Proteinstruktur Flashcards
(27 cards)
Vad Består en aminosyra av?
En aminogrupp och en carboxylgrupp samt en sidokedja och ett väte
Vad är “Alphakolet”?
Det kolet som aminogruppen och carboxylgruppen binder till
Vad kallas en bindning mellan två aminosyror?
Peptidbindning
vilka grupper samt undergrupper kan aminosyror klassificeras i?
polära och opolära är det två huvudgrupperna. Opolära kan vara alkyl och aromatiska. Polära kan vara neutrala, acidic, basic
Vad innebär det att ett protein är denaturerat?
Att det endast har kvar sin primärstruktur.
Vad är en proteins sekundärstruktur?
Lokala vikta strukturer inom en polypeptid som ett resultat av interaktioner mellan atomerna i backbone
Vad är tertiär struktur?
Den tredimensionella strukturen av polypeptiden. Beror mest av interaktioner mellan R-grupperna hos aminosyrorna. V.D.waal, hydrofobisk, disulfidbryggor, samt vätebindningar.
vad innebär hydroxylering? Ge exempel.
Innehär att man binder en hydroxylgrupp (OH-). Hydroxylerade aminosyror blir mer vattenlösliga. Hydroxylering av prolin är viktigt för kollagen
vad innebär fosforylering av aminosyra? Vilka aminosyror?
Vanligt sätt att reglera cellprocesser genom att processerna slås av/på med hjälp av detta. Oftast på serin men även threonine and tyrosine
Vad innebär metylering av aminosyror?
Argenin, histidin, lysin, prolin, och carboxylgrupper. Viktigt för att regulera cellulära processer som till exempel transkriptionsregulation
Vad är “induced fit”?
en model för enzym-substrat interaktion. Menar att interationen mellan ett enzym och substrat är svagt till en början men leder till en konformationsförändring hos enzymet och bindningen blir starkare.
Vad karaktäriserar en domän hos ett protein?
En konserverad del av ett protein som kan fungera och existera oberoende av resten av proteinet
vad kan man dra för slutsats om en aminosyra har en kolvätekedja?
Att den är opolär
vad kan man oftast dra för slutsats om en aminosyra med OH-grupp? Vad innebär det?
den är polär och löslig i vatten.
Vilken aminosyra kan bilda disulfidbryggor vid oxiderins?
Cysteine
Vad kan man dra för slutsats om en aminsyra har en karboxylgrupp i sidokedjan?
Den är acidic.
Vilken slutsats kan man dra av att aminosyrans namn slutar på “ate”?
Att den har en karboxylgrupp i sidokejdjan
vad är en “amide group” och vad säger det om aminosyran?
ett kol som är bundet till en NH2 och en dubbelbindning till O. Då är aminosyrar polär
Vilken slutsats kan man dra när man ser en amine i sidokedjan på en aminosyra? Vad är en amine?
Att den är basisk. NH3+
Vilken slutsats kan man dra av att en aminosyra har en bensenring?
Den är aromatisk
vad karaktäriserar aminosyror med opolära sidokedjor?
Tar/tappar inte protoner och skapar inte väte eller jonbindningar. Lipidlika sidokedjor som promotar hydrofoba interaktioner.
Vilka är aminosyrorna med opolära sidokedjor?
Valine, alanine, methionine, proline, glycine, isoleucine, leucine, phenylalanine, tryptophan, (tyrosine hydrofob enligt vissa men inte polär).
vad karaktäriserar aminosyror med oladdade polära sidokedjor?
De har ingen laddning vid fysiologiskt pH. Serine threonine och tyrosine har en polär hydroxylgrupp som kan delta i vätebindningar. Asparagine och glutamine har en carbonyl och amide grupp i sina sidokedjor, och båda dessa kan bilda vätebindningar.
Av de polära oladdade aminosyrorna, vilka kan bilda disulfidbindningar?
Cysteine, med sig själv.
