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transcripcion Flashcards

(69 cards)

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1
Q

¿Qué es la expresión genética?

A

Síntesis de las moléculas que realizan funciones, principalmente proteínas

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Q

¿Cuáles son los procesos de los que consta la expresión genética?

A
  • Transcripción
  • Traducción
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Q

¿Qué es una unidad transcripcional?

A

Un segmento de ADN que se transcribe a un ARNm

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4
Q

¿Cuáles son los componentes esenciales de la unidad transcripcional?

A
  • Promotor
  • Secuencia codificante
  • Terminador
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Q

¿Qué es un promotor?

A

Es una secuencia específica de tamaño variable en donde se encuentran dos secuencias consenso una a -10pb y a -35pb

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6
Q

¿Cuáles son los polipéptidos que forman a la RNAPolimerasa en procariotes?

A
  • α
  • β
  • β’
  • Sigma
  • Omega
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7
Q

¿Cuál es la subunidad que reconoce y permite la unión de la RNApolimerasa al sitio de inicio de la transcripción?

A

Sigma

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8
Q

¿Cuáles son las subunidades que forman la enzima central de la RNApolimerasa procariota?

A
  • β
  • β’
  • α
  • Omega
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9
Q

¿Cómo se llama la hebra del DNA a la que se une la RNApolimerasa para sintetizar el RNAm?

A

Cadena molde o cadena templada o no codificante

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10
Q

¿Cómo se llama la hebra del DNA que es 100% idéntica a la secuencia de ARNm, a diferencia de T-U?

A

Cadena codificante

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11
Q

¿Cuándo comienza la elongación en procariotas?

A

Cuando el factor sigma se libera

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12
Q

¿Qué pasa en la iniciación de la transcripción?

A

Se une el factor sigma a la caja TATA -10pb y elemento a -35pb, y después permite la unión de RNA polimerasa para formar la burbuja de replicación

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13
Q

¿Qué es la burbuja de transcripción?

A

Hélice dúplex híbrida (ADN + un pequeño transcrito de ARN) y la RNA polimerasa

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14
Q

¿Cuál es el radio de extensión de la RNApolimerasa?

A

20-50 pb/seg

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15
Q

¿Qué es una señal de terminación?

A

Es una secuencia palindrómica rica en GC seguida de AT

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16
Q

¿Qué estructura se produce en el RNA transcrito para detener la transcripción?

A

Estructura de tallo y asa por unión de las secuencias GC

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17
Q

¿Cuáles son los tipos de terminación en procariotas?

A
  • Independiente de Rho
  • Dependiente de Rho
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18
Q

¿Qué es la secuencia rut?

A

Es la secuencia en cis para la unión de rho

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19
Q

¿Cómo actúa la proteína rho en la terminación?

A

Tiene acción helicasa para disociar puentes de hidrógeno entre bases

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20
Q

¿Cuáles son los elementos en cis que forman parte de la unidad transcripcional en procariotas?

A
  • Promotor
  • Caja -35
  • Caja TATA -10
  • Operones
  • Terminador secuencia rica en GC
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21
Q

¿Cuáles son las partes del ARNm en procariotas?

A
  • UTR 5’ con la secuencia shine
  • Códon de inicio
  • Secuencia codificante
  • Códon de término
  • UTR 3’
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22
Q

¿Cuántas y cuáles RNA polimerasas hay en organismos eucariontes?

A
  • RNAPOL I
  • RNAPOL II
  • RNAPOL III
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23
Q

¿Qué transcribe la RNA pol I?

A

ARN ribosomas de 18s y 28s

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24
Q

¿Qué transcribe la RNA pol II?

A

ARN mensajero

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25
¿Qué transcribe la RNA pol III?
ARNt y ARN pequeños
26
¿Cuáles son los elementos reguladores en cis que pueden presentar los organismos eucariontes?
* Promotores * Enhancers * UAS * Silenciadores * Terminadores
27
¿Qué es la región de inicio o INr?
Es una región característica de una A flanqueada por pirimidinas
28
¿Dónde se localiza la caja TATA en eucariotas?
A -25pb
29
¿A dónde se une la RNApol II en caso de que el promotor no presente caja TATA?
Al elemento DPE
30
¿Quién forma el complejo pre inicio de la transcripción eucariota?
TBP + factores de transcripción + 18 subunidades más
31
¿Qué elemento reconoce el promotor y realiza una curvatura en el ADN?
TBP del complejo TFIID
32
¿Cuál es el factor de transcripción del complejo preinicio que tiene actividad helicasa y cinasa?
TFIIH
33
¿Qué factor de transcripción fosforila el CTD o heptapéptido de la RNApol II para iniciar la elongación?
TFIIH
34
¿Qué complejo reconoce el promotor en eucariotas?
TFIID que contiene a TBP y TAFs
35
¿Qué factor de transcripción posiciona a la RNApol II?
TFIIB
36
¿Cómo se compone el complejo preinicio de la transcripción en eucariotas?
* TFIID (TBP TAFs) * TFIIA * TFIIB * TFIIF * TFIIE * TFIIH
37
¿Cuáles son los elementos proximales al promotor?
* TATA * Caja GC * Caja CAAT
38
¿Cuáles son los elementos distales al promotor?
* Enhancers * Silenciadores
39
¿Cuáles son las funciones del enhancer?
* Cambiar la estructura del DNA templado * Influir en la densidad del superenrollamiento * Proveer un sitio de entrada para la RNA pol
40
¿Qué es el mediador en transcripción?
Coactivador transcripcional que ayuda a mantener la comunicación entre los enhancers y los factores de transcripción con la RNApol
41
¿Cuál es la estructura del mediador?
* Cabeza * Módulo medio * Módulo cola * Módulo CDK8
42
¿A qué se une el módulo de la cabeza del mediador?
RNApol
43
¿A qué se une el módulo de cola del mediador?
Enhancer
44
¿Qué nombre recibe el RNA antes del splicing que aún contiene intrones?
RNA heterogéneo nuclear (RNAhn)
45
¿Cuáles son las tres modificaciones que sufre el RNAhn?
* Capping * Splicing * Cola poli A
46
¿Qué enzima es encargada de añadir el cap 5'?
Guanil transferasa
47
¿En qué momento ocurre el capping?
Se detiene la RNApol a 30 nucleótidos después de INR
48
¿Cuál es la función del cap 5'?
Proteger de la degradación de las exonucleasas 5'-3'
49
¿Cuáles son los factores de corte y poliadenilación en la generación de la cola poli A?
* Factor de estimulación de corte (CstF) * Proteína PABP
50
¿Cuál es el sitio de unión de los factores de poliadenilación?
Sitio AAUAAA
51
¿Cuál es el sitio de unión de los factores de estimulación de corte?
GU
52
¿Qué proteína sintetiza la poli A en dos fases?
Proteína PABP y PABP II
53
¿Qué hace PABP en la síntesis de poli A?
Agrega primero una cadena de 10 nucleótidos de A
54
¿Qué hace PABP II en la síntesis de poli A?
Agrega 200 A
55
¿Cuál es el tamaño típico de los exones?
100-200 pb
56
¿Cuál es el tamaño típico de los intrones?
>1 kb
57
¿Cuáles son las pares de bases que definen dónde se corta el intrón?
GU-AG
58
¿Qué sitio conservado tiene la secuencia UACUAAC donde ocurre el ataque nucleofílico para el splicing?
Sitio de ramificación
59
¿Qué complejo molecular es responsable del splicing del ARNm de 12 MDa?
Spliceosoma
60
¿Cómo se conforma el spliceosoma?
* 5 snARN * 70 proteínas de ensamblaje * 30 proteínas catalíticas
61
¿Cuáles son las reacciones por las cuales se da el corte del intrón?
2 reacciones de transesterificación
62
¿Qué snARN reconoce el extremo GU 5' formando el complejo E?
U1
63
¿Qué snARN reconoce el sitio de ramificación del intrón formando el complejo A junto con U1?
U2
64
¿Cómo está conformado el complejo B1 en el splicing?
* U1 * U2 * U4/U6 * U5
65
¿Cuándo se vuelve un spliceosoma activo formando el complejo B2?
Cuando se liberan U1 y U4
66
¿Qué ocurre en el complejo C1?
U6 se une a GU 5' y a U2 formando un lazo o lariat por la primera transesterificación
67
¿Qué ocurre en el complejo C2?
U5 mantiene una unión con ambos exones permitiendo la segunda reacción de transesterificación, liberando al intrón y uniendo a los exones
68
¿Qué complejo regula la exportación del RNAm?
EJC
69
¿Cuál es la principal proteína de exportación?
TAP

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