somatisch gen recombinatie Flashcards
(14 cards)
Waarom worden de gensegmenten geherschikt?
de BCR en TCR kunnen niet direct worden overschreven van DNA naar mRNA. ze zijn te lang.
Hoe gebeurt Ig zware keten gen recombinatie en expressie?
een van de Jh gen segmenten zal zich plaatsen naast een van de Dh gen segmenten (DJh). Dit wordt gemedieerd door VDJ recombinasen. Vh zal daarmee combineren.(VDJh) dit wordt overschreven tot een lang pre-RNA dat ook informatie voor een mu keten bevat. via splicing wort primair RNA omgezet in mRNA dat codeert voor een volledige mu Ig keten bevat.
Wat is de functie van RAG?
recombinase-activation genes codeert voor VDJ recombinasen.
worden uitsluitend in ontwikkelende lymfocyten uitgedrukt en de recombinasen herkennen gebogen DNA -sequenties die de V,D en J gen segmenten en brengen deze bij elkaar.
Wat herkent een VDJ-recombinase?
recombination signal sequences (RSS), zorgen ervoor dat de regionale genen VDJ gebogen worden
Wat zijn de stappen van VDJ recombinatie?
synapsis:
klieving:
verwerking:
verbinding
Hoe verloopt synpasis van de VDJ recombinatie?
synapsis: delen van de locus worden toegankelijk gemaakt voor de recombinatie enzymen en de RSS’s worden bij elkaar gebracht zodat klieving en ligatie kan plaats vinden
Hoe verloopt klieving van de VDJ recombinatie?
dsDNA wordt geknipt thv RSS coderende sequentie
Hoe verloopt verwerking van de VDJ recombinatie?
DNA uiteinden worden bijgewerkt door toevoegen of verwijderen van nucleotiden waardoor een grotere diversiteit ontstaat
Hoe verloopt verbinding van de VDJ recombinatie?
de onderbroken ligamenten worden door ligase weer vast gemaakt
Hoe ontstaat de grote diversiteit aan antigenreceptoren?
somatisch gen recombinatie proces. door de willekeurige combinatie ontstaan er combinatorial diversity. (grootste gedeelte is junk)
Wat is de functie van een exonuclease?
het wegknippen van enkele nucleotiden waardoor er een nieuwe V regio ontstaat
Wat is de functie van het terminaal-deoxynucleotidyl transferase enzym (TdT)?
toevoegen van enkele nucleotiden thv de juncties (niet kiemlijn gecodeerde regio’s)
Hoe ontstaat ook nog junctional diversity door assymetrisch knippen?
DNA wordt assymetrisch geknipt en de gaps worden gevuld met P-nucleotiden. dit gebeurt in het CDR3 gedeelte van de V region.
Wat is combinatorial diversity?
de diversiteit verkregen door het aantal mogelijke combinaties van de VDJ regio’s.
