Pharmacogénomique Flashcards
(71 cards)
La pharmacogénomique (PGx) consiste à intégrer le profil génétique d’un patient afin d’optimiser sa réponse aux médicaments selon 2 principes :
- Augmentation de l’efficacité thérapeutique
- Réduction du profil de toxicité des agents pharmacologiques
Le nombre de gènes humains codant pour des protéines est estimé à environ
23 000
vrai ou faux, tous les gènes codent pour des protéines fctelles
FAUX, certains gènes ne codent que pour des ARN non traduits en protéines, rendant leur identification plus complexe.
quel est le type de déterminant pharmacogénétique le plus commun ?
Les SNPs ( Single-Nucleotide Polymorphism)
que sont les Single-Nucleotide Polymorphism aka SNPs?
type de variation pharmacogénétique qui peuvent influencer la réponse aux médicaments en modifiant l’expression des enzymes, des transporteurs ou des récepteurs cibles des médicaments.
quelle est la fréquence des SNP
1/300 - 1/1000
Impact de l’ancestralité génétique sur la diversité génétique :
Certaines ethnicités vont avoir un meilleur ou moins bon métabolisme
La majorité des personnes d’ascendance européenne ont des allèles _______________ de CYP3A5, alors que dans les populations africaines, la majorité présente des allèles _____________.
non-fonctionnels
fonctionnels
Un allèle est …
…une version alternative d’un gène située sur un même locus (emplacement) sur un chromosome.
Les humains ont deux copies de chaque gène (une de chaque parent), donc deux allèles pour chaque gène.
Exemple : Pour le gène CYP2C19, il existe des allèles comme CYP2C191 (fonction normale) et CYP2C192 (perte de fonction).
Un haplotype est …
…un ensemble de variations génétiques (SNPs ou mutations) situées sur le même chromosome et qui se transmettent ensemble.
Ex. : L’haplotype CYP2D6*4 peut inclure plusieurs SNPs qui, ensemble, entraînent une perte de fonction de l’enzyme.
Le génotype est …
… la combinaison des allèles d’un individu pour un gène donné.
Si une personne hérite de CYP2C191 (normal) de son père et CYP2C192 (muté) de sa mère, son génotype sera **CYP2C191/2.
il est probable que les trois copies du gène correspondent à une version non fonctionnelle de l’allèle, entraînant une perte complète d’activité enzymatique.
donner 4 causes à cela
- La duplication d’un allèle non fonctionnel (mutation entraînant l’inactivation).
- Un effet dominant négatif d’une enzyme dysfonctionnelle.
- Une régulation épigénétique empêchant l’expression des copies supplémentaires.
- Un problème d’ARN (splicing défectueux, instabilité de l’ARNm) empêchant la production de l’enzyme.
Le phénotype fait référence …
… aux conséquences observables d’une variation génétique
En PGx clinique, les phénotypes permettent souvent de …
… classer les procédés métaboliques ou les différentes réponses aux traitements.
que montre ce schéma:
montre comment une mutation génétique (SNP) peut entraîner une perte de fonction d’un allèle, affecter le score d’activité enzymatique, et finalement déterminer le phénotype métabolique d’un individu.
expliquer partie du haut de la figure
Certains polymorphismes nucléotidiques simples (SNPs) sont associés à des allèles spécifiques de CYP2D6.
Ici, les mutations 1847G>A et 100C>T sont associées à l’allèle CYP2D6*4.
L’allèle CYP2D6*4 entraîne une perte de fonction enzymatique (No function).
Un allèle sans fonction est attribué un score d’activité de 0.
expliquer la partie du bas de ce graphique
Le diplotype représente les deux allèles hérités d’un individu. Ici, la personne possède **CYP2D61/4 :
CYP2D61 : Allèle fonctionnel avec un score d’activité de 1.
CYP2D64 : Allèle non fonctionnel avec un score d’activité de 0.
Le score d’activité total est calculé en additionnant les valeurs des deux allèles :
1 + 0 = 1
En pharmacogénomique, à quoi est associé un score d’activité de 1
est généralement associé au phénotype “métaboliseur intermédiaire” (IM, Intermediate Metabolizer).
explque l’activité de chaque allèle de cette figure:
CYP2D6*5 (délétion) : Gène complètement supprimé → Métabolisme déficient (PM).
CYP2D6*2 : Allèle fonctionnel → Métabolisme normal.
CYP2D6*4 : Allèle non fonctionnel → Métabolisme réduit ou nul.
CYP2D6*2x2 : Duplication d’un allèle fonctionnel → Métabolisme ultra-rapide (UM).
CYP2D6*4x2 : Duplication d’un allèle non fonctionnel → Pas d’amélioration métabolique.
CYP2D6*2xN : Multiplication de copies fonctionnelles → Métabolisme ultra-rapide extrême (UM).
selon cette image, quel médicament verra son activité augmentée ou diminuée en présence de polymorphisme inactivant CYP2C19:
la prodrogue clopidogrel (Plavix®) devient inefficace, son métabolite étant censé être pharmacologiquement actif.
À l’opposé, des polymorphismes inactivant CYP2C9 causeront une activité suprathérapeutique de la (S)-warfarine (Coumadin®) dont la molécule mère est active.
où se trouvent généralement les variants de CYP2C19?
dans le promoteur 5′, les introns et les exons
En clinique, les métaboliseurs lents ont une conversion __________ du clopidogrel en son métabolite actif, réduisant son efficacité, tandis que les métaboliseurs ultra-rapides peuvent ______________________________.
insufisante
être à risque d’effets indésirable
selon cette figure où sont surtout les UM?
Les métaboliseurs ultra-rapides (UM) sont plus fréquents en Afrique subsaharienne et chez les Afro-Américains.
selon cette figure comment est la distribution phénotypique des européens et océaniens?
Les Européens et Océaniens présentent une distribution plus équilibrée entre les différents phénotypes.