Siphoviridae (lambda) Julián Arcila Flashcards
(10 cards)
Material genético
El material genético es ADN de doble cadena , lineal, no segmentado, con una longitud de aproximadamente 48.500 pares de bases en el caso del fago lambda. Este genoma codifica cerca de 70 genes que controlan procesos como replicación, estructura, regulación y lisis celular.
Morfología
La morfología característica de los Siphoviridae incluye una cápside icosaédrica de 60 nm y una cola larga, delgada y no contráctil de 150 nm. En la base de la cola se encuentran fibras de adhesión que reconocen receptores específicos en bacterias
Nicho ecológico
Los Siphoviridae infectan principalmente bacterias como Escherichia coli y están presentes en una variedad de ambientes, especialmente en el intestino humano, donde representan más del 50 % de los fagos de morfología conocida. Se encuentran también en aguas residuales, suelos y ecosistemas bacterianos diversos.
Enfermedades asociadas
Aunque no infectan células humanas, la abundancia de Siphoviridae en el microbioma intestinal se ha asociado a enfermedades como el cáncer colorrectal, la enfermedad inflamatoria intestinal, la cirrosis hepática y trastornos metabólicos y neurológicos.
Aplicaciones científicas
El fago lambda ha sido fundamental en la biología molecular. Su ADN se utiliza como marcador de peso molecular en electroforesis. También ha sido clave para el desarrollo de técnicas como el phage display y el sistema de recombinación Red/Rec, usado en ingeniería genética bacteriana.
glosario palabras desconocidas
- No segmentado: El genoma está contenido en una sola molécula.
- Genes estructurales: Genes que codifican componentes físicos del virus.
- Cápside icosaédrica: Estructura con forma de icosaedro que encierra el ADN viral.
- Cola larga y flexible: Parte del virus usada para inyectar el ADN a la bacteria.
- Fibras: Estructuras en la base de la cola que reconocen a la célula bacteriana.
- TEM (Microscopía electrónica de transmisión): Técnica para observar estructuras virales.
- Cáncer colorrectal: Enfermedad asociada a alteraciones en el microbioma.
- Enfermedad inflamatoria intestinal: Grupo de enfermedades como la colitis ulcerosa o Crohn.
- Cirrosis hepática: Daño crónico del hígado.
- Marcador de peso molecular: Fragmentos de ADN usados como referencia en un experimento.
- Electroforesis en gel de agarosa: Técnica que separa fragmentos de ADN según su tamaño.
- Phage display: Método que permite mostrar péptidos o anticuerpos en la superficie de un fago.
- Red/Rec: Sistema usado en ingeniería genética bacteriana.
Pregunta María Paula Vivas.
¿Por qué está asociada al cancer colorrectal, cómo funciona esto si no infecta células humanas?
Los Siphoviridae pueden alterar el equilibrio de bacterias en el intestino al lisar selectivamente ciertas especies bacterianas favoreciendo la proliferación de bacterias patógenas o proinflamatorias asociadas al cáncer colorrectal
Rybicka-Kaźmierczak et al. (2023). The human phageome: niche-specific distribution of bacteriophages and their clinical implications.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8136144/
Pregunta de David Herran Martinez - 202122710: ¿Se conoce el mecanismo mediante el cual el fago lamba inyecta su material genético en la célula huésped?
Lambda se une al poro LamB de E. coli con su proteína de punta de cola, lo que desencadena un cambio conformacional que abre el canal de la cola. Con eso, forma un conducto a través de la membrana externa por donde pasa el ADN
Pregunta de Sophia Otálora Fajardo
¿De que forma se utiliza este virus en el sistema de recombinación Red/Rec, usado en ingeniería genética bacteriana?
facilitalalocalización exactade ADN exógeno en E. coli a través de tres proteínas: Exo corta los extremos 5′ del ADN lineal entrante, creando hebras sencillas que son homólogas al sitio objetivo; Beta se acopla a estas hebras sencillas y las empareja con la secuencia cromosómica, fomentando la recombinación homóloga y Gam inhibe la nucleasa RecBCD de la bacteria, evitando la degradación del ADN lineal y Gam inhibe la nucleasa RecBCD de la bacteria, salvando el ADN lineal de la degradación
William Camacho 202015470
¿Cuáles son los criterios utilizados para la demarcación de especies dentro del género Lambda?
se basa en la identidad genómica, en las variaciones estables por inserciones o deleciones específicas en regiones no esenciales, y en un enfoque politético que complementa con rasgos biológicos como el rango de hospedador y el ciclo de vida temperado
