Va. Extracción, cuantificación y purificación de AN Flashcards

(52 cards)

1
Q

Primer paso en la tecnología del DNA recombinante

A

aislamiento del DNA

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2
Q

extracción de DNA genómico

A
    • muestra de células
      añadir buffer de lisis para mantener pH, romper membranas, desnaturalizar y degradar proteínas
  • precipitación de proteínas
  • precipitación del DNA con alcohol frío y sal
  • lavados
  • resuspensión en agua libre de nucleasas
    -cuantificación y determinación de la pureza
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3
Q

Qué contiene el buffer de lisis

A

50 mM tris-HCl
pH 8

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4
Q

Buffer para mantener el pH en el cual el DNA se mnntiene estable y con carga negativa

A

50 mM tris-HCl

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5
Q

1% SDS

A

detergente aniónico para romper las membranas promoviendo la liberación del DNA

desnaturaliza proteínas

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6
Q

Qué pasa cuando el SDS entra en contacto con la célula

A

captura los lípidos y las proteínas

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7
Q

Qué es la proteinasa K

A

una seriana proteasa

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8
Q

Cuando está activa la proteinasa K

A

bajo condiciones desnaturalizantes

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9
Q

En dónde se encuentra activa la proteinasa K

A

sobre proteínas nativas y desnaturalizante

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10
Q

Qué inactiva la proteinasa K

A

RNAsas
DNAsas

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11
Q

Qué incrementa la proteinasa K

A

la pureza del DNA
la calidad / cantidad de DNA no degradado

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12
Q

Con qué se pueden precipitar las proteínas

A

con acetona

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13
Q

En la precipitación de proteínas, dónde se encuentra el pellet

A

en el precipitado

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14
Q

En la precipitación de proteínas, dónde se encuentra el ácido nucleico

A

sobrenadante

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15
Q

Qué se necesita para la precipitación del DNA

A

alta concentración de sales
alcohol frío

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16
Q

Neutralizan las cargas negativas de los grupos fosfatos

A

los iones Na+

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17
Q

En la precipitación del DNA, las moléculas de DNA se juntan o se separan

A

se juntan

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18
Q

El DNA NO es soluble en …

A

etanol

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19
Q

Polaridad RNA >

A

DNA
RNA no precipita

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20
Q

Lavados

A

etanol al 75% remueve sales e impurezas
NO DISUELVE DNA

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21
Q

Resuspensión del DNA

A

se solubiliza en agua libre de nucleasas

22
Q

Coeficiente para la determinación de la pureza

23
Q

Pureza DNA óptima

24
Q

pureza - contaminación con RNA

25
Método para a extracciín de RNA
método de Fenol-cloroformo
26
método de Fenol-cloroformo
rompe membranas, desnaturaliza proteínas y libera AN
27
El RNA permanece disuelto en la fase
acuosa
28
El DNA menos polar que el RNA se queda entre las fases...
acuosa y fenólica
29
Pureza RNA óptima
2-2.2
30
Geles de poliacrilamida
muestras de proteínas
31
Geles de agarosa
análisis de AN
32
Cómo está formada la agarosa
b-(1-4)-(3-6)-anhidro-L-galactosa a-(1-3)-D-galactosa
33
La agarosa es soluble a una Tem
superior a 65°
34
Concentración de la agarosa
0.5 a 4%
35
La movilidad disminuye al...
aumentar el % de agarosa
36
A menor voltaje...
mayor difusión lateral
37
A mayor tiempo de corrida...
mayor resolución
38
Al imcrementar la temperatura...
la movilidad incrementa
39
Bromuro de etidio
se intercala entre las bases detecta hasta 1ng de dsDNA en la agarosa o post-corrida
40
SYBR
no intercalante
41
Marcadores de peso molecular
mezcla de moléculas de diferente peso molecular que sirve como referencia para el análisis cuallitativo
42
En un análisis cualitativo..
NO se puede conocer el # exacto de pb en las bandas
43
Análisis de retraso en gel permite...
detectar interacciones entre la secuencia esécífica de AN
44
Mayor resolución empleando un voltaje menor...
mayor tiempo de corrida y % mayor de agarosa
45
A las cadenas más cortas ...
les toma menos tiempo reorientarse y exhiben mayor movilidad
46
El ángulo de reorientación entre E1 y E2 es...
mayor de 100°
47
Campos eléctricos no homogéneos
va incrementando PFGE: 110°-150° OFAGE: 120°-150° TAFE: 115°-165°
48
Campos eléctricos homogénemos
permanece constante FIGE: 180° CHEF: 120° RGE: 120°
49
Electroforesis capilar
permite resultados en corto tiempo mínimo consumo de muestra muy alta resolución empleada en la secuenciación automatizada
50
Los grupos silanol en el interior...
se ionizan
51
El DNA del gen discontinuo...
posee intrones
52
El cDNA se corresponde...
al mRNA, el cual carece de intrones