Tecniche di sequenziamento Flashcards

Da 29.1 a 34 (41 cards)

1
Q

Sequenziamento sanger. Generazione
Lunghezza reads
Limiti e vantaggi

A

29.1

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Q

Sequenziamento sanger. Come avviene se classico o automatizzato

A

29.1

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3
Q

Output sequenziamento sanger, descrizione

A

29.1

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4
Q

Formato file ottenuto da sequenziamento e descrizione

A

29.1

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5
Q

Cosa è il phred score. Come si calcola e minimo phred score accettabile per un sequenziamento

A

29.1

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6
Q

Roche 454. Generazione. Descrizione tecnologia e preparazione del campione

A

30

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7
Q

Rilevazione base con Sanger

A

29.1

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8
Q

Rilevazione base con Roche 454

A

30

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9
Q

Tecnologia illumina, preparazione del campione

A

30.1

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10
Q

Tecnologia illumina. Formazione cluster sulla flow-cell

A

30.1

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11
Q

Descrizione della flow cell illumina

A

30.1

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12
Q

Fase di sequenziamento Illumina. Come avviene

A

31

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13
Q

Seq. paired ends and sigle reads illumina, cosa ottengo con le due tecniche.
Metodo per paired ends

A

31

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14
Q

Rilevazione nt con illumina, diversi tipi di tecnologie

A

31

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15
Q

Svantaggi di illumina, a cosa sono dovuti?

A

31.1

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16
Q

Tecnologia solid. Preparazione della library e tecnica

A

32

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17
Q

Tecnologia solid rilevazione

18
Q

Tecnologia ion torrent, preparazione library e tecnica

19
Q

Rilevazione nt con ion torrent

20
Q

Tecnologia helicos. Preparazione campione e tecnica

21
Q

Rilevazione con helicos

22
Q

Tecnica pacbio. Preparazione campioni e tecnologia

23
Q

Rilevazione PacBio

24
Q

Flow cell per PacBio

25
Preparazione campione nanopore
34
26
Tecnologia nanopore come funziona
34
27
Rilevazione nanopore e output
34
28
Struttura nanoporo per sequenziamento nanopore
34
29
Come posso sequenziare direttamente RNA cellulare con che tecnica e con che accorgimenti
34
30
Reads Sanger
29.1
31
Reads Illumina
30.1
32
Reads roche 454
30
33
Reads ion torrent
32.1
34
Reads nanopore
34
35
Reads solid
32
36
Reads pacbio
33.1
37
Store raw data in nanopore
34
38
Ultimi miglioramenti per nanopore
34
39
Detection di basi modificate con nanopore, diverse tecnologie emergenti. Su quali principi si basano i diversi algoritmi
34
40
Nanopolish, cosa è e come funziona
34
41
Come hanno identificato la presenza di ribonucleotidi nel DNA? Perchè c'erano?
34 dietro