à la présentation initiale (génétique):
1. Symptômes respiratoires (3)
2. Symptômes généraux (4)
3. Symptômes GI (2)
4. Symptômes neurologiques (1)

A

Toux
Essouflement ou difficulté à respirer (Dyspnée)
Nez qui coule (Rhinorrhée)

Fièvre
Maux de tête
Douleur musculaire (Myalgie)
Mal de gorge

Diarrhée
Nausée / vomissements

Perte d’odorat (Anosmie)

20
Q

SRAS-CoV-2, Évolution clinique fréquente suivant les SŜ à la présentation initiale?

A

Pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan

21
Q

Spectres de sévérités des infections
1. As…, x-y%
2. At…, x%
3. At…, y%
4. At…, z%

Mortalité global estimée à ?%

A
  1. Asymptomatiques: Estimé à 30-40% des infections
  2. Atteinte légère: Estimé à 81%
  3. Atteinte sévère: Estimé à 14%
  4. Atteinte critique: Estimé à 5%

Mortalité global estimée à 2.3%

22
Q

Pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan, 4 signes

O…
O… et c…
É…. ….
É…. ….

Console mes pleures Agacant Interminable

A

Opacification
Opacification et consolidation
Épaississement pleural adjacent
Épaississement interlobulaire

23
Q

SRAS-CoV-2 – Aspects laboratoire le test initial de détection est centré autour de quel gène?

A

Gène E

24
Q

SRAS-CoV-2 – Aspects laboratoire
Processus optimale en 5 étapes:

Phonétique HIER mnémonique IEAIR

A
  1. Inactivation
  2. Extraction
  3. Amplification
  4. Interprétation
  5. Rapport
25
Q

SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux

Phase analytique: Quels problèmes? (3)

Phase pré-analytique: Quels problème? (1)

A
  1. Baisse des réactifs d’extraction
  2. Rupture de stock de réactifs d’extraction
  3. Qualité des sondes et amorces
  4. Rupture de stock de milieu de transport UTM/VTM (Universal/Virus Transport Media)
26
Q

SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique -Baisse des réactifs d’extraction

C’est quoi la solution?

Avantages (2) vs désavantages (3)

A

Stratégie de pooling (pool patients ensemble avant extraction)

Avantages:
1. Capacité analytique ↑
2. Réactifs d’extraction ↓

Désavantages:
1. Temps technique ↑
2. Quel population ciblé/poolé ensemble?
3. Utilité du pooling dépend de l’incidence

27
Q

SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique - Rupture de stock de réactifs d’extraction

C’est quoi la solution?

Avantages (2) vs désavantages (2)

A

Développement d’une stratégie sans extraction (lyse thermique)

Avantages:
1. Plus besoin de réactifs
2. Inactivation et extraction même étape

Désavantages:
1. Pas de pool possible
2. Nécessite l’ajout d’un contrôle interne

28
Q

SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique - Qualité des sondes et amorces

C’est quoi le problème?
C’est quoi la solution?

A

P: Sondes et amorces contaminés par séquences de SRAS-CoV-2

S: Séquençage des sondes/amorces au LSPQ avant distribution aux laboratoires

29
Q

SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase pré-analytique - Rupture de stock de milieu de transport

C’est quoi la solution?

A

Réception au laboratoire de n’importe quel milieu de transport mais, tous ces milieux ont dû être validés exhaustivement pour chaque méthode.

30
Q

Progression de l’emplacement du prélèvement sur l’humain?
1. → 2. → 3.

A
  1. Nasopharyngé → 2. Oro-nasal → 3. Salive et gargarisme (G-SPIT)
31
Q

Comment gérer un patient se présentant avec SAG à l’urgence?

A

L’obtention de résultats rapides et différentiel pour distinguer différents types d’infections respiratoires devient un pré-requis important pour les équipes de soins.

32
Q

Multiplex respiratoires, Test de Éric développé pour détection de quel genre de virus? (4)

A

COVID
Influenza A
Influenza B
RSV

33
Q

Interférences dans un multiplex melting qPCR (4)

1 évidente
2 moin évidente, 2 mot clé
dernière pense LCMS

A
  1. Channeling
  2. Sensibilité relative des sondes
  3. Optimisation des mastermix
  4. Intégration systématique de contrôles internes
34
Q

Influenza A/B
Glycoprotéine de surface?
Changement antigénique?
Humain ou zoonotiques?

A

A = hémaglutinine, fréquents, réservoirs zoonotiques
B = neuraminidase, peu fréquents, exclusivement humain

35
Q

Virus respiratoire syncitial (RSV); Épidémiologie (2)
E______
S______

A

Enfats
Saisonnière

36
Q

Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; transmission?

A

Les deux contact et par aérosol

Influenza = nosocomiale aussi

37
Q

Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; SŜ?

A

Influenza = SAG

RSV = Toux, fièvre, détresse respiratoire (enfant) ou écoulement nasal (adulte)

38
Q

Influenza A/B; Complications (4)

Virus respiratoire syncitial; Complications (1)

A

Influenza
Complications respiratoires
Complications musculaires
Complications cardiaques
Complications nerveuses

RSV = Complications respiratoires

39
Q

Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; Tx

A

Influenza = Tamiflu

RSV = Ribaflavin

biologie moléculaire & médicale (2 decks)

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