Semaine 13 : Électrophorèse Flashcards

(32 cards)

1
Q

Qu’est ce que le principe d’électrophorèse?

A

Méthodes permettant de séparer les composantes d’un mélange en fonction de leur vitesse de migration dans un gel en présence d’un champ électrique

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Q

Quelles sont les caractéristiques qui influencent la migration d’une molécule?

A

Charge
Forme
Masse

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Q

Quelle est la différence entre l’électrophorèse PAGE et SDS PAGE

A

PAGE: Électrophorèse sur gel d’acrylamide en conditions natives
SDS PAGE: Électrophorèse sur gel d’acrylamide en conditions dénaturantes

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4
Q

Qu’est ce qui permet à l’acrylamide de se lier?

A

Ajout de bis acrylamide, agent réticulant

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5
Q

Les radicaux libres nécessaires à la polymérisation du gel de polyacrymalide viennent de quoi?

A

persulfate de sodium

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6
Q

Quel est le catalyseur utiliser pour la réaction de polymérisation de l’acrylamide?

A

TEMED

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7
Q

La taille des pores formés par la polymérisation dépend de quoi?

A

% total d’acrylamide et bis-acrylamide, et leur proportion
Plus le % d’acrylamide est élevé, plus le gel peut séparer des mol de petites tailles

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8
Q

Vrai ou faux? pour déterminer la masse moléculaire et la focalisation isoélectrique, il faut utiliser le PAGE

A

faux, sds PAGE

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9
Q

Qu’est ce que le pI ?

A

pH pour lequel la somme des charges + et – d’une protéine
s’annule : la charge nette est nulle

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10
Q

Quand le pH est plus petit que pI, la protéine est chargée _

A

positivement (donc plus acide)

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11
Q

Quand le pH est plus grand que pI, la protéine est chargée _

A

négativement (donc plus basique)

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12
Q

Vrai ou faux? Lors d’un PAGE les protéines changent de conformation

A

faux elle gardent leur conformation native

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13
Q

Le SDS PAGE sépare selon quoi?

A

masse molaire uniquement

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14
Q

Que permet le SDS PAGE

A

déterminer la masse moléculaire,
le nombre de sous unités d’une prot,
la pureté

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15
Q

Que signifie la dénaturation d’une protéine?

A

Perte de la conformation native après la bris des interactions non covalentes et des ponts disulfures

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16
Q

Vrai ou faux? la dénaturation détruit les liens peptidiques

17
Q

Quelle est la première étape lors du SDS PAGE

A

chauffer les échantillons pour briser les interactions faibles

18
Q

Que permet le SDS ? (le produit)

A

bris des interactions non covalentes

19
Q

Que permet l’agent réducteur lors du SDS PAGE

A

détruit les ponts disulfure

20
Q

Que permet la présence de SDS dans le tampon?

A

s’assurer que les prot demeurent dénaturées

21
Q

Que provoque le SDS lorsqu’il se fixe aux protéines?

A

dépliement des structures secondaires et tertiaires en brisant les liens non covalents.
elles entourent la protéine dépliée pour empecher la dénaturation

22
Q

Comment sont chargées les protéines dénaturées par le SDS?

A

négativement

23
Q

Les molécules de SDS sont chargées _

A

négativement

24
Q

Quel est l’agent réducteur le plus utilisé pour le SDS PAGE et que fait-il?

A

β-mercaptoéthanol
détruit les ponts disulfures

25
Les ponts disulfures que brisent l'agent réducteur sont intrapeptide ou interpeptide?
peut être les deux
26
Qu'est ce qu'un système continu/discontinu?
Continu: un seul gel de polyacrylamide Discontinu: superposition de deux gels. un de concentration ou empilement, et un de résolution ou séparation
27
Dans un système discontinu de SDS PAGE, les deux gels doivent différer sur deux points:
1. la conc de polyacrylamide est différente 2. les gels sont préparés dans des tampons Tris-HCl de pH différents
28
Que permet le gel d'empilement (de concentration)
Permet aux prot d'arriver en même temps au gel de séparation. Sans lui, les prot formeraient des bandes larges et difuses
29
Que permet le gel de séparation?
séparer les prot selon leur taille, en fonction de leur vitesse de migration
30
finir les 4 dernières diapos
31
que permet le β-mercaptoéthanol
détruit les ponts disulfure
32