Proteinanalytik: Verfahren Flashcards

1
Q

Was ist die Chromatographie?
In welche Phasen kann sie unterteilt werden?

A

Was?
Die Auftrennung eines Stoffgemischs durch unterschiedliche Verteilung seiner Einzelbestandteile

  1. Stationäre Phase
  2. Mobile Phase
  3. Retention
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2
Q

Was ist die Proteinfällung?

A
  • Kann zur Reinigung von Proteinen von Salzen, Lipiden, etc. erfolgen
  • als präparatives Verfahren, bei denen diese Substanzen stören würden
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3
Q

Was ist die Isoelektrische Fokussierung?

A

Die Isoelektrische Fokussierung trennt Proteine in einem elektrischen Feld nach ihrem IEP auf.

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4
Q

Welche Chromatographie-Verfahren gibt es?

A
  1. Gelfiltration/-chromatographie:
    Trennung von Substanzen nach ihrer Molekülgröße
  2. Ionenaustauschchromatographie:
    Trennung von Substanzen nach ihrer Ladung
  3. Affinitätschromatographie:
    Trennung von Substanzen nach spezifischen Bindungsaffinitäten
  4. HPLC (high performance liquid chromatography):
    Säulenchromatographisches Hochdurchsatzverfahren
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5
Q

Was ist das Bindungspartner-Prinzip in der Affinitätschromatographie?

A

Der stationären Phase werden spezifische Bindungspartner kovalent angeheftet:

  • Antikörper-Antigen
  • DNA-Transkriptionsfaktor
  • Enzym-Substrat
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6
Q

Welche Elektrophorese-Verfahren gibt es?

A
  1. Serumelektrophorese
  2. Gelelektrophorese
    - Native-PAGE
    - SDS-PAGE
    - 2D-Elektrophorese
  3. Kapillarelektrophorese
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7
Q

Was ist das Prinzip der Elektrophorese?

A
  • Wanderung von geladenen Partikeln in einem elektrischen Feld
  • Kathode (negativer Pol)
  • Anode (positiver Pol)
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8
Q

Wie unterscheidet sich die Native PAGE von der SDS-PAGE?

A
  1. Proteine bleiben in ihrer nativen Konformation, werden nicht denaturiert
  2. Auftrennung nach Isoelektrischem Punkt, in verschiedenen Puffersystemen
  3. Auftrennung nach Ladung, Größe, Konformation
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9
Q
  1. Wofür steht SDS?
  2. Wofür steht PAGE?
A
  1. Sodium dodecyl sulfat
  2. Polyacrylamid-Gelelektrophorese
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10
Q

Was sind die Funktionen von SDS?

A
  1. Anionisches Detergenz zur Maskierung der Oberflächenladungen der Komponenten des Trenngemischs
  2. Denaturiert Proteine durch Wechselwirkung mit deren hydrophoben Bereichen
  3. Solubilisieren
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11
Q

Durch welche Reaktion entsteht Polyacrylamid?
Nenne den dazugehörigen Katalysator!

A
  • radikalische Polymerisierung
  • Tetra methyl ethylen diamin (=TEMED)
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12
Q

Welche Ladung tragen SDS-Proteinmicellen?
Zu welchem Pol wandern diese Proteine (Anode, Kathode)?

A
  • Negative Oberflächenladung
  • zur Anode (hier pos. geladen)
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13
Q

Nenne die Verbindungen aus denen Polyacrylamid hergestellt wird!

A
  1. Acrylamid
  2. N,N’-Methylen-bisacrylamid
  3. Tetra methyl ethylen diamin (=TEMED)
  4. Ammonium peroxo disulfat (= APS)
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14
Q

Was sind die Funktionen von β-Mercaptoethanol und Dithiothreitol (DTT)?

A
  • Reduktionsmittel
  • Spaltung von Disulfidbrücken
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15
Q

Was ist die Stationäre Phase in der Chromatographie?

A

Unbewegliche Phase,
in die Substanzen eines Substanzgemischs abh. von ihrer Größe eindringen
und die mit einzelnen Substanzen Wechselwirkungen eingehen kann

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16
Q

Was ist die Mobile Phase in der Chromatographie?

A

Bewegliche Phase,
in die das Substanzgemisch zu Beginn der Trennung eingebracht wird und in dem es sich bewegt

17
Q

Was ist die Retention in der Chromatographie?

A

Verzögerter Durchfluss einer Substanz des Substanzgemisches
aufgrund von Interaktionen mit der stationären Phase

18
Q

Welche Geltypen kann man bei der Proteinanalytik verwenden?

Für welches Verfahren werden sie jeweils verwendet?

A
  1. Vernetztes Dextran:
    Gelchromatographie
  2. Polyacrylamid:
    Gelelektrophorese (Trennung v. Proteinen)
  3. Agarose:
    Gelelektrophorese (Auftrennung von DNA und RNA)
19
Q

Wie unterscheidet sich die SDS-PAGE von der Nativen PAGE?

Wofür steht SDS?

A

Sodiumdodecylsulfat-PAGE:

  1. Denaturierendes Proteintrennverfahren
  2. Die Eigenladung der Proteine werden durch SDS maskiert
  3. Auftrennung der Proteine nach Molekulargewicht - nicht nach Eigenladung!!