Tema 3. Clasificación bacteriana

Question 1

Realice un punteo acerca de la hipótesis del RNA sobre el origen de la vida

Answer 1

• Protobiontes fueron los antecesores de LUCA
• Cianobacterias fueron de los primeros descendientes de LUCA.
• Proliferación de cianobacterias provoca la acumulación de oxígeno en la atmósfera
• Acumulación de oxígeno provoaca la aparición de la respiración aerobia

Question 2

¿Qué es una cepa?

Answer 2

Población de microorganismos descendientes de un solo organismo o de un cultivo puro aislado

Question 3

¿Qué es un biovar?

Answer 3

Son variantes de cepas caracterizadas por diferencias bioquímicas o fisiológicas

Question 4

¿Qué es un morfovar?

Answer 4

Son variantes de cepas caracterizadas por diferencias morfológicas.

Question 5

¿Qué es un serovar?

Answer 5

Variantes de cepas caracterizadas por diferencias detectables por anticuerpos.

Question 6

Mencione las dos interpretaciones del sistema de clasificación de la vida

Answer 6

• Sistema de Whitaker
• Sistema de Woese-Fox

Question 7

Sistema de clasificación de la vida según Whitaker

Answer 7

Propone 5 reinos: Plantae, Fungi, Animalia, Protista y Prokaryotae (Monera)

Question 8

Sistema de clasificación de la vida según Woese-Fox

Answer 8

Propone 3 dominios: Archaea, Bacteria, Eukaria.

Question 9

¿De dónde surgen los tres dominios de la vida?

Answer 9

De la comparación del rRNA de la subunidad pequeña de los ribosomas (SSU rRNA)

Question 10

Mencione los tres tipos de clasificación de microorganismos

Answer 10

• En función a sus fuentes de carbono y energía (no taxonómico)
• En función a su tolerancia al oxígeno.
• Segun Murray (taxonómico)

Question 11

Clasificación de los organismos en función de sus fuentes de carbono y energía. (esquema)

Answer 11

Ver tabla.

Question 12

Características de los organismos en función de las fuentes de carbono y energía

Answer 12

• Fotoautótrofos: Usan luz y CO₂ para producir azúcares.
• Quimioautótrofos: Usan Fe, N₂ o S₂ y CO₂ para producir moléculas orgánicas.
• Fotoheterótrofos: Utilizan compuestos orgánicos de otros organismos y luz para producir moléculas orgánicas
• Quimioheterótrofos: Utilizan compuestos orgánicos (de otros organismos) y O₂ para producir moléculas orgánicas

Question 13

Características de la clasificación de Murray

Answer 13

Elabora cuatro filos de bacterias en función de su pared celular. Previo a los tres dominios de la vida según Woese-Fox.

Question 14

Clasificación de Murray (Esquema)

Answer 14

Ver tabla.

Question 15

Filos de la clasificación de Murray

Answer 15

• Firmicutes
• Gracilicutes
• Mendosicutes
• Tenericutes

Question 16

Características del phylum Firmicutes

Answer 16

“Piel fuerte”. Gram (+) la mayoría. Células en formas de cocos o varas. Muchos producen endosporas. Rol importante en el deterioro de bebidas alcoholicas (avinagración).

Question 17

Características del phylum Gracilicutes

Answer 17

“Piel delgada”. Gram (-)’s, pared delgada de mureina. Grupo representativo: Proteobacteria.

Question 18

Características del phylum Mendosicutes

Answer 18

“Pared celular poco común (distinta al péptidoglucano)”. Constituido por arqueobacterias (arqueas).
- Aerobias y anaerobias
- Generalmente termófilas
- Pueden vivir en concentraciones elevadas de iones salinos
- Pared celular distinta al peptidoglucano

Question 19

¿Qué tipo de organismos están englobados en el phylum mendosicutes?

Answer 19

Archaeas

Question 20

Características estructurales del phylum Tenericutes

Answer 20

• Derivados de firmicutes.
• No sintetizan precursores de peptidoglucano, por tanto son ausentes de pared celular y algunas veces de glicocalix.
• Presentan esteroles para darle rigidez a su membrana

Question 21

Características cualitativas del phylum Tenericutes

Answer 21

• Resistentes a la penicilina y derivados.
• Sensibles a lisis por shock osmótico.
• Pleomórficos.

Question 22

Mencione las características del orden Mycoplasma

Answer 22

Phylum Mollicutes o Tenericutes (sinonimo) (antiguo)
- Requieren esteroles en su membrana plasmática.
- Carecen de peptidoglucano.
- Habitat humano o animal, Tº optima de crecimiento 37ºC.

Question 23

Mencione los phylum de la clasificación actual bacteriana

Answer 23

• Termofilas
• Gram (+)’s
• Espiroquetas
• Fotosintéticas (Se cree arcáico)
• Proteobacterias
• Chlamidia
• Bacteroides

Question 24

Mencione los tipos de características del orden Pseudomonas

Answer 24

Características generales, metabólicas, ambientales y científicas.

Question 25

Mencione las características generales del orden Pseudomonas

Answer 25

Clase: Gammaproteobacteria (actual) - Taxón bastante heterogéneo, compuesto por 60 especies. - Crecimiento en ambientes muy variados y adversos dada su regulación compleja del metabolismo. - Resistencia a antibióticos.

Question 26

Mencione las características metabólicas del orden Pseudomonas

Answer 26

- Respiración aerobia, quimioheterótrofas. - Pueden utilizar hasta 80 sustancias distintas como fuentes de carbono, oxidándolas completamente hasta CO₂. - Número inusualmente alto de genes para el catabolismo provoca una gran capacidad metabólica.

Question 27

Mencione las características ambientales del orden Pseudomonas

Answer 27

- Muy importantes en el proceso de mineralización (descomposición de materia orgánica en inorgánica). - Importancia en la naturaleza y tratamiento de aguas residuales

Question 28

Mencione las características científicas del orden Pseudomonas

Answer 28

- Fueron utilizados ampliamente como organismo modelo en investigación bioquímica y fisiológica permitiendo avances en la comprensión de: * Biofilms bacterianos * Señalización extracelular * Procesos asociados a la patogenicidad.

Question 29

Mencione algunos ejemplos de organismos del orden Pseudomonas

Answer 29

- Pseudomonas aeruginosa. - Pseudomonas fluorescens.

Question 30

Mencione las dos características más importantes del índice C+G

Answer 30

- Solo si dos organismos son fenotípicamente iguales y además, su contenido de G+C es muy parecido, puede que exista un parentezo entre ellos. - Si dos organismos difieren en más de 10%, sus genomas presentan secuencias de bases muy distintas.

Question 31

Mencione la importancia del índice G+C

Answer 31

- Permiten confirmar relaciones filogenéticas apoyados con información extra. - Es particularmente útil para caracterizar generos en bacteria y archea.

Question 32

Mencione los dos métodos más importantes de determinación del índice G+C

Answer 32

- Por hidrólisis del DNA y cromatografía líquida de alta resolución. - Por métodos físicos, estimando la temperatura de deshibridación de la doble hembra que refleja el número de dobles o triples enlaces en el DNA.

Question 33

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto al DNA complejado con histonas.

Answer 33

Bacteria: No. Archea: Algunas. Eukaria: Sí.

Question 34

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a los cromosomas

Answer 34

Bacteria: Usualmente un solo cromosoma circular (pueden haber varias réplicas del mismo cromosoma). Un solo origen de replicación. Algunas son poliploides (varios cromosomas distintos) Archaea: Un solo cromosoma circular. Varios orígenes de replicación. Algunas son poliploides. Eukaria: Varios cromosomas lineales. Multiples orígenes de replicación. Varios son poliploides.

Question 35

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a los plásmidos

Answer 35

Bastante común en Bacteria y Archea. Raros en Eukaria.

Question 36

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a los intrones

Answer 36

Raros en Archea y Bacteria. Sí en Eukaria.

Question 37

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a las organelas membranosas

Answer 37

No, nunca en Bacteria ni Archea. Sí en Eukaria.

Question 38

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a los lípidos intermembrana

Answer 38

Bacteria: Enlaces Ester en fosfolípidos forman bicapas (algunas pueden tener esteroles). Eukaria: Enlaces Ester en fosfolípidos forman bicapas. Tienen esteroles. Archaea: Enlaces dieter-glicerol en bicapas y tetraeter diglicerol en monocapas lipídicas

Question 39

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto al péptidoglucano o mureína.

Answer 39

Bacteria: Sí. Archea: No. Eukaria: No.

Question 40

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a los ribosomas

Answer 40

70S en Bacteria y Archea. 80S en Eukaria.

Question 41

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto al citoesqueleto

Answer 41

Rudimentario en Archea y Bacteria. Sí en Eukaria.

Question 42

Mencione las diferencias entre Archea, Bacteria y Eukaria respecto a las estructuras externas celulares

Answer 42

Bacteria: Flagelo; fimbrias (pili) común. Archaea: Arquelo; pili común. Cilios exclusivos de eukaria.

Question 43

Mencione algunas características de la estructura de Archaea

Answer 43

- Carentes de peptidoglucano, pared celular muy diversa. - Membrana de dieter-glicerol en bicapas y tetraeter-diglicerol en monocapas. - Morfología cocoide, bacilar o pleomórfica

Question 44

Mencione algunas características cualitativas de Archaea

Answer 44

- Reproducción típica bacteriana (fisión binaria, fragmentación y gemación). - No se conocen patógenos dado que están adaptadas a ecosistemas más agresivos. - En su mayoría son no viables y solo se los conoce por métodos moleculares.

Question 45

Clasificación arcáica segun Bergey's

Answer 45

- Euryarchaeota - Crenarchaeota - Thaumarchaeota

Question 46

Mencione la clasificación de las archeas según sus características

Answer 46

- Extremófilos - Metanógenos - Fotosintéticas (Clasificado como bacteriano)

Question 47

Mencione los tipos de archeas extremófilas

Answer 47

- Termófilos - Halófilos

Question 48

Mencione las características de las archeas termófilas

Answer 48

- DNA, RNA, membranas y proteínas no funcionan apropiadamente por debajo de los 45 ºC.

Question 49

Mencione los géneros más representativos de las archeas termófilas

Answer 49

- Acidanus - Pyrodictium - Sulfolobus

Question 50

Mencione las características de las archeas halófilas

Answer 50

- Requieren de al menos 9% de sal para mantener su pared celular. - Contiene pigmentos rojos o naranjas a manera de protección de luz UV (carotenoides).

Question 51

Mencione un organismo representativo de entre las archaeas halófilas.

Answer 51

Halobacterium salinarium

Question 52

Mencione las características de las archaeas metanogénicas

Answer 52

- Grupo grande de Archea - Su metabolismo está relacionado con la conversión de CO₂ y H₂ en CH₄. - Son los mayores contribuidores al metano ambiental, dado que algunos viven en colonias en el tracto digestivo de algunos animales.

Question 53

Mencione las clases del phylum Fotosintéticas (archaea y bacteria)

Answer 53

- Bacterias verde azuladas (Cyanobacteria) - Bacterias verdes sulfurosas y no sulfurosas - Bacteras púrpura sulfurosas y no sulfurosas

Question 54

Mencione la clasificación de microorganismos en función de sus requerimientos de oxígeno

Answer 54

- Aerobios obligados - Anaerobios obligados - Anaerobios facultativos - Anaerobios aerotolerantes