Transcription Flashcards
(44 cards)
Que fait la transcription
Transforme l’ADN en ARN
Comment fonctionne l’ARN pol
Synthétise l’ARN de 5’ à 3’
Synthétise une copie complémentaire du brin matrice (qui est lu de3’ à 5’)
L’ARN a la séquence du brin d’ADN codant, mais avec des ribonucléotides au lieu de désoxyribonucléotides et des U au lieu de T
Quelle est la structure de l’ARN
À cause des intéractions entre bases, elle a une structure secondaire et tertiaire
Que sont les pseudoknot
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles dans la structure secondaire de l’ARN
Décrit l’Action de l’ARN pol
Déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par l’ARN pol
Reformation de la double hélice en arrière de l’ARN pol
Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (hétéroduplex)
Caractéristiques de l’ARN pol
Synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
Transcrit de 5’ à 3’
PAs besoin d’Amorce
Transcription n’A pas à être aussi précise que la réplication puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit
Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides à son site actif
Comment l’ARN pol sait ou commencer
Séquences sur l’ADN signalent l’initiation et terminaison
Promoteur=initiation de la transcription
Terminateur=terminaison de la transcription
De quoi a besoin la polymérase pour initier et terminer la transcription
Facteurs protéiques et signaux dans l’ADN
Que fait le facteur sigma
Dans les procaryotes, s’associe à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
Ou est recrutée et relachée l’ARN pol
Promoteur, avec le facteur sigma
Signal de stop
Quand est relaché le facteur sigma
10 nucléotides après l’initiation de la transcription
Quand est relachée l’ARN pol de l’ADN
Au niveau d’un signal de stop (arrêt de la transcription)
Qu’est-ce que la séquence consensus ou canonique
Ordre calculé des nucléotidiques ou aa trouvés à chaque position dans un alignement de séquences
Représente les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres
Des pourcentages des motifs de séquences similaires sont ainsi calculés pour chaque position
Qu’est-ce que le facteur sigma
Nécessaire à l’initiation de la transcription qui permet la sélection du promoteur du gène à transcrire
Il y a plusieurs facteurs sigma chez les procaryotes
S’associe à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription avant de se lier au promoteur
Que reconnaissent les facteurs sigma
Une paire de courts motifs (séquences) conservés: appelés boites -10 et -35 à cause de leur distance du site d’initiation de la transcription
LA position de cette séquence consensus dicte le brin à utiliser ainsi que le sens de la transcription
Qu’est-ce que la séquence consensus des promoteurs
Séquence idéale obtenue par analyse statistique des fréquences des bases à chaque position
Qu’est-ce qu’un promoteur fort
Plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus (idéale) plus grande sera l’affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la transcription
Ou est le point de repère de l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription
La séquence TATAAT (-10)
Comment se fait la reconnaissance du promoteur par l’ARN pol avec le facteur sigma
Liens chimiques faibles
Décrit la transcription procaryotee
1) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant la transcription. Ce complexe ira se fixer sur le promoteur.
2) Le contact de l’ARN polymérase avec le promoteur entraine l’ouverture locale de la double hélice d’ADN : bulle de transcription
3) Initiation de la synthèse d’ARN à 50 ribonucléotides/seconde
4-5) Relachement du facteur sigma après la synthèse d’une chaine de +/- 10 ribonucléotides ET élongation
6) Rencontre du signal de terminaison: il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux intramoléculaires. Lorsque l’ARN se met sous cette forme, cela indique à l’ARN polymérase qu’elle doit être relâchée
7) L’ARN pol se détache, libérant l’ARN. L’ARN pol peut ensuite aller retrouver un facteur sigma pour enclencher une nouvelle transcription
De quoi est composé le signal de terminaison eucaryote
2 boites riches en G et C
À l’extrémité de l’ARN néo-synthétisé se trouve le signal de terminaison de la transcription encodée par l’ADN. La séquence d’ARN transcrite du signal de terminaison permet la formation d’une tige-boucle riche en G-C (hairpin, épingle à cheveux) suivi d’une série de U qui crée une contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase
Cela favorise le détachement de l’ARN polymérase
Combien d’ARN pol chez les eucaryotes
3 et produisent plusieurs types d’ARN
ARNm qui codent pour les protéines (ARN pol II)
ARNr qui composent les ribosomes (ARN pol I)
ARNt qui servent d’adaptateur lors de la synthèse protéique (ARN pol III)
Petits ARN qui sont utilisés dans différents processus cellulaires (ARN pol III) comme les snRNA et snoRNA
Décrit le promoteur pour l’ARN pol II dans les eucaryotes
Beaucoup plus complexe que pour les procaryotes
LA boite TATA située 25 pb en amont du site d’initiation de la transcription sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription
Des facteurs généraux de la transcription recnnaissent et se lient à la boite pour former le complexe d’initiation de la transcription avec l’ARN pol II
D’autres séquences d’ADN conservées à -80 pb (la CAAT box) et à -100 pb (la GC box) font partie du promoteur basal et augmentent son efficacité. Ces séquences sont impliquées dans la régulation de la transcription des gènes et sont liées par des GTF et par des facteurs (protéines) activateurs spécifiques
Quels sont les basal transcription factors
GTF (facteurs de transcription généraux)
TFIID: composé de la sous-unité TBP qui reconnait la boite TATA et de la sous-unité TAF qui reconnait les autres séquences d’ADN près de l’origine de transcription et régule la liaison à l’ADN pour la TBP
TFIIB: positionne correctement l’ARN pol au site de début de transcription
TFIIF: stabilise les interactions de l’ARN pol avec TBP et TFIIB, aide à attirer TFIIE et TFIIH (la régule aussi)
TFIIE: attire et régule TFIIH
TFIIH: sépare les brins d’ADN au site de début de transcription, phosphoryle Ser5 de l’ARN pol CTD; libère ARN pol du promoteur
