Module 3 - Les Acides Aminés Flashcards by Andréanne Benoit

Q

Les protéines ont une variété de fonctions nomme en 3 et décrit les

A

Catalyse: De nombreuses protéines sont des enzymes. La grande majorité des réactions chimiques du vivant sont catalysées par des enzymes. Il existe des milliers d’enzymes différentes dans la cellule.

Transport : Certaines protéines permettent le transport de petites molécules ou d’ions d’un endroit à un autre dans l’organisme (ex. : hémoglobine).
Stockage des nutriments : Elles peuvent également servir à la mise en réserve d’un élément ou d’une molécule nécessaire à l’organisme (ex. : ovalbumine et caséine).
Structure : Les protéines sont responsables de la forme et de la rigidité des cellules, des tissus et des organes (ex. : kératine et collagène).
Mouvement : Des assemblages de protéines confèrent aux cellules la capacité de se mouvoir et aux muscles de se contracter (ex. : myosine).
Décodage de l’information génétique : Plusieurs protéines participent aux processus de transcription et de traduction (ex. : ADN polymérase). Elles peuvent également activer ou inhiber l’expression des gènes.
Régulation : Certaines protéines servent d’hormones ou de récepteurs hormonaux responsables du contrôle de différentes activités cellulaires.
Défense ou agression: Il existe des protéines dont le rôle est de défendre les organismes contre des organismes étrangers et hostiles (ex. : anticorps) ou d’aider à l’attaque d’une proie (ex. : venin).

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Q

Comment nomme-t-on les vingts acides aminés qui constitue les unités de base servant à la construction des protéines

A

Les acides aminés standard

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Q

Quel role joue les acides aminés non standard?

A

Neurotransmetteurs, hormones ou des intermédiaires métaboliques important

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Q

Tous les acides aminés standards sont des …

A

Acides alpha-aminés

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Q

Touts les a.a standards peuvent être décrit par la formule dans laquelle la lettre R désigne la chaîne latérale. Quel est l’exception?

A

La proline, structure circulaire, ne possède pas de groupement amine primaire, mais un groupement amine secondaire

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Q

Quel a.a ne possède pas d’activité optique

A

La glycine, n’est pas chirale

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Q

Nommez 3 caractéristiques communes aux acides aminés protéogéniques. Identifiez les 2 exceptions

A

ils sont tous des acides alpha-aminés
ils ont tous une fonction carbonyle et une fonction amine primaire (sauf la proline)
ils ont tous une activité optique (sauf la glycine)

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Q

Quel sont les deux a.a qui sont des isomères de structure

A

L’isoleucine et la leucine

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Alanine

A

A, Ala, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Arginine

A

R, Arg, polaire, chargé +

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Asparagine

A

N, Asn, polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Acide aspartique ou aspartate

A

D, Asp, polaire, chargé -

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Cystéine

A

C, Cys, polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Acide glutamique ou glutamate

A

E, Glu, polaire chargé -

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Glutamine

A

Q, Gln, polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Glycine

A

G, Gly, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Histidine

A

H, His, polaire, chargé +

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Isoleucine

A

I, Ile, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Leucine

A

L, Leu, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Lysine

A

K, Lys, polaire, chargé +

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Méthionine

A

M, Met, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Phénylalanine

A

F, Phe, non polaire

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Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Proline

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A

P, Pro, non polaire

Q

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité

Sérine

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A

S, Ser, polaire

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité Thréonine

T, Thr, polaire

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité Tryptophane

W, Trp, non polaire

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité Tyrosine

Y, Tyr, polaire

Donne le code à trois lettre, à une lettre, la charge et la polarité Valine

V, Val, non polaire

Les a.a standards sont des acides faibles polyprotique, explique

Ils ont tous au moins 2 pKa

Une courbe de titration permet de determiner …

Les valeurs des pKa d’un a.a ainsi que la valeur de son point isolélectrique

Qu’est-ce qu’un zwitterion

Molécule possédant à la fois une charge positive et négative, donc une charge nette nulle Aussi appelé ion hybride ou ion dipolaire

Qu’est-ce que le pI

Le pH auquel la totalité des molécules de l’a.a est sous forme de zwitterion

Le pI depend de quoi?

La somme des pKa divisé par 2

Quelle est la différence entre un a. Alpha-aminé et un a. Beta-aminé

Les acides alpha-aminés portent leur groupement amine sur le carbone alpha, tandis que le groupement amine d’un acide beta-aminés est lié au carbone beta.

Quels acides aminés protéogéniques ont la capacité d’absorber les rayons ultraviolets?

Les acides aminés possédant un cycle aromatique: la phénylalanine, la tyrosine e le tryptophane

Quels sont les acides aminés contenant un groupement hydroxyle?

La sérine, la thréonine et la tyrosine

Quels sont les acides aminés beta-hydroxylés?

La sérine et la thréonine

Quels acides aminés possèdent plus d’un carbone asymétrique?

L’isoleucine et la thréonine

Quel acide aminé possède un groupement amine secondaire?

La proline

Quel est l’acide aminé le plus basique?

L’arginine, c’est celui dont le second groupement basique ionizable a le plus grand pKa

Quel acide aminé contient un groupement thioéther?

La méthionine

Dans la nature, quelles molécules contiennent des a.a de la série D?

Les parois bactériennes e certains antibiotiques

Quel est le rôle principal de ces composés - GABA - Histamine - thyroxine

GABA: neurotransmetteur Histamine : neurotransmetteur Thyroxine : hormone, pro hormone

Les 20 a.a standards peuvent être divisés en 7 classe selon la nature de leur chaîne latérale. Nomme les

``` Chaine latérale aliphatique Fonctions apha-iminoacide Cycle aromatique Atome de soufre Groupement hydroxyle Deuxième groupement basique Deuxième groupement amine et leur dérivé amide ```

Quelle est la classification d’a.a la plus utilisée?

Selon la polarité

Quels sont les 4 groupe de la classification selon la solubilité

Non polaire Polaire non chargé Polaire chargé, acide Polaire chargé, basique

Quels les deux a.a polaire chargé qui sont acide

Aspartate et le glutamate

Quels sont les 3 a.a polaire chargé , basique

Histidine, lysine et arginine

Certains a.a non standard servent de médiateurs chimiques: Hormones et neurotransmetteur Définit les

Hormones: sécrétés par les glandes, peuvent circuler dans le sang et agir à distance Neurotransmetteur: sécrétés par des neurones et agissent à courte distance, généralement sur d’autre neurone

Qu’est-ce qu’une modification post-traditionnelle, chez qui le retrouve-t-on?

Certains a.a non-standards font leur apparition dans la chaîne polypeptidique suite à la modification chimique d’a.a qui sont déjà intégrés à la chaîne Chez les procaryote et eucaryote

Qu’est-ce qu’une molécule amphotère

Une molécule qui peut se comporter comme un acide et une base à la fois. Portent une fonction acide (groupement carboxyle, -COOH) et une fonction basique (groupement amine, -NH2)

Défini ce qu’est un pK1 et un pK2

PK1: ionisation du groupement alpha carboxyle PK2: ionisation du groupement alpha amine

7 a.a standards possèdent une chaîne latérale R qui peut s’ioniser, ils ont un troisième pKa, comment l’appelle-t-on?

PKr, associé au groupement ionisable de la chaine latérale

Quel est la charge nette d’un a.a ayant que 2 groupement ionisable qui possède à la fois une charge positive et une négative?

Charge nette de 0

Quand retrouve-t-on une délocalisation de la charge

Fréquemment lors de la présence d’un groupement portant une charge et une double liaison Observe pour les chaînes latérale de l’histidine, le glutamate et arginine, aspartate