Molekularna biologija prezentacija Flashcards
(101 cards)
1
Q
Шта је нуклеотид?
A
Нуклеотид је основна јединица грађе нуклеинских киселина
2
Q
Шта изграђује нуклеотид?
A
- Пентозни шећер (дезоксирибоза, рибоза)
- Фосгатна група
- Азотна база
3
Q
Како се деле азотне базе?
A
На пуринске (А,Г) и пиримидинске (Ц, Т, У)
4
Q
Како се нуклеотиди међусобно повезују у полинуклеотидни ланац?
A
Фосфодиестарским везама
5
Q
Шта чини полинуклеотидни ланац?
A
Полинуклеотидни ланац чине нуклеотиди међусобно повезани фосфодиестарским везама
6
Q
Шта формира фосфодиестарске везе, на хемијском нивоу?
A
Фосфатна група са једног нуклеотида и OH група са 3C атома шећера суседног нуклеотида
7
Q
По чему се разликују грађе ДНК и РНК?
A
- Дволанчани хеликс/један полинуклеотидни ланац
- Пентозни шећер дезоксирибоза/рибоза
- Азотне базе А, Г, Ц, Т/У
8
Q
Како су повезани полинуклеотидни ланци у ДНК?
A
Између комплементарних азотних база формирају се водоничне везе
9
Q
Шта је хибридизација ДНК?
A
Метода за одређивање сличности у нуклеотидном саставу ДНК различитих врста (што је већа сличност у редоследу нуклеотида, већа је сродност између тих врста)
10
Q
У којим облицима може бити ДНК у ћелији?
A
У облику хроматина или хромозома
11
Q
Када је ДНК у облику хромозома, а када је у облику хроматина?
A
ДНК је у облику хромозома када се ћелија дели, а у облику хроматина када се чита информација са ДНК
12
Q
Која је основна јединица грађе протеина?
A
Аминокиселина
13
Q
Прескочен део о протеинима
A
21-27 слајд
14
Q
Шта је геном?
A
Геном је скуп свих наследних информација садржаних у хаплоидној ћелији
15
Q
Да ли је величина генома у корелацији са комплексношћу организма?
A
Није
16
Q
Шта чини геном?
A
- Сателитне секвенце
- Интермедијарне секвенце (узастопно поновљени гени, фамилије гена, скочи гени)
- Јединствене секвенце
17
Q
Шта је ген?
A
Ген је део ДНК ланца који носи информацију за протеин или за РНК
18
Q
Шта значи да је репликација семиконзервативна?
A
У реплицираном ДНК молекулу један ланац је родитељсски, а други је новосинтетисани
19
Q
Која особина репликације објашњава да се генетичка информација преноси неизмењена из генерације у генерацију?
A
Семиконзервативност
20
Q
Шта значи да је репликација бидирекциони процес?
A
У водећем и заостајућем ланцу синтеза нових полинуклеотидних ланаца се врши у различитим смеровима
21
Q
Шта ради ДНК полимераза?
A
Полимераза додаје нуклеотиде у новосинтетисаном ланцу, по принципу комплементарности, увек у 5’-3’ смеру
22
Q
Шта је РНК прајмер?
A
Кратка РНК секвенца на коју ДНК полимераза додаје први нуклеотид
23
Q
Шта је водећи ланац?
A
Ланац који се синтетише континуирано
24
Q
Шта је заостајући ланац?
A
Ланац који се синтетише дисконтинуирано (из Оказакијевих фрагмената)
25
Шта је репликативна виљушка?
Место активне репликације
26
Како изгледа репликација код еукариота?
Више је места почетка репликације, а од сваког места почетка репликације по две репликативне виљушке чине репликативни мехур
27
Како изгледа репликација код прокариота?
Место почетка репликације је само једно, а репликативне виљушке - две
28
Шта су репарациони механизми?
Репарациони механизми су специфични протеини (ензими) који отклањају грешке на ДНК настале спонтано (најчешће при репликацији) или деловањем неког фактора
29
Какви репарациони механизми постоје?
1. ензими који препознају грешку
2. ензими који исецају део ДНК ланца који је измењен
3. ензими који замењују измењену ДНК секвенцу
4. ензими који повезују замењену секвенцу са остатком ДНК ланца
30
Шта је транскрипција?
Транскрипција је преписивање информације са молекула ДНК тако да настаје РНК
31
Ако говоримо о синтези протеина, шта настаје при транскрипцији?
Настаје информациона РНК - примарни транскрипт
32
Где се врши транскрипција?
У једру еукариота односно цитоплазми прокариота
33
Шта је промотор?
Специфична секвенца ДНК испред гена, за коју се везују транскрипциони фактори и РНК полимераза
34
У ком процесу је ДНК полимераза, а у ком РНК?
ДНК полимераза учествује у репликацији, а РНК полимераза учествује у транскрипцији
35
Који су комплементарни парови?
Аденин и тимин (урацил у РНК) и гуанин-цитозин
36
Колика је дужина расплетеног ланца при транскрипцији?
Увек 17 базних парова
37
Шта је РНК-ДНК хибрид?
Новосинтетисани РНК ланац повезан за матрични ДНК ланац у дужини од 12 базних парова
38
Где се врши обрада примарног транскрипта?
Код еукариота, у једру
39
Који су кораци примарног транскрипта?
1. Додавање 5' капе
2. Додавање 3' поли-А репа
3. С***п***лајсовање
40
Шта подразумева алтернативна обрада транскрипта?
Исецање интрона и појединих егзона из примарног транскрипта
41
Шта омогућава алтернативна обрада транскрипта?
Омогућује да се од истог примарног транскрипта различитим начима обраде добију различити протеини
42
Шта је генетичка шифра?
Превођење информације која је записана редоследом нуклеотида у ДНК у редослед аминокиселина у полипептидном ланцу
43
Шта је код?
Код је триплет у матричном ланцу ДНК
44
Шта је кодон?
Кодон је триплет у информационој РНК, комплементаран и антипаралелан коду
45
Који су старт, а који стоп кодони?
5'АУГ3'
5'УАА3', 5'УАГ3', 5'УГА3'
46
Шта је антикодон?
Триплет у транспортној РНК, комплементаран и антипаралелан кодону
47
Шта је транслација?
Транслација је процес синтезе полипептидног ланца у рибозомима
48
Транслација - прескочено
Детаљно објашњење
49
Шта подразумева транскрипциона контрола?
Који делови ДНК ће се читати и којом брзином
50
Шта је све набројано у транскрипционој контроли?
1. Репресија/дерепресија (репресори)
2. Појачивачи/утишивачи
3. Специфични транскрипциони фактори
4. Промене структуре хроматина
51
58. слајд прескочен
...
52
Шта је геномика?
Геномика је област молекуларне биологије која се бави проучавањем структуре, функције, организације, еволуције и мапирања генома
53
Шта је секвенционирање ДНК?
Одређивање редоследа нуклеотида у ланцу ДНК
54
Шта је Сангерова метода?
Сангерова метода је метода помоћу које можемо одредити редослед нуклеотида у ланцу ДНК
55
Шта подразумева дешивровање генома?
Дешифровање генома подразумева одређивање:
1. Секвенци у геному
2. Кодирајућих и некодирајућих делова ДНК
3. Улоге одређених секвенци
4. Повезаност делова ДНК и болести
56
Шта је биоинформатика?
Биоинформатика обједињује математичке и информатичке приступе да би се потпуније разумели биолошки процеси
57
Шта је ПЦР?
Реакција ланчане полимеризације - метода за умножавање фрагмената ДНК
58
Шта је ЦРИСПР?
Технологија за сечење генома на тачно одређеним местима и измене тих делова
59
На чему је заснована ЦРИСПР метода?
На систему који бактерије користе да се одбране од вируса
60
Шта је Cas9?
Ген који кодира ензим нуклеазу, која сече ланац нуклеинске киселине
61
CRISPR-Cas9 одбрамбени механизам бактерије?
1. вирус напада бактеријску ћелију;
2. нуклеинска киселина вируса се уграђује у ДНК бактерије на CRISPR месту;
3. Формира се CRISPR RNK;
4. CRISPR RNK се везује за Cas9 ензим;
5. CRISPR RNK одводи Cas9 ензим до вируса. Он сече и уништава вирусни геном
62
73. слајд прескочен
...
63
Где се користи ЦРИСПР технологија?
1. Проучавање функције и у контроли транскрипције гена
3. Примена у медицини (измена гена, спречавање умножавања вируса у ћелији домаћина)
64
Шта је клонирање?
Стварање генетичке копије
65
Шта се може клонирати?
1. Делови ДНК
2. Ћелија
3. Јединка
66
Како се другачије зове клонирање ћелија?
Терпеутско клонирање
67
Како се другачије зове клонирање јединке?
Репродуктивно клонирање
68
Опиши процес векторског клонирања
1. Из ДНК ланца исечемо ген који хоћемо да клонирамо
2. Исечен ген убацимо у бектор за клонирање (плазмид или вирусни геном)
3. Добијамо рекомбинантни плазмид
4. Рекомбинантни плазмид убацујемо у бактеријску ћелију
5. У бактеријској ћелији се умножава плазмид, па и генкоји он садржи
6. Изолујемо умножене гене из плазмида
69
Опиши терапеутско клонирање
1. Изолујемо једра из јајне и соматске ћелије
2. Једро из јајне пребацимо у соматску ћелију
3. Добијамо 2n јајну ћелију коју активирамо струјом и она почиње да се развија у лабораторијским условима
4. ћелија се развија до бластуле
5. из ембриобласта бластуле се изолују стем ћелије, које се умножавају у лабораторијским условима
70
Које су технике за добијање клониране јединке?
Вештачко удвајање ембриона,
Нуклеарни трансфер,
Рослин техника
71
Шта подразумева вештачко удвајање ембриона?
Раздвајање ембриона и добијање близанаца
72
Шта подразумева нуклеарни трансфер?
Пребацивање једра соматске ћелије у енуклеисану јајну ћелију
73
Шта подразумева Рослин техника?
Спајање енуклеисане јајне ћелије и ''успаване'' соматске ћелије са једром
74
Опиши репродуктивно клонирање
Исти је као поступак терапеутског клонирања, до стадијума бластоцисте, која се убацује у материцу сурогат мајке и развија се у нову јединку
75
Који је први клонирани сисар? Која година?
Овца Доли, 1996.
76
Колико је живела овца Доли?
6 година
77
Које је последње клонирање сисара?
Клонирање макаки мајмуна 2017/2018
78
Који су новитети при клонирању макаки мајмуна?
Коришћене су ћелије ембриона, иРНК и трихостатина А, који активирају најмање 2000 гена који су значајни за ране фазе развоја ембриона
79
Како су 2000. клонирали мајмуне?
Раздвајали су ћелије ембриона, при чему су добијени идентични близанци, поступак је аналоган природном настанку једнојајчаних близанаца
80
Где се природно јавља клонирање у живом свету?
Бесполно размножавање
81
Шта подразумева трансфер митохондрија?
Пребацивање једра из јајне ћелије са оштећеним митохондријама у јајну ћелију са здравим митохондријама
82
Како дете може да има ''три родитеља''?
Једарна ДНК се добија од сперматозоида оца, митохондријална ДНК жене која је донор јајне ћелије са здравим митохондријама и једарна ДНК јајне ћелије мајке
83
Опиши процес транслације
1. Раздвајају се мала и велика субјединица рибозома
2. иРНК се повезује за малу субјединицу рибозома тако да старт кодон буде у П-месту рибозома
3. тРНК са метионином долази у рибозом и повезује се преко антикодона за старт кодон
4. Поновно повезивање велике и мале субјединице рибозома
5. Наредни кодон се излаже у А-место рибозома
6. Долази одговарајућа тРНК са одговарајућом аминокиселином
7. Њен антикодон се повезује са кодоном иРНК у А-месту
8. Аминокиселина се пребацује из П-места у А-место и везује се за аминокиселину у А-месту
9. Рибозом се повезује за један триплет
10. Из Е-места слободна тРНК се ослобађа у цитоплазму
11. У А-месту рибозома се излаже следећи кодон за који ће се везати одговарајућа тРНК
84
Која су три нивоа регулације експресије гена?
Транскрипциона контрола, репресори и специфични транскрипциони фактори
85
Шта су појачивачи и утишивачи?
Појачивачи и утишивачи су секвенце ДНК које утичу на брзину транскрипције
86
Шта су репресори?
Специфичне хемијске материје које блокирају читање ДНК и добијање иРНК
87
Шта су специфични транскрипциони фактори?
Специфични транскрипциони фактори су ткивно специфични ензими и регулаторни протеини, они покрећу основне транскрипционе факторе
88
Шта подразумева посттранскрипциона контрола?
Обележавање зреле иРНК, које могу да изађу из једра
89
Шта подразумева посттранслациона контрола?
1. Уклањање водећег метиионина
2. Исецање
3. Ковалентне модификације
90
Шта су пропротеини?
Протеини који се активирају исевањем дела полипептидног ланца
91
Шта су полипротеини?
Један полипептидни ланац садржи више протеина
92
Које године је хумани геном први пут секвенциониран?
2003.
93
Која је специфичност Сангерове методе?
Користе се дидезоксирибонуклеотиди
94
Шта је електрофореза?
Електрофореза је метод за одређивање дужине полинуклеотидног ланца
95
Опиши ПЦР
1. Раздваја се јеликс у апарату за ПЦР
2. Користи се ДНК полимераза бактерија која живи у термалним условима, апарат се загрева на 90 степени и денатурише се ДНК
3. На 72 степена се активира ДНК полимераза
4. Изолован ген се добија после трећег циклуса
96
Како можемо клонирати секвенцу ДНК?
ПЦР-ом или векторским клонирањем (претеча ПЦР-а)
97
Шта су вектори?
Мали молекули: бактеријски плазмиди, вирусни геноми
98
Шта је рекомбинантна ДНК?
ДНК која садржи наше гене и бактеријски плазмид
99
Шта је репрограмирање једра?
Усаглашавање да се диплоидно једро понаша као хаплоидно
100
Које поремећаје је имала овца Доли?
Срчане, дисајне, гојазност, гихт
101
Шта подразумева репрограмирање једра?
Репрограмирање једра из диференциране ћелије да би се убацило у матичну (само за ћелије коже, још увек у фази истраживања)
