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Économie de la santé > Semaine 7 > Flashcards

Semaine 7 Flashcards

1
Q

Qu’elle est l’unité de construction de l’ADN et ARN

A

nucléotide
(A-C-T-G-U)

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Q

V ou F

Le sucre de l’ADN est le ribose et le désoxyribose est celui de l’ARN

A

F

Le sucre de l’ADN est le désoxyribose et le ribose est celui de l’ARN

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3
Q

En ce qui concerne la polarité de l’ADN, est-ce que chaque brin possède une extrémité 5’P et une 3’-OH?

A

oui

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4
Q

V ou F

La polarité des vrins se définit selon la position du phosphate sur tous les liens

A

F

…… sur le sucre!

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5
Q

V ou F

Double brin de l’ARN est complémentaire et antiparallèle

A

V

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6
Q

Que dit la règle de Chargaff

A

A/T = 1
C/G = 1
Purine/Pyrimidine = 1

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7
Q

Est ce que les liaisons entre A/T sont plus fortes que celles de C/G?

A

non, en fait A/T fait 2 liens H tandis que C/G fait 3 liens

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8
Q

V ou F

Suite à la polymérisation de l’ADN, on double la quantité de copie d’ADN

A

V

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9
Q

Qu’est ce qu’un génome

A

ensemble du matériel génétique d’un être vivant regroupe les séquences codantes (gènes) et séquences non codantes

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10
Q

Qu’est ce qu’un gène

A

séquence codant pour une protéine ou un ARN

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11
Q

Combien de paires de bases (bp) équivaut à 1kb

A

1000 pb

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12
Q

V ou F

génome de la plupart des être vivants est sous forme d’ADN double brin

A

V

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13
Q

V ou F

La taille du génome est toujours en lien direct avec la grosseur de l’espèce

A

F

c’est majoritairement le cas, mais pas toujours

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14
Q

Au niveau du génome bactérien, quel structure permet l’échange entre les bactéries

A

le plasmide qui est de 3000 à 10000 bp

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15
Q

Combien de copies de plasmide y a t il par bactérie

A

environ 1 à 100

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16
Q

V ou F

La coupure du plasmide = enzyme de restriction

A

V

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17
Q

Dans le cas d’une enzyme de restriction, l’endonucléase reconnait une séquence spécifique ou non-spécifique

A

séquence spécifique généralement de 4 à 8 nucléotides, qu présentent un motif de palindrome

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18
Q

V ou F

Chaque enzyme reconnait et coupe une séquence palindromique qui lui est spécifique

A

v

19
Q

Quel est l’avantage entre les extrémités cohésives et celles franches

A

extrémités cohésives ont un avantage car il y a un simple brin en 5’ et en 3’ tandis que extrémités franches ne génèrent pas de simple brin

20
Q

En ce qui concerne le clonage conventionnel, quel est la limitation

A

la limitation est de trouver une enzyme qui coupe le plasmide et le gène d’intérêt au bon endroit

21
Q

En ce qui concerne le clonage conventionnel, qu’est ce qu’une ligase

A

une enzyme qui catalyse la formation du lien phosphodiester

22
Q

À quoi sert la préparation de plasmides lors d’un laboratoire

A
  1. centrifugation pour récolter bactéries
  2. lyse des bactéries à l’aide d’une lyse alcaline permettant la dénaturation des protéines et de l’ADN
  3. renaturation des plasmides
  4. précipitaiton des protéines et ADN chromosomique
  5. précipitation des plasmides
23
Q

Que contient le mélange visqueux lors de l’extraction de plasmides par lyse alcaline

A

plasmide dénaturé ET ADN chromosomique dénaturé

24
Q

Est ce que l’ADN peut se dénaturer et se renaturer

A

OUI!

ADN natif

dénaturation L NaOH ou chaleur (ADN simple brin) il y a bris de lien H

Renaturation : baisse du pH ou refroidissement lent

25
Q

Lors de la renaturation/dénaturation dans un laboratoire, pourquoi est il nécessaire de ne pas brasser/vortexer

A

pour éviter les bris de brin chromosomique (éviter bris mécanique)

26
Q

Lors de la renaturation/dénaturation dans un laboratoire, comment faisons-nous pour neutraliser le mélange visqueux

A

sur glace, PAS de vortex

27
Q

Que représente le précipité blanc

A

précipitation des protéines et de l’ADN chromosomique

28
Q

Après la centrifugation du précipité blanc, quel est le résultat

A

L’ADN plasmidique est dans le surnageant!

Surnageant = ADN plasmidique

Culot de protéines et d’ADN chromosomique

29
Q

Quel est l’électrophrèse

A

procédé permettatn la séparation de molécules chargées sur la base de leur mouvement dans un champ électrique

30
Q

Que représente anode et cathode

A

anode = +
Cathode = -

31
Q

Expliquer brièvement l’électrohorèse

A

Agarose (agar-agar purifié et extrait algues rouges)

Polymère de galactopyranose (répétition d’un dimère)

NB : toutes les molécules doivent passer dans les pores même si très grosses contrairement à la colonne d’exclusion

32
Q

Conditions/caractéristiques de la molécule qui déterminent sa migration dans un gel d’électrophorèse

A

dépend de :
a) charge électrique
b) forme
c) masse moléculaire

uniformiser la charge et la forme:
a) migrer uniquement selon la masse moléculaire

33
Q

Lors de l’électrophorèse, quel est la charge des acides nucléiques

A

ADN chargé négativement à pH plus grand ou égal à 7

NB : ratio charge / masse est constant

34
Q

En ce qui concerne l’effet de la forme ADN plasmidique, comment obtient-on la migration selon la taille uniquement?

Et

Comment limite-t-on l’impact de la forme?

A

en analysant ADN toujours sous la même forme donc permet de voir digérer ADN pour qu’il soit toujours linéaire

35
Q

Caractéristiques des gels (tamis moléculaires)

A

les particules DOIVENT traverser le gel

petites molécules = migration rapide
grosse molécules = plus de résistance

36
Q

Quel est l’effet de la migration de fragments d’ADN en fonction de la concentration d’agarose

A

plus le % d’agarose est bas, plus la grosseur de bp au bout est grande

37
Q

À quoi sert la coloration de gel d’agarose (coloration au bromure d’éthidium)

A

visualisation sur un transilluminateur UV

NB : agent mutagène donc porte gants

38
Q

Alternative moins dangereuse que le bromure d’éthidium

A

Redsafe

39
Q

Qu’est ce qui va affecter la vitesse de migration?

A

a) taille molécule (forme et charge uniformisées)

b)support : taille des pores (concentration et types)

c) tampon : force ionique et pH

d) force du champ électrique

40
Q

Est il facile ou difficile de toujours obtenir les mêmes conditions lors de l’électrrophérèse?

A

difficle!

utilisation de marqueur de poids moléculaires

41
Q

Explique les standards de poids moléculaire

A

la distance de migration est inversement proportionnelle au LOGARITHME de la taille de l’ADN

42
Q

Comment faisons nous pour déterminer la taille de fragments d’ADN

A

construction d’une courbe standard (échelle semi-log)

NB: il ne faut pas prendre de la section/zone non linéaire

43
Q

Expliquez une carte de restriction d’une molécule d’ADN

A

schéma représentant les sites des séquences reconnues par des enzymes de restriction

une carte est construite en digérant l’ADN avec plusieurs enzymes de restriction (digestion simple et multiple) et en analysant les fragments résultants par électrophorèse sur gel

carte de restrition servent à identifier les fragments d,ADN ou à mettre en évidence des polymorphismes

Économie de la santé (4 decks)

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