Module 2 : L'enveloppe cellulaire partie 2 Flashcards
Quelle est la différence entre les Gr+ et Gr- au niveau de l’épaisseur de la membrane?
Couche de peptidoglycan plus épaisse pour Gr+
Quelle est la différence entre les Gr+ et Gr- au niveau de la composition des membranes?
Acide aminé en position 3 dans le peptidoglycan
Gr+ : L-Lysine
Gr- : acide diaminopumélique (DAP)
Quelle est la différence entre les Gr+ et Gr- au niveau du lien interchaine du peptidoglycan?
-Les Gr- font des liens direct
-Les Gr+ font des ponts peptiques
Le petidoglycan contient des acides aminés particuliers, quels sont-ils (a) et quels avantages sont-ils amenés par l’utilisation de ces acides aminés plus rares (b)?
A) D-glutamine et D-alanine
B) L’utilisation d’acide aminé de la série D (au lieu de L) rend la paroi plus résistante aux peptides et aux protéases fréquemment rencontrées.
Quels sont les principaux précurseurs du peptidoglycane? (4)
1) Acide diaminopumélique (DAP)
2) Ornithine
3) Acide N-acétylmuramique
4) Acides aminés de la série D
De quelles voies connues proviennent les principaux précurseurs du peptidoglycan?
A) DAP
B) Ornithine
C) Acide N-acétylmuramique
D) Acides aminés de la série D
A) Intermédiaire de la synthèse de la lysine
B) Intermédiaire de la synthèse de l’arginine
C) À partir du N-acétylglucosamine (grâce à MurA et MurB)
D) Produits à partir de ceux de la série L, à l’aide d’isomérases
Que signifie l’acronyme PBP?
Penicillin binding protein
Quel est le rôle de PBP?
Joue un rôle dans l’assemblage du peptidoglycane en catalysant les réactions de transpeptidation et de transglycosylation.
Ces interactions permettent d’intégrer de nouvelles sous-unités de peptidoglycane à l’intérieur de la chaine et d’ajuster la réticulation par des liens peptidiques directs (Gr-) ou des ponts peptidiques (Gr+)
Vrai ou faux?
La molécule d’acide N-acétylmuramique est aussi retrouvée dans la paroi des végétaux?
Faux, exclusive aux procaryotes
Vrai ou faux?
L’acide aminé D-glutamate du pentapeptide est lié à l’acide aminé suivant par sa fonction gamma, et non sa fonction alpha.
Vrai
Vrai ou faux?
Chaque unité de peptidoglycane est liée à 2 autres unités par un pont interchaîne.
Faux,
le niveau de réticulation est variable selon les conditions de croissance
Quel est le point en commun entre la L-ornithine, la L-lysine et l’acide diaminopumélique (DAP)?
1) Ce sont des acides diaminés (ont 2 groupements amine)
Qui-suis-je? « Acide aminé qui fait le lien entre les positions 2 et 4 du pentapeptide »
L-Ornithine
Qui-suis-je? « Acide aminé qui fait le lien entre les positions 3 et 4 du pentapeptide »
2 réponses possibles :
L-lysine (Gr+)
Acide diaminopumélique (DAP) (Gr-)
Pourquoi le pentapeptide du précurseur UDP-N-acétylmuramique se termine-t-il par 2 alanines si la dernière est éliminée lors de l’insertion dans le peptidoglycane? À quoi ça sert?
L’énergie de la liaison brisée entre l’alanine en position 4 er l’alanine qui est éliminé en position 5 lors de la formation des liens interchaine fournit l’énergie nécessaire pour faire une liaison peptidique à l’extérieur du cytoplasme.
** ABSOLUMENT NÉCESSAIRE car synthèse a lieu dans le périplasme et il n’y a pas d’ATP à cet endroit
Au niveau de la composition, quelles sont les principales différences entre les acides teichoïques (WTA) et les acides lipoteichoïques (LTA)?
L’unité de liaison est différente.
WTA : ribitol + glycérol
LTA : glycérol
Au niveau de la synthèse et assemblage, quelles sont les principales différences entre les acides teichoïques (WTA) et les acides lipoteichoïques (LTA)?
LTA:
-Unité de liaison formée dans le cytoplasme directement sur un diacyglycérol (DAG) présent dans le feuillet interne de la membrane et est transférée dans le périplasme par une flippase.
-Ajout (polymérisation) des unités d’oses supplémentaires (glycérol) a lieu dans le périplasme
WTA:
-Forme une molécule complète traversant la bicouche et attachée de façon transitoire à l’undécaprénol, puis un transporteur ABC assure son transfert au périplasme
-L’ajout d’oses supplémentaires (alditols) a lieu dans le cytoplasme
-Ajout d’acides aminés sur les alditols, dans le périplasme
-Libérés de l’undécaprénol et transférés au peptidoglycane par le complexe protéique LCP
Décrire la composition de la membrane externe des Gr-. Quelle est la principale particularité de cette membrane en comparaison avec la membrane plasmique?
1) Le feuillet interne a une composition similaire à la membrane plasmique (glycérophospholipides et protéines principalement)
2) Le feuillet externe de la bicouche est composé de LPS plutôt que de GPL
3) Membrane externe est bcp moins perméable que la membrane interne
Via quelles molécules les nutriments sont-ils transportés au travers de la membrane externe des Gr-?
Via des porines. Elles laissent entrer les molécules de taille inférieure à 600 Da
Quel système de synthèse/export des polysaccarides est le plus utilisé lors de la production de :
A) Antigène O
B) Capsule de Gr-
C) Capsule de Gr+
A) Wzx/Wzy dependant pathway
B) ABC transporter-dependant pathway
C) Wzx/Wzy dependant pathway
À quoi sert le sentier Mla?
À la récupération des GPL qui se seraient trouvés accidentellement dans le feuillet externe de la membrane externe.
Le sentier Mla permet de maintenir la grande asymétrie de la membrane externe.
Quels sont les avantages (4) conférés par la présence d’une capsule, d’une couche visqueuse (slime-layer) ou d’un glycocalyx?
1) Résistance à la dessiccation (hydrophile)
2) Résistance aux agents toxiques hydrophobes
3) Facteur de pathogénicité et virulence
4) Récepteurs pour les phages/résistance aux phages
Quelle est la différence entre une capsule, une couche visqueuse (slime-layer) et un glycocalyx?
Glycocalyx : terme utilisé pour décrire toutes les structures extra cellulaires (englobe la capsule, les couches visqueuse et parfois même la couche S)
Capsule : Constituée de polysaccharides, fermement attachée à l’enveloppe
Slime-layer : Une partie du matériel extra cellulaire, dont les polysaccharides, se retrouvent dans le milieu. Les liens avec l’enveloppe sont très faibles ou même absent.
Quelle est la différence entre le glycocalyx et la couche S (S-layer)?
Glycocalyx : composé principalement de polysaccharides
Couche-S : composé principalement de protéines ou de glycoprotéines