Régulation globale partie 1 Flashcards
(52 cards)
Relier
1/ Régulation globale
2/ Régulon
3/ Stimulon
A/ ensemble de gènes et opérons qui répondent à un régulateur commun. Ils peuvent faire partis de plus qu’un régulon.
B/ souvent les régulons se chevauchent dans leurs réponses aux conditions variables de l’environnement. L’ensemble des régulons qui sont induits par un signal de l’environnement particulier est appelé stimulon.
C/ régulation de plusieurs gènes et opérons afin de répondre à un signal de l’environnement.
1C-2A-3B
Enumérer des régulateurs globaux (5)
- facteurs σ
- ARNs
- système à 2 composantes
- activateurs/répresseurs
- petites molécules
Qui suis-je?
Il coordonne l’expression des gènes impliqués dans l’utilisation des sources de carbone et d’énergie. Il est l’un des plus gros systèmes de régulation global chez les bactéries G-.
Catabolite Activator Protein (CAP) et cAMP
Vrai ou faux
La régulation catabolique permet aux cellules d’utiliser la meilleure source de carbone possible.
Vrai
Vrai ou faux
La cellule utilise directement le glucose.
Faux, besoin de convertir en glucose-6-phosphate pour entrer dans la glycolyse
Que signifie “l’effet glucose va générer une croissance diauxique”?
La cellule va d’abord utiliser le glucose même si il y a une autre source de carbone dans le milieu (meilleur rendement ATP).
Une fois épuisé, délais de croissance puis utilisation de l’autre source en carbone à un taux plus faible de croissance.
Vrai ou faux
Le système cAMP-dépendant est commun à toutes les bactéries
FAUX
seulement chez les bactéries entériques, incluant E.Coli
Compléter
Plus la quantité de glucose …., plus la quantité d’AMPc ….
+ glucose augmente, + AMPc diminue
==> AMPc élevé quand le milieu contient une source de carbone pauvre (ex: lactose, maltose)
Quelle enzyme contrôle l’AMPc?
A partir de quoi est synthétisé l’AMPc?
adénylate cyclase
synthèse à partir d’ATP
Quel gène code pour l’adénylate cyclase:
- cya
- crp ?
gène cya
gène crp code CAP
Le système PTS intervient dans quel mécanisme de régulation ?
Quel est son rôle ?
Régulation glucose/AMPc
PTS = transporteurs de sucre dans la cellule
Nommer une protéine du système PTS.
Décrire son fonctionnement
Protéine IIAGlc
Forme phosphorylée IIAGlc-P active l’adénylate cyclase.
IIAGlc-P obtenu par transfert de phosphate de PEP vers protéine Hpr. Phosphate de Hpr-P transféré à IIAGlc
SI le taux de glucose est élevé, la forme de la protéine IIAPGlc est phosphorylée ou non-phosphorylée ?
Non-phosphorylée puisque si bcp de glucose, bas niveau d’AMPc donc pas besoin activation adényalte cyclase par forme phosphorylée de la protéine.
Nommer la fonction de la forme IIAGlc lorsque présence glucose
Comment appelle-t-on cet effet ?
inhibition de perméases de sucre
= empêche l’entrée de sucre dans la cellule lorsque source de carbone riche dans le milieu
C’est l’effet “exclusion d’inducteur’
Quelle est la cible directe de l’AMPc?
Qu’induit leur interaction ?
Cible directe : activateur CAP
Interaction active les promoteurs catabolite-sensibles via interaction avec ARNpol.
Quels opérons appartiennent au régulon CAP?
lac, gal, ara, mal
Vrai ou faux
CAP est uniquement un activateur.
faux
c’est aussi un répresseur
Vrai ou faux
CAP n’a pas besoin de l’AMPc pour interagir avec son site d’attachement sur l’ADN
faux, seulement lorsque liée à AMPc
==> donc seulement lié lorsque bcp AMPc
Quelle est la caractéristique des promoteurs de classe I dans la régulation CAP-AMPc ?
donner exemple
dimère CAP-AMPc contacte domaine C-terminale de s-u α de ARN Pol
=> formation complexe fermé (meilleure interaction ARNpol/promoteur)
ex: promoteur lac
Quelle est la caractéristique des promoteurs de classe II dans la régulation CAP-AMPc ?
donner exemple
Site d’attachement du dimère chevauche site attachement ARNpol
= interaction avec domaine N-term s-u α ARNpol
= complexe ouvert
ex: promoteur gal
Le site d’attachement de CAP-AMPc sur l’opéron ara est plus ou moins en amont par rapport aux promoteurs classe II chez gal ?
Quelle en est la conséquence ?
Encore plus amont
Permet AraC d’être entre site CAP et site ARNpol
Quelles sont les 2 conditions pour l’activation des opérons catabolite-sensibles ,
- meilleure source carbone que glucose doit être absente
- inducteur de l’opéron doit être présent
Si absence de glucose et présence lactose;
- niveau AMPc ?
- expression opéron lac ?
niveau AMPc élevé
lac exprimé (car LacI ne peut interagir avec promoteur)
Si glucose +, lactose +:
- niveau AMPc ?
- expression opéron lac ?
niveau faible AMPc
pas expression opéron car promoteur pas activé par niveau CAP-AMPc
