RMN Flashcards

1
Q

À quoi sert la RMN des biomolécules?

A
  • Élucidation de leur structure 3D
  • Étude de la dynamique (mouvement) des biomolécules)
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Q

Quelles sont les 4 faiblesses de la RMN?

A
  • Requiert une grande pureté
  • Requiert une certaine quantité (300 uL @ ≥20 uM)
  • Limité par les grosses molécules rigides et symétriques
  • Limité à de petites biomolécules (moins de 50 kDa)
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3
Q

Que signifie le mot spectroscopie?

A

Interaction de la biomolécule avec un certain type d’énergie pour produire différents états énergétiques et déduire des informations basées sur ces différences.

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4
Q

Que signifie le mot résonance?

A

A la bonne fréquence, une onde électromagnétique (énergie) va être absorbé par le noyau et permettre à celui-ci de passer dun état dénergie à l`autre. On dit alors que le noyau est en résonance.

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5
Q

En quoi consiste une mesure du signal à RMN?

A

La mesure RMN consiste à mesurer la différence dénergie entre les différents états dénergie des noyaux. Des impulsions dune certaine fréquence et pendant un certain temps permettre de déplacer léquilibre en faveur dun niveau de plus haute énergie. Lorsque lon arrête limpulsion, les noyaux relaxe et retournent à leur état déquilibre. Cette transition est caractéristique du noyau et c`est ce qui est mesuré par le récepteur de fréquence.

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6
Q

Quelle formule mathématique (un nom) permet d’obtenir un pic RMN?

A

Transformée de Fourier

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7
Q

Vrai ou Faux
Chaque noyau aura un signal caractéristique distinct qui permettra ultimement de cartographier (assigner) tous les H et C d’une biomolécule donnée.

A

Vrai

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8
Q

Quelles sont les 3 composantes clé dans un spectre RMN?

A
  • Position
  • Intensité
  • Multiplicité
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9
Q

Vrai ou Faux
Le déplacement chimique par rapport à la référence 0 est inversement proportionnelle à la densité électronique autour des noyaux.

A

Faux
Le déplacement chimique par rapport à la référence 0 est proportionnelle à la densité électronique autour des noyaux.

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10
Q

S’il y a plus d’atomes autour qui sont électronégatifs, est-ce que le déplacement chimique sera grand ou petit?

A

Le déplacement sera plus grand

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11
Q

Qu’est-ce qui donne le nombre de noyau qui ressente le même environnement chimique, entre la position, l’intensité et la multiplicité?

A

L’intensité (intégration)

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12
Q

Si la fréquence du RMN est élevé donc un gros aimant, est-ce que la résolution est meilleure ou moins bonne?

A

+ fréquence = + résolution

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13
Q

Quels sont les 2 éléments qui impactent le temps avant d’obtenir un spectre?

A
  • noyau abondant
  • biomolécule concentrée
    Plus le noyau est abondant naturellement et plus la biomolécule est concentrée, moins il sera nécessaire daccumuler des scans (moins de temps avant dobtenir le spectre).
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14
Q

Que signifie la multiplicité dans le contexte de la RMN?

A

Fonction du nombre de noyau avoisinant à travers les liens covalents.

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15
Q

Quelle est la règle pour compter le nombre de raies sur un pic RMN?

A

n+1

Prenons lexemple du spectre de léthanol. Les trois protons d`un groupement méthyl (CH3) sont chimiquement équivalent (libre de rotation et tous ont le même environnement chimique). Par contre, ils se couplent avec les deux protons du groupement CH2. En appliquant la règle n+1 [où n=2 (2 protons du CH2) +1], on obtient 3. Ça veut dire que le pic RMN sera divisé en 3 raies (triplet).

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16
Q

Vrai ou Faux
La RMN est une stratégie pour élucider la structure de biomolécules?

A

Vrai

17
Q

La RMN mesure le signal de biomolécules en mouvement ou stable?

A

En mouvement

18
Q

Nommez une grosse différence entre la RMN et la cristallographie?

A

Le résultat de RMN sera une superposition de 20-100 familles de structure versus en cristallographie, ou on obtient une seule structure

19
Q

Vrai ou Faux
Un spectre RMN ne peut pas déterminer à quel point une protéine est bien repliée ou non.

A

Faux,

De façon qualitative (et même sans assigner tous les pics), un spectre RMN peut indiquer à quel point une protéine est bien repliée ou non.

20
Q

Quels paramètres peuvent être ajusté pour obtenir un meilleur signal RMN?

A

Grosseur des molécules et vitesse de rotation, abondance des isotopes, etc…

21
Q

Est-ce qu’un spectre RMN d’une biomolécule est sensible aux changements de structure?

A

Oui

22
Q
A