Site actif Flashcards
Vrai ou faux
Le site actif est une zone restreinte des enzymes
Vrai
Que désigne le terme site actif?
La partie de l’enzyme qui va réagir avec le substrat et le cofacteur s’il y en a un de même que les résidus directement impliqués dans la catalyse et la synthèse du produit
Vrai ou faux
Le site actif occupe généralement une grande partie de l’enzyme
Faux, petite fraction du volume total (1-5%)
Ou peut généralement être localisé le site actif?
-Dans une poche ou une crevasse à la surface
-À l’intérieur de la protéine
-À l’interface entre les sous-unité
Comment est souvent formé le site actif d’enzymes dont le substrat est très volumineux
dépression ou crevasse
Quel est l’objectif d’avoir le site actif enfoui dans la protéine?
d’isoler le site actif du solvant
Quelles sont les possibilités d’accès au site actif quand celui-ci est enfoui dans la protéine?
-diffusion
-conformation ouverte/fermée
-Tunnels reliant la surface et le centre de la protéine
Que sont les effecteurs allostériques?
molécules qui modulent l’activité d’une enzyme
Comment appelle-t-on l’inhibition d’une enzyme par une molécule se liant au site actif?
inhibition orthostérique
Nomme trois propriétés des sites actifs
- Constituent un espace tridimensionnel
-Forment des microenvironnements spécifiques - Les acides aminés du site actif sont maintenus selon un arrangement préçis les uns par rapport aux autres et par rapport à la molécule de substrat
Vrai ou faux
Les substrats sont fixés aux sites actifs à l’aide de liaisons covalentes
Faux, liaisons non covalentes
Qu’est ce que la complémentarité géométrique et électronique?
Géométrique : complémentarité du site actif et du substrat
Électronique : Certains a.a du site actif sont disposé afin d’interagir spécifiquement avec le substrat pour l’attirer
Vrai ou faux
Un petit changement dans la formule chimique du substrat peut abolir sa liaison
Vrai
Que représente Kd?
L’affinité enzyme-substrat
Vrai ou faux
On retrouve habituellement beaucoup d’eau dans le site actif d’une enzyme
Faux, habituellement exlue
Vrai ou faux
Les sites actifs sont généralement hydrophobe
Vrai
Comment la faible constante diélectrique des sites actifs avantage la liaison enzyme-substrat?
augmente grandement la force des interactions électrostatique entre ceux-ci
Vrai ou faux
Une faible constante diélectrique n’a pas d’influence sur les pKa des chaines latérales d’a.a
Faux
Par quoi sont remplacées les interactions du substrat avec le solvant dans le site actif d’une enzyme?
Par les interactions spécifiques dans le site actid ce qui compense le cout énergétique d’exclusion des interactions avec le solvant
En général les sites actifs des enzymes sont largement…
Préformé, donc complémentaire à la forme de leur substrat
Que décrit le processus induced-fit?
Les enzymes subissent un certain changement de conformation lors de la liaison du substrat
Vrai ou faux
En général un enzyme possèdent une section de réaction et une section de relachement
Faux, réaction et spécificité
Pourquoi est utile des interactions entre des a.a et une protion du substrat qui n’est pas modifier au cours de la catalyse?
assurer une liaison stable au site actif
Quel rôle, à part assurer la spécificité et la majorité des réaction enzymatique peut jouer l’enzyme?
Augmente la probabilité de collisions efficaces entre les substrats
