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Bio intégrative 2 > module 5 > Flashcards

module 5 Flashcards

(51 cards)

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1
Q

Quelles sont les 3 causes majeurs des extinction en Amérique du Nord (anthropique)

A

Destruction et dégradation habitat

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2
Q

Comment est la taille des population despèces ménacées

A

Petite population ou des populations en déclin démographique

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3
Q

Comment est la diversité génétique des espèces ménacées par rapport aux espèces non menacées

A

la divrsité génétique est beaucoup plus faible, moins d’hétérozygotie

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4
Q

Que sont les trois points de l’article obligatoire du module

A

1- Une plus grande diversité génétique provoque une plus grande valeur sélective, survie améliorée

2-Les espèces menacées ont une diversité génétique plus faible que les espèces non menacée

3- La diversité
variation résiduelle est une variaation utle pour s’adapter. Même si neutre maintenant, ce pool peut être utile plus tard ,face à des changements environnmenaux futur
génétique neutre n’a pas d’impact en conservation pour une petite popu

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5
Q

Reproduire Schéma du paradigme des petites population

A

Ok

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6
Q

Quel est l’impact de la réduction de la taille de la population Sur la génétique ?
expliquez différente étape qui y mene

A
  • Diminution de la taille efficace (Ne)
  • augmentation de la dérive génétique
  • Diminution génétique

Reducitont taille = reproduction apparenté

  • Consanguinité
  • Diminution de la diversité génétique
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7
Q

Que sont les impacts de la diminution de la diversité génétique

A

Perte du potentiel d’adaptation

Augmentation Dépression de consanguinité

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8
Q

Quelle est la différence de la taille efficace et l’abondance de population
Que sont ses caractéristiques

A

Taille efficace= plus petite que taille de popu

La valeur de N corrigée pour mieux prédire le « patron
génétique » d’une population réelle comme si elle était « idéale » .

Valeur de N :

Nombre constant
génération discrète
nombre égal de mal et de femlle
proba égale de succès reproduction

On corrige pour mieux comprendre

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9
Q

Est ce que le Ne ou le N qui prédit la diversité génétique et le niveau de consanguinité
(= capa popu à maintenir sa diversité génétique)

A

Ne

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10
Q

Qu’est ce qui détermine la capacité d’une population à maitenir sa diversité génétique intiale

A

Diversité génétique et niveau de consanguinité

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11
Q

A quoi ressemble el rapport Ne/N ? pourquoi

A

en dessous de 1 car Ne < N

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12
Q

Que sont les 3 choses qui réduisent le rapport Ne/N

En gros qui réduisent le Ne ou augmente le N

A

1- Fluctuation temporelle de Ne
2-Variance du succès reproducteur
3-Rapport de sexes inégal

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13
Q

Qu,est ce que la fluctuation temporelle de Ne ( l’un des 2 qui réduisent le Ne)

A
  • Les populations changent naturellement en abondance

Si Goulot étranglement –> baisse subiote

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14
Q

comment calculer le Ne

A

moyenne harmonique des effectis efficaces de chaque génération

1/Nombre génération
x 1/Nonbre gene 1 x 1/Nombre gene2….etc…

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15
Q

Que explique le Ne ? comment l’interpreter

A

Nombre d,individus qui ont contribués efficacement à la reproduction sur les trois dernières génération

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16
Q

Qu,est ce que la variance du succès reproducteur

A

Dans une popu idéale monogame, contribution en gamète de chaqu reproducteur à la géné suivante ; Distribution poisson

un individu donne 2 gamètes à la génération suivante

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17
Q

Est ce que dans les populations sexuées il y a un rapport égal de male femelle

A

non

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18
Q

Comment calculer le total reproducteur

La taille efficace corrigée qui tient compte des rapports inégaux

A

N= Nm + Nf

Ne =4 NmNf/Nm+Nf

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19
Q

Si on a 8 male et 2 femlle, quel est l’impact sur L,hétérozygotie

A

Perte hétérozygotie plus rapide que si composait 5 males 5 femelles

Pour les populations avec un rapport des
sexes inégal, les proportions
d'hétérozygotes diminuent généralement
plus vite que les valeurs théoriques de
H(t).
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20
Q

Comment calculer l’hétérozygotie théorique H(t)

A

Ht ( 1-1/2N) ^t

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21
Q

Donne une définition de la dérive génétique

Study These Flashcards
A

fluctuations stochastiques de la fréquence allélique qui sont
strictement liées à un échantillonnage au hasard des gamètes à chaque génération.

22
Q

Peut ont prédire la dérive génétique

Study These Flashcards
A

De telles fluctuations défient toute prédiction au sein d’une seule population. Cependant, le
patron moyen ou espéré au sein d’un nombre élevé de populations

23
Q

QUe sont les 4 stipulas qui permettent de prédire les patrons de la dérive génétique

Study These Flashcards
A
  1. L’ampleur des fluctuations des fréquences alléliques est inversement
    proportionnelle à la taille de la population.
  2. Les populations, toutes identiques au départ, se différencient avec le temps.
  3. Ce processus s’effectue plus lentement dans les populations de plus grandes tailles.
  4. En absence de l’effet de d’autres forces évolutives, toute population se dirige
    inéluctablement vers un état de fixation d’allèle (s) (fréquence = 1,0) c’est-à-dire
    d’hétérozygotie 0…
24
Q

Comment varient Ht et Ft ( hetero et consanguin ) dans le spopulation

Study These Flashcards
A

Ht: diminue avec taille popu et est plus prononcée
Ft: augmente avec taille popu et est plus prononcée

25
Donnez des exemple sde diminution de L'Hétérozygotie qui cause apparition des allèles délétère
Condor de Californie: Chondrodystrophie - une maladie qui cause des malformations sévères (‘nanisme’ des os longs) et même la mort. Due à l’homozygotie d’un allèle récessif. Lion du Gir (Inde): Réduction du potentiel reproducteur: réduction de la densité et de la mobilité des spermatozoides. Affaiblissement du système immunitaire Cougar de Floride : Malformations morphologiques congénitales
26
Qu'est ce que la depression de consanguinité (DC)
Diminution de la moyenne des caractères associés à la valeur sélective (fitness) chez la progéniture consanguine Commune chez une variété d’organismes
27
Citez 5 composantes du fitness reproducteur sujette à la DC (dépréssion de consanguinité)
``` nombre de rejetonsà taux de survie des juvéniles, longévité fertilité capacité d’accouplement, quantité,qualité du sperme, ```
28
Comment varie la DC
Dépendant de la fréquence des allèles délétères (élément stochastique) Allèles délétères peuvent être absents ou fréquents, dépendamment de la population Plusieurs loci influencent le fitness reproducteur
29
Qu'est ce qui explique que les population ont une occuranence d'allàle délétaire du à la dérive différentes
Due à différence de susceptibilité à la DC
30
Comment on estime le F individuel
Avec la relation de H avec F
31
Dans l'exemple des moutons, quelle est l'implication de la selection contre individus consanguib
DC - la consanguinité rend les individus plus susceptibles à la mortalité causée par les variations environnementales
32
Comment les effets négatif de la Dc peuvent se faire reversé Expliquez comment
en croisant avec des population GÉNÉTIQUEMENT DIFFÉRENCIÉ = > augmentation de la variation génétique = > masque les allèles à effet néfaste = > favorise les phénotypes bénéfiques
33
Qu'est il très importantnt pour voir si un sauvetage génétique a été réussie
Il faut observer une augmentation de l'abondance , il faut que ce soit à long terme Augmentation de l’abondance qui reflète une augmentation de la valeur sélective absolue
34
Comment voir si un sauvetag ea été réussie
Sauvetage génétique réussi = flux de gènes conduit à une augmentation dans la croissance de population, au delà de l’effet démographique des immigrants !
35
De quelle manière le sauvetage génétique peut se produire
- Vigeur hybride (ou hétérosis): valeur sélective élevée de la progéniture issue des croisements entre individus génétiquement divergents relativement à la population d”origine - Évolution adaptative: augmentation des phénotypes avantageux dans une population issue du résultat de la sélection naturelle sur la variation génétique
36
Est ce que le sauvetage génétique est répendue ?
non
37
Quelle sont les peurs liées au sauvetage génétique ? Peuvent ils être évités ?
- Dépression hybride (“outbreeding depression” ) = perte de valeur sélective lorsque deux populations trop différentes génétiquement sont croisées - Perte de l’adaptation locale = > Grâce aux récentes avancées en génomique on peut désormais évaluer ces paramètres et largement les éviter
38
Les bénéfices du sauvetage génétique sont ils différents entre invertébrés, vertébrés et plantes
Non
39
Jusqu'à quelle génération les effets du sauvetage génétique
3
40
Dans l'exemple des guppies, que peut on en conclure
les hybrides vivent plus longtemps que les résidents ou immigrants Les hybrides se reproduisent plus que les résidents ou immigrants => Le flux de gènes a non seulement permis d’augmenter la diversité génétique mais la variation génétique apportée par les immigrants combinée aux allèles de la population puit a résulté en une meilleure valeur sélective des hybrides et de ce fait en une augmentation de la taille des populations
41
S'il ya de multiples populations consanguine que faut il faire
Penser à un sauvetage génétique (optimiser le flux de gène) mais regarder aussi : - Est que croisement rsulterait en dépréssion hybride si non : Est-ce que le croisement résulterait en un sauvetage génétique utile ? si oui : ``` Optimiser flux de gènes en utilisant les relations de parenté si possible, autrement utiliser les principes basique de génétique de la conservation ```
42
Si on veut faire un sauvetage génétique mais qu'ya pas d’autres populations isolées qui peuvent être utilisées pour le croisement ?
Gérer la population pour maximiser Ne et la considérer ‘fragile’ et minimiser les menaces non-génétiques
43
si on veut faire un sauvetage génétique mais que le croisement résulterait en dépression hybride, que faire ?
Pas d’option de gestion génétique bénéfique. Considérer ‘fragile’ et minimiser les menaces non-génétiques
44
donnez une définition du sauvetage évolutif
= adaptation génétique permettant le rétablissement d’une population face à un changement environnemental induisant des effets démographiques qui auraient pu causer l’extinction
45
Qu'est ce que la variation gnétique résidielle
tion génétique résiduelle; ce qu'ona dans une popu à un temps T
46
Que osnt les trois types de sauvetage
démographique génétique | évolutif
47
Comment calculer diversité pour haplotype
1- ensemble p^2
48
Donnez une définition du NE
La taille de population efficace correspond au nombre d’individus qui participe réellement à une population génétiquement parlant. Au sein d’une population tous les individus ne se reproduisent pas et ce n’est finalement pas la taille de population absolue qui détermine la variabilité et la dérive génétique d’une population. La taille de population efficace se note Ne et est généralement inférieure à la taille de population absolue, notée N
49
Que sont les 4 question à se poser avant de faire un sauvetage génétique
``` 1- Y-a-t’il de multiples populations, consanguines ? 2-2- Y-a-t’il d’autres populations isolées qui peuvent être utilisées pour le croisement ? Ré-évaluer la taxonomie si nécessaire ``` 3- Est-ce que le croisement résulterait en dépression hybride ? 4- Est-ce que le croisement résulterait en un sauvetage génétique utile ? ( si pas de depression hybride
50
Si jamais il n,ya pas d’autres populations isolées qui peuvent être utilisées pour le croisement que fait ont
Gérer la population pour maximiser Ne et la considérer ‘fragile’ et minimiser les menaces non-génétiques
51
Quand utiliset-on le sauvetage évolutif Comment cela doit-il se faire ?
adaptation génétique permettant le rétablissement d’une population face à un changement environnemental induisant des effets démographiques qui auraient pu causer l’extinction Le sauvetage évolutif exige également un changement environnemental et le sauvetage de l'extinction doit se faire via une évolution adaptative à l'environnement

Bio intégrative 2 (4 decks)

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