TEMA 2

Question 1

Com es el model de replicacio?

Answer 1

Semiconservatiu

2 cadenes formades per original i sintetitzada

Question 2

Que sha de fer perque es pugui dur a terme la replicacio?

Answer 2

La molec de dna sha dobrir gracies a uns enzims i es forma una estructura anomenada bombolla de replicacio( 2 horquilas) helicases
I a mes aquesta replicacio es bidireccional

Question 3

Com es fan les dos cadenes?

Answer 3

Una es fa 5’~3’ (continua)
Laltra es fa 3’~5’ (retardada) en fragments (fragments dOkazaki 1000-2000 nucleotids)
Sintesi presenta discontinuitat

Question 4

Quins son els enzims encarregats de la replicacio?

Answer 4

• dna polimerasa I
• dna ligasa
• dna polimerasa III

Question 5

Propietats dna polimerasa I

Answer 5

Per actuar necesita un extrem 3’ ~OH lliure
Seguint un motlle, comença a fer la sintesi de la cadena pero no en sintetiza la major part
Processivitat moderada (20 nucleotids)
Estructura 103kda
10 nucleotids/s

Question 6

Activitats enzimatiques de dna polimerasa I

Answer 6

Exonucleasa 3’-5’ corregeix errors
Exonucleasa 5’-3’ elimina el RNA del encebador
Polimerasa 5’-3’ sintetitza una petita part del dna

Question 7

Propietats dna ligasa

Answer 7

Uneix els fragments dOkazaki entre si a traves dun enllaç fosfodiester entre els extrems dels fragments
Ho fa a traves de atp i nad+

Question 8

Que son els fragments de klenow?

Answer 8

De vegades la dna polimerasa I perd activitat enzimatica exonucleasa 5-3 i la resta del fragment es el fragment de klenow

Question 9

Carac dna polimerasa III

Answer 9

Molta procesivitat (1000 nucleotids) gracies a la subunitat beta afaga el dna
Alta potencia catalitica (1000/sec)
Molt fiable

Question 10

Replicacio procariotes (e coli)
Iniciacio

Answer 10

Comença a oriC
DnaA reconeix seq nucleotids oriC i separa 2 cadenes amb prt HU i IHF
Helicasa (complex dnab+dnac) separa dos cadenes trencant ponts hidrogen
Ssb separen tmb i donen estabilitat
Dna girasa esta perque davant la bombolla hi ha superenrotllament positiu es posa superenrotllament negatiu

Question 11

Replicacio e coli enlongacio a lagging strand

Answer 11

Primasa (DnaG) fa primer
I tmb hi ha primosoma (primasa+ helicasa lagstr)
Polimerasa III sintetiza major part cadena
Polimerasa I elimina encebador i sintetitza nucleotids
Dna ligasa uneix fragments
Tmb pol I arregla errors amb exo 3-5
I polimerasa II arregla errors fisics (no esta a replicacio)

Question 12

Replicacio ecoli leading strand

Answer 12

Rna primasa crea 1 primer nomes
Polimerasa III fa la cadena
Pol I corregeix errors fa alguns nucleotids i treu encebadors

Question 13

Terminacio dna ecoli

Answer 13

Com cromosoma es circular es formen 2 forquilles replicacio que avancen en sentits oposats fins que es troben al punt oposat de loric C , el TER
quan les dos forquilles entren a TER, es un punt de no retorn

Question 14

Enzims per acabar replicacio ecoli

Answer 14

tus: contrahelicasa que evita obertura dna
Dna girasa: produeix talls de doble cadena , gracies a aquest tall, un segment de dna passa a laltre costat i son lligats de nou, formant nou cromosoma

Question 15

Carac replicacio eucariotes

Answer 15

Fragments okazaki molt curts 100vs 1000 en bacteris
5 dna polimerases
No tenen activitat exonucleasa 5-3
Els frag seliminen amb
(RNAasa H1 rotura endonucleolitica
FEN1/MF1: exonucleasa que elimina rna)
Replicacio mes lenta que en procariotes (100-250 bases/sec)

Question 16

Problemes replicacio eucariotes

Answer 16

Replicacio mes lenta perque te molts oriC
Replicons i fusions de bombolles de replicacio
Dna lineal, pot perdre info als extrems i es necessiten telomers
Estructura nucleosomica per tant shan de desmontar els nucleosomes
Tenen orignes de replicacio ARS

Question 17

Subunitats dna polimerasa eucariotes

Answer 17

Alfa:inica replicacio
Beta:repar dna
Delta: aporta major part nucleotids gracies a diverses subunitats (PCNA i RFC)
Gamma: fer dna mitocondrial
Epsilon: funcio desconeguda

Question 18

Perque hi ha regulacio de la replicacio als eucariotes?

Answer 18

Perque la sintesi del dna nomes pot passar una vegada per cicle celular mentre que els procariotes es independent del cicle celular

Question 19

En que consisteix la regulacio de replicacio en eucariotes?

Answer 19

La seq ARS (=oriC) recluta les proteines ORC
Les ORC recluten Cdc6p (enzims per preparar replicacio)
Gracies als Cdc6p es recluten les MCM inactives (prt manteniment minicrosoma)
Ve b-cdk ciclina i cdc7-dbf4 amb activitat quinasa que activa MCM quan la cel es divideix
Les MCM senrotllen i actuen sobre les helicases

Question 20

Sintesi cadena continua a eucariotes

Answer 20

Els primers es sintetizen amb polimerasa alfa
Suneix dna polimerasa delta/PCNA (PCNA abrazadera deslizante) fara sintesi dna
Necessita RFC per ensamblar anell

Question 21

Sintesi lagging strand en eucariotes

Answer 21

1) Comença amb RPA que suneix a ssDNA (estabilitza la molecula) equivalent a ssb de procariotes
2)Primasa suneix a pol alfa i sintetizen encebador (10 nucleotids ) i frag oz (15-30 nucleotids)
El complex pol alfa/primasa solten el dna
3) RFC ajuda a unirse a pol delta i PCNA, continua sintesi frag (majoria cadena 130-200 nucleotids) i el complex es deixa anar quan toca amb lanterior fragment okazaki
4) RNAasa H degrada encebador perque quedi 1 nucleotid
5) RNAasa H degrada el primer RNA fins lultim nucleotid, lultim el treu FEN1 (flap1) deixa un flap que treu ell mateix
6) aixo ho rellena pol delta/PCNA i la ligasa els uneix

Question 22

Com es fa la replicacio als extrems?

Answer 22

A partir de telomers
Ve lenzim telomerasa i sintetiza un fragment de dna a partir del seu motlle de rna (telomer) a la cadena llarga
Es sintetiza un encebador a la curta i ve polimerasa a acabar la replicacio

Question 23

Com es la fidelitat de replicacio

Answer 23

Alta
Gracies a les dna polimerases es poden detectar mutacions
Sequivoca poc
Es poden veure errors gracies al fragment de klenow

Question 24

Que es lestres replicatiu?

Answer 24

Quan una cel es replica es produeix estres replicatiu que consisteix en que una cel queda amb pocs nucleotids i es formen dimers