Semaine 10: Biologie moléculaire 1

Question 1

Quelle est la différence entre un génome et un gène?

Answer 1

Génome: ensemble du matériel génétique d’un être vivant. Regroupe les séquences codantes et non codantes
Gène: Séquence codante pour une protéine ou un ARN

Question 2

Combien de chromosome contiennent les bactéries ?

Answer 2

1 qui contient tous les gènes essentiels à la survie de l’organisme

Question 3

Qu’est ce qu’un plasmide?

Answer 3

ADN extrachromosomique, beaucoup plus petit que les chromosomes. Portent des gènes non essentiels

Question 4

Quelle est la différence entre un génotype et un phénotype?

Answer 4

Génotype: l’ensemble des gènes qui concernent le développement d’un attribut , ex:brun/bleu
Phénotype: ce qu’on observe ex: brun

Question 5

De quoi est composé l’ADN?

Answer 5

Nucléotides

Question 6

De quoi est fait un nucléotide?

Answer 6

Un sucre, une base azotée et 1-3 groupements phosphates

Question 7

Quels sont les 4 différents nucléotides?

Answer 7

Adénine, cytosine, guanine et thymine

Question 8

Qu’est ce qu’une base azotée?

Answer 8

molécules cycliques composées d’atomes de carbone et d’azote

Question 9

Quels sont les deux types de bases azotées dans les acides nucléiques?

Answer 9

Pyrimidines et purines

Question 10

Quelle sont les 3 principales pyrimidines?

Answer 10

Cytosine, thymine et uracile

Question 11

Quelles sont les 2 principales purines?

Answer 11

Adénine et guanine

Question 12

Où retrouve-t-on principalement l’uracile?

Answer 12

Dans l’ARN

Question 13

Où retrouve-t-on la cytosine?

Answer 13

ADN et ARN

Question 14

Où retrouve-t-on l’adénine et la guanine?

Answer 14

ADN et ARN

Question 15

on lit et écrit une séquence d’ADN de l’extrémité _ vers l’extrémité _

Answer 15

5’ Phosphate à 3’ OH

Question 16

Les brins formant la double hélice de l’ADN sont _ et _

Answer 16

antiparallèles: orientations opposées
et complémentaires: chaque purine sur un brin est associée à la pyrimidine correspondante sur l’autre brin

Question 17

Chaque adénine (A) d’un brin est appariée à une _ sur l’autre brin via _ liens H

Answer 17

thymine, 2

Question 18

chaque guanine (G) d’un brin est appariée à une _ sur l’autre brin via _ liens H.

Answer 18

cytosine, 3

Question 19

Quelle est la différence entre l’expression homologue/hétérologue

Answer 19

Homologue: Implique l’expression d’un gène chez une espèce qui le possède naturellement (endogène)

Hétérologue: L’expression d’un gène chez un organisme qui NE le possède PAS naturellement (exogène).

Question 20

vrai ou faux? les 2 brins de l’ADN sont identiques

Answer 20

Faux, ils sont antiparallèles et complémentaires

Question 21

Quelle est la première étape lors du clonage?

Answer 21

couper l’ADN avec une endonucléase

Question 22

Comment une enzyme de restriction coupe une séquence palindromique GAATTC?

Answer 22

Coupe le premier et le dernier

Question 23

Qu’est ce qu’une extrémité cohésive ?

Answer 23

Une extrémité qui se termine par une portion simple brin

Question 24

De quoi est formé un plasmide recombinant ?

Answer 24

Mélange du vecteur linéaire avec insert et ligase

Question 25

À quoi sert le tampon qui contient le EDTA

Answer 25

EDTA est un inhibiteur de certaines nucléases qui pourraient entraîner la dégradation de l’ADN en cours d’isolement.

Question 26

À quoi sert le SDS lors de l'extraction de plasmides?

Answer 26

solubilise les lipides des membranes et les fragilise. De plus, la présence de SDS dénature les protéines, ce qui les rend moins solubles

Question 27

Que provoque l'ajout de NaOH?

Answer 27

séparation de la double hélice d'ADN

Question 28

Lors de la Méthode d’extraction de plasmides par lyse alcaline, l'ADN plasmidique se trouve dans le surnageant ou précipité?

Answer 28

surnageant

Question 29

Pourquoi on ajoute de l'éthanol dans le surnageant qui contient l'ADN plasmidique ?

Answer 29

car ils ne sont pas très solubles ensemble. L'ADN est très peu concentré, donc en les mélangeant l'ADN va précipiter

Question 30

Pourquoi il ne faut pas utiliser le vortex ?

Answer 30

fait de la mousse, donc mauvais contact entre les composés du mélange peut causer des bris mécaniques de l'ADN et dénaturer l'enzyme

Question 31

Pour une électrophorèse, on utilise quel support pour de l'ADN ou des protéines?

Answer 31

ADN: agarose Protéines: polyacrylamide

Question 32

À quoi sert le tampon dans l'électrophorèse?

Answer 32

maintenir le pH source d'électrolytes

Question 33

Pourquoi la présence d'électrolytes est importante dans l'électrophorèse?

Answer 33

car l'eau pure n'est pas un bon conducteur d'électricité, donc les ions crée une conductibilité

Question 34

Quand on diminue le pourcentage du polymère (du support), ça _ la taille des pores

Answer 34

augmente

Question 35

Pour uniformiser la charge de l'ADN, le pH doit être a combien? pourquoi?

Answer 35

supérieur à 7 à ce pH les groupements phosphoryles ont tous une charge - peu importe la base azotée, donc le ratio charge/masse est constant

Question 36

quel est le tampon utilisé pour les gels d'agarose? il maintient à quel pH

Answer 36

TAE 1X, pH 8

Question 37

en ordre croissant lequel est plus rapide: adn linéaire, adn circulaire superenroulé, adn relaché

Answer 37

1. superenroulé 2. linéaire 3. relaché

Question 38

Pourquoi on préfère digérer l'ADN avant migration ?

Answer 38

pour que l'ADN soit linéaire, comme ça la migration est uniquement basée sur la taille (pas la forme)

Question 39

Pourquoi les produits PCR n'ont pas besoin d'être digérés?

Answer 39

ils ont une seule forme (linéaire)

Question 40

La méthode de coloration la plus fréquente pour les gels d’agarose est ?

Answer 40

bromure d'éthidium

Question 41

Le bromure d'éthidium (la méthode de coloration pour gel d'aggarose) est un agent intercalant, ça signifie quoi?

Answer 41

il s'insère entre 2 base azotées à l'intérieur de la double hélice de l'ADN

Question 42

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Question 43

À quoi sert l'origine de réplication?

Answer 43

essentielle à la réplication et au maintien du plasmide dans la cellule hôte

Question 44

À quoi sert le marqueur de sélection?

Answer 44

permet d’isoler uniquement les bactéries qui ont acquis l’ADN (généralement un gène de résistance à un antibiotique)

Question 45

À quoi servent les sites reconnus par des enzymes de restrictions?

Answer 45

permettent de couper le vecteur pour permettre l’insertion du gène d’intérêt