MBE kk trece predavanje

Question 1

šta je editovanje RNK

Answer 1

post-transkripciona promena sekvence RNK tako da se ona razlikuje od sekvence
gena.

Question 2

koje su dve vrste editovanja kod sisara

Answer 2

C u I- citidin dezaminaze i A u I- adenozin dezaminaze

Question 3

Inozin se u pogledu sparivanja baza ponaša
kao

Answer 3

guanozin

Question 4

ko ima adar od organizama

Answer 4

živitinje, biljke i gljjive nemaju

Question 5

dva zajednička domena svih adar proteina

Answer 5

dsRBD i dezaminazni domen

Question 6

kakvi su ADAR geni i gde se eksprimiraju

Answer 6

esencijalni, u skoro svim ćelijama

Question 7

šta su supstrati adar proteina

Answer 7

dvolančane RNK duže od 20bp

Question 8

šta prepoznaju proteini ADAR

Answer 8

specifičnu strukturu dsRNK, a ne sekvencu!

Question 9

čime je određena efikasnost i specifičnost editorske aktivnosti

Answer 9

stabilnošću i strukturom dsRNK

Question 10

kako se edituju duge, a kako kratke dsRNK

Answer 10

duge perfektne se edituju na više mesta neselektivno, a kratke na tačno određenim mestima, kao i duge neperfektne

Question 11

da li editovanje specifičnih A u supstratima destabilizuje ili stabilizuje supstrat

Answer 11

destabilizuje do momenta kada ADAR više ne prepoznaje strukturu kao dsRNK (i se više ne sparuje sa u i onda dolazi do odvezivanja na tim mestima)

Question 12

tri tipa editovanja A u I

Answer 12

editovanje spcifično za mesto
hipereditovanje
editovanje prekursora malih regulatornih RNK

Question 13

koje su posledice editovanja A u I

Answer 13

promena informacionog sadržaja i strukture RNK i stabilnosti

Question 14

kako interpretiraju ribozom i splajsozom inozin

Answer 14

kao guanozin

Question 15

šta se edituje u editovanju spec za mesto

Answer 15

edituje se jedan ili nekoliko A i to u kratkim dsRNK ili dugim neperfektnim, koje se formiraju spajanjem dela egzona i introna. A se edituje u kodirajućem regionu

Question 16

čemu doprinosu editoanje spec za mesto

Answer 16

diverzifikaciji proteoma

Question 17

šta se edituje pri hipereditovanju

Answer 17

edituje se veliki broj A (50%) i to u perfektnim dugačkim dsRNK nastalim invertovanim Alu ponovcima u intronima i netranslatirajućim regionima gena

Question 18

čemu doprinosi hipereditovanje

Answer 18

diverzifikaciji transkriptoma, razlikovanje svojih od tuđih dsRNK- epitranskriptomska regulacija

Question 19

kako ADAR proteini regulišu RNK interferenciju

Answer 19

hipereditovanjem prekursora siRNK, editovanjem specifičnih A u prekursorima miRNK

Question 20

kako deluje editovanje A u i na ekspresiju gena

Answer 20

1) u 3prim UTR- nekodirajućem delu- utiče na stabilnost RNK
2)u egzonima utiče na stvaranje proteinskih izoformi menjanjem kodona koji kodiraju za specifične aminokiseline- zamena aminokiseline- rekodiranje
3) u intronim utiče na stvaranje proteinskih izoformi modifikovanjem mesta splajsovanja
4)kod miRNK regulišu interferenciju

Question 21

šta je rekodiranje

Answer 21

promena značenja kodona, čime se stvaraju nove proteinske izoforme koje se fino razlikuju u efikasnosti, ali nose istu ulogu

Question 22

kako editovanje a u i može da promeni obrazac splajsovanja

Answer 22

dodavanjem novih 5prim mesta, dodavanjem ili brisanjem 3prim mesta, brisanjem mesta grananja

Question 23

koja je Klučna i evoluciono konzervisana uloga
proteina ADAR1

Answer 23

tolerancija na urođeni imuni sistem

Question 24

šta su parapege

Answer 24

nukleusna tela sa ulogom u nuklearnoj retemciji hiperditovanih transkripata

Question 24

uloge hipereditovanja

Answer 24

nukleusna retencija geneza kružnih RNK- suprimira stabilnost transkripata razlikovanje svijih i stranih dsRNK egzonizacija Alu