Wissensfragen Flashcards
(18 cards)
DNA X hat höheren GC Anteil als DNA Y, jedoch niedrigeren Schmelzpunkt. Wie?
Stabilität DNA: nicht nur Anzahl Wasserstoffbrückenbindungen ist wichtig, sondern auch
Anzahl Basenstapelwirkungen (Länge des Molekül)
Basenstapelwirkung : Van-Der-Waals-Kräfte
> DNA X nicht zwangsweise stabiler nur weil GC höher, wenn DNA Y länger => durch Basenstw. stabilisiert
Mit welcher DNA hybridisiert die folgende DNA (TAAGCG) entsprechend der Wason-Crick
Basenpaarung und wieviele Wasserstoffbrückenbindungen werden dabei gebildet? Geben Sie das
Oligonukleotid entsprechend der konventionellen Schreibweise an.
Anzahl energiereicher Bindungen in Nukleotid GTP?
2 energiereiche Phosphorsäureanhydridbindungen
Anzahl energiereicher Bindungen in Nukleotid ADP?
ADP = Adenosindiphosphat besitzt eine energiereiche Phosphorsäurehydridbindung
Konfiguration D-Ribofuranose in RNA
beta-D-Ribofuranose in C3-endo-Konformation
Schmelzpunkt von DNA definieren, welche Parameter sind wichtig?
= Temperatur, bei der Bindungskräfte zwischen beiden Einzelsträngen überwunden werden und diese sich voneinander trennen => Denaturierung
Parameter: länge, GC-gehalt
Schmelzen der DNA
Die Wasserstoffbrückenbindungen brechen auf mit steigender Temperatur, sodass man Einzelstränge vorliegen hat ≙ Denaturierung der DNA
Peptidbindungen / SDS
Wie viele Peptidbindungen hat ein Hexapeptid?
6 Peptide, die durch 5 Peptidbindungen miteinander verbunden sind
Wieviel Peptidbindungen weist ein Pentapeptid auf?
4 Peptidbindungen (wenn zyklisch: 5)
Warum sind Peptidbindungen nicht frei drehbar (Erklärung anhand Strukturformel)?
mesomeriestabilisierte Peptidbindung => nicht frei drehbar, da partieller Doppelbindungscharakter (BILD)
Zeichnen Sie eine Peptidbindung. (Peptidbindung hat Doppelbindungscharakter)
(BILD)
Worin liegt der wichtigste Unterschied zwischen einer Peptidbindung und einer gewöhnlichen Amidbindung?
eine Peptidbindung = spezielle Form der Amidbindung
von Peptidbindung spricht man nur, wenn es Aminosäuren sind, die miteinander verknüpft sind
von Amidbindung spricht man, wenn durch Reaktion ein beliebiges Säureamid entsteht
Definition der Primärstruktur von Peptiden
Primärstruktur gibt die Aminosäuresequenz, also Art, Anzahl und Reihenfolge der einzelnen Aminosäuren wieder. Die Verknüpfung der Aminosäuren erfolgt kovalent durch die Peptidbindung
Welche Art von kovalenten Bindung ist typischerweise an der Ausbildung von Tertiär- und Quartärstrukturen beteiligt. (Skizze)
WBBs, kovalente Bindungen, Disulfidbrücken (zwischen zwei Cysteinen), hydrophobe Interaktion, Van-der-Waals-Kräfte
Ein Tetrapeptid hat einen pI von 7,0. Wie kann es mittels Gelektrophorese von DNA abgetrennt werden, unabhängig von Porengröße etc des Gels? Geben Sie Puffer, Versuchsanordnung, Laufrichtung beider Biomoleküle an.
pH < pI –> neg. Ladung läuft zur Anode; DNA aus Zucker-Phosphat-Rückgrat negativ
pH > pI -> pos. Ladung läuft zur Kathode; Tetrapeptid positiv
Umgekehrt kleiner pH heißt alles protoniert. Für Trennung am besten
Was ist SDS-Page?
-
Wohin wandern Proteine bei SDS-PAGE und warum spielt der pl keine Rolle?
wandern zum Plus-Pol
Weil durch sds
pI keine Rolle, da Proteine in der SDS Page immer negativ vorliegen
