Proteinstruktur, syre/ base egenskaper til aminosyrer, peptider

Question 1

hvor mange aminosyrer finnes det?

Answer 1

20

Question 2

hva er essensielle aminosyrer og hvor mange er det av dem?

Answer 2

aminosyrer som kroppen må få tilført gjennom maten fordi den ikke klarer å lage de selv. (8 av 20 aminosyrer er essensielle)

Question 3

hvordan navngis aminosyrer?

Answer 3

Navngis med tre-bokstavs-forkortelser eller

en bokstav forkortelse

Question 4

nevn noen biologiske funksjoner til proteiner

Answer 4

• Katalyse: enzymer
• Transport, eks. hemoglobin
• Lagring, eks. ferritin
• Struktur, eks.: sener, brusk hår, negler osv.
• Beskyttelse: Antistoffer/ immunglobuliner. Eks. Ig G
• Regulering : eks. hormonet insulin

Question 5

hva er forskjellen og likhetene mellom alle aminosyrer?

Answer 5

• Alle aminosyrer er a-aminosyrer.
- alle aminosyrer har en karboksylsyregruppe og en amin gruppe
• De adskiller seg ved sin R-gruppe/ sidegruppe.
• Alle aminosyrer har et kiralt C-atom, nemlig a-C-atomet, bortsett
fra glycin.
• D-form og L-form er speilbildeisomerer.
• Bare L-aminosyrer i proteiner.

Question 6

hvordan ser fisherformen til en aminosyre ut?

Answer 6

karboksylsyren står øverst og R gruppen er nederst. hvis amin gruppen står på høyre side er molekylet en 
D aminosyre (D konfigurert) er amin gruppen på venstre side er det en L aminosyre (L konfigurert )

Question 7

hva er en amfolytt?

Answer 7

Amfolytter er molekyler som
fungerer både som syre og base,
fordi den har begge gruppene.
Det er f.eks. aminosyrerne.

https://www.mn.uio.no/ibv/tjenester/kunnskap/plantefys/leksikon/a/switteraminosyre2.gif

Question 8

hva er zwitterioner og når er aminosyrer zwitterioner?

Answer 8

Zwitterioner=dipolare ioner
I vanndig løsning er aminosyrene
dipolare ioner

Question 9

hva er netto ioneladningen til kationet, zwitterionet og anionet i lenken, og hvilken av dem vil ikke bevege seg i et elektrisk felt?
https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcQt632AnqmGWAILMPTWWPEegrcU7tr_Ez8kmw&usqp=CAU

Answer 9

Katio: +1

anion: -1
zwitterion: 0 (denne vil ikke beveg seg i et elektrisk felt.

Question 10

hva skjenne tegner en hydrofob forbindelse?

Answer 10

Hydrofobe forbindelser har ingen mulighet
til å danne hydrogenbindinger og er derfor
hydrofobe – det vil si at de ikke lar seg
løse i vann og frastøter vann.

Question 11

hva er Hydrofobe interaksjoner?

Answer 11

er at hydrofobe sidekjeder
har en tendens til å «pakkes»/
samles mot hverandre for å unngå
kontakt med vann.

Question 12

hvilke av forbindelsene i linken kan danne hydrogenbindinger?

https://slideplayer.no/slide/2855041/10/images/10/Aromatiske+sidekjeder.jpg

Answer 12

tyrosine

Question 13

hvilke av disse kan inngå i en hydrogenbinding

https://slideplayer.no/slide/2855041/10/images/12/Positivt+ladete+sidekjeder.jpg

Answer 13

histidine

Question 14

hvilke av disse kan inngå i en hydrogenbinding?

https://slideplayer.no/slide/2855041/10/images/13/Negativt+ladede+sidekjeder.jpg

Answer 14

begge

Question 15

Hva er isoelektrisk punkt (pI)?

Answer 15

pI er den pH der molekylene (aminosyrer, peptider
eller proteiner) er elektrisk nøytralt (likt antall av
positive og negative ladninger).

https://sawakinome.com/img/images_1/difference-between-isoelectric-and-isoionic-point.png

Question 16

regn ut pI for denne aminosyren

https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcQt632AnqmGWAILMPTWWPEegrcU7tr_Ez8kmw&usqp=CAU

Answer 16

6.15

Question 17

vil aminosyren forflyttes mot positiv eller negativ pol etter
separasjon ved elektroforese ved pH 6,15?

https://media.cheggcdn.com/study/c60/c60d9de2-a430-4929-9136-31d09e4aa820/202738-2-16P-i6.png

Answer 17

siden pl er 10.745, vil det si at
pH buffer < pI aminosyre
Totalladningen til aminosyren er da positiv → aminosyren forflyttes til negativ pol

Question 18

hvis pH buffer > pI aminosyre, vil aminosyren forflyttes mot positiv eller negativ pol?

Answer 18

Totalladningen til aminosyren er da negativ → aminosyren forflyttes til positiv pol

Question 19

vil aminosyren forflyttes mot positiv eller negativ pol etter
separasjon ved elektroforese ved pH 6,15?

https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcQt632AnqmGWAILMPTWWPEegrcU7tr_Ez8kmw&usqp=CAU

Answer 19

vil ikke bevege på seg siden

Samme verdi som i buffer

Question 20

hva er et annet ord for peptidbindinger?

Answer 20

amid bindinger

Question 21

hvorfor er peptidbindinger stabile under cellulære forhold?

Answer 21

Peptidbindingen/amidbindingen er
stiv fordi C-N bindingen er en
delvis dobbeltbinding.
Peptidbindingen er svært stabil
under cellulære forhold

Question 22

hva er det en primær aminosyre struktur forteller deg?

Answer 22

den sier rekkefølgen på aminosyrer starter alltid med en amin gruppe og ender på en karboksylsyre gruppe, mellom dem kommer de forskjellige aminosyrene

Question 23

hva er den sekundære strukturen?

Answer 23

Sekundærstrukturen er konformasjonen
til polypeptidkjeden dvs. det spontane
og automatiske resultatet av
aminosyreinnhold og
aminosyrerekkefølge.
Hydrogenbindinger stabiliserer β-form
og α-form:
Intramolekylære hydrogenbindinger
mellom O-atomet i karbonylgruppen og
H-atomet i amidet.

Question 24

hvilke type bindinger stabiliserer den romslige tertiærstrukturen?

Answer 24

Krefter mellom aminosyrenes
sidekjeders stabiliserer
tertiærstrukturen. Det er
kreftene hydrofobe
interaksjoner, ionebinding,
disulfidbinding (spesielt viktig mellom aminosyren cystin) og
hydrogenbinding

Question 25

hva er denaturering?

Answer 25

Denaturering vil si at du bryter bindinger som holder sekundær og tertiær strukturer, men ikke primærstrukturen

Question 26

Aminosyrer koples sammen til

Answer 26

polymerer

Question 27

Oligopeptider er?

Answer 27

De minste polymerer (2-20 aminosyrer)

Question 28

polypeptider er?

Answer 28

Små polymerer

Question 29

Proteiner er?

Answer 29

Store polymerer

Question 30

hvordan dannes peptidbindinger?

Answer 30

https://slideplayer.no/slide/2006428/7/images/4/Peptidbinding.jpg