Phage MS2 Flashcards
Quelles sont les caractéristiques principales du phage MS2 ?
- Génome d’ARN sb + (comme les ARNm)
- Infecte E. coli
- Retrouvé dans les eaux usées et les intestins des mammifères
Quels sont les différents types de molécules génomiques, par rapport à la polarité ?
Les brins d’ADN/ARN à polarité positive contiennent des informations directement traduisibles.
Leur brin complémentaire est -
Expliquez la différence fondamentale entre les virus à ARN et ADN.
Puisque les cellules sont incapables de copier des gabarits d’ARN, les génomes de virus à ARN doivent coder pour une polymérase d’acide nucléique pour la réplication de son génome et la synthèse de son ARN.
Quelle est la classification du phage MS2 ?
- Classe: Leviviricetes (ciblent les entérobactéries)
- Famille : Fiersviridae
Décrivez la structure du virion.
- Sphérique, diamètre de 26 nm
- Symétrie icosaédrique
- Capside composée de 180 copies de la protéine CP et 1 copie de la protéine A
Combien de gènes sont codés sur le génome du MS2 ? Pourquoi est-ce particulier ?
4 gènes (environ 3500 nt)
La quatrième protéine chevauche la protéine CP et la réplicase (cadres de lectures différents)
Quelles sont les protéines codées par le génome de MS2 ?
- Protéine A
- Protéine coat
- Réplicase
- Protéine lyse
Quel est l’avantage d’avoir un génome à ARN ?
Dès son entrée dans la cellule, l’ARN est prêt à être traduit.
Comment le cycle de réplication de MS2 se déroule-t-il ?
- Phage se fixe à un récepteur et l’ARN viral pénètre dans la cellule
- Protéines sont traduites
- Génome d’ARN est répliqué
- Assemblage et lyse
Comment se déroule l’attachement à la cellule et l’entrée ?
MS2 se lie au pilus F (organite de conjugaison) par la protéine A
Lors du contact, la protéine A est clivée et l’ARN est libéré du virion dans le cytoplasme
Pourquoi l’expression des gènes est-elle régulée si étroitement?
- Différentes quantités de chaque protéine sont nécessaires (180 CP vs 1 protéine A; quelques réplicases)
- La réplication et la traduction simultanées de la même molécule d’ARN peuvent conduire des problèmes
Pourquoi est-il problématique de répliquer et traduire le même brin d’ARN ?
- La réplication débute à l’extrémité 3’ et la traduction débute à l’extrémité 5’ (les fourches se déplacent l’une vers l’autre)
- La polymérase et le ribo peuvent entrer en conflit
Comment le virus régule-t-il la traduction et la réplication de son ADN ?
- En modifiant la structure secondaire de son ARN
- Cela limite l’accès aux sites RBS
- La structure secondaire fait donc en sorte que le premier site de traduction est pour la protéine CP
- Traduction des gènes lyse et réplicases débute seulement une fois qu’un ribo se lie au site RBS de la protéine CP
- L’avancement du ribo = structure secondaire change
Quelles sont les composantes de la polymérase de MS2 ?
- Réplicase (ARN pol ARN dépendante)
- Protéine S1 (protéine ribo; détecte où commencer)
- Facteurs d’élongation EF-Tu et EF-Ts (impliqués dans l’allongement des chaînes peptidiques en croissance)
Comment le phage passe-t-il de la traduction à la réplication ?
- La polymérase se lie à l’extrémité 3’ et à 2 positions internes S et M
- Le site chevauche le début du gène CP (on empêche le ribo de se lier)
- La protéine (ribo ou pol) qui arrive en premier gagne.
