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BIO CELLULAIRE > trafic membranaire intracellulaire > Flashcards

trafic membranaire intracellulaire Flashcards

1
Q

2 voies principales de trafic membranaire intracellulaire

A
  • endosomale (dégradation)

- biosynthèse (sécrétion)

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2
Q

quelle structure permet le transport des vésicules à longue distance

A

microtubules/cytosquelette

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3
Q

rôle des vésicules

A

cargo, intermédiaire de transport, entre les différents compartiments.
steps de bourgeonnement du compartiment donneur, fusion de la vésicule sur le compartiment cible receveur

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4
Q

formation de vésicules à la membrane plasmique

A

endocytose => internalisation

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5
Q

fusion de vésicule à la membrane plasmique

A

exocytose => externalisation

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6
Q

vrai ou faux, au contraire de la bicouche lipidique de la membrane plasmique, l’endomembrane d’une vésicule est symétrique

A

faux, asymétrique

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7
Q

quel feuillet de l’endomembrane d’une vésicule devient le feuillet externe de la membrane plasmique

a) feuillet côté de la lumière (intérieur) de la vésicule
b) feuillet externe de la vésicule

A

a) feuillet côté de la lumière (intérieur) de la vésicule

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8
Q

mécanisme d’internalisation de larges particules spécifiques à la membrane plasmique

A

phagocytose

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9
Q

mécanisme d’internalisation de liquide non-spécifique à la membrane plasmique

A

macropinocytose

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10
Q

mécanisme d’internalisation de liquide non-spécifique à la membrane plasmique à travers de petites vésicules

A

micropinocytose

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11
Q

endocytose comprend nécessairement la formation de quelle structure

A

vésicule

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12
Q

vrai ou faux, la micropinocytose est un type d’endocytose indépendant de la clathrine et de la cavéoline

A

vrai

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13
Q

mécanisme d’internalisation de particules moyennes et spécifiques à la membrane plasmique

A

dépendant à la clathrine

dépendant à la cavéoline

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14
Q

quels énoncés sont vrais

a) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un lysosome
b) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un endosome précoce
c) la molécule entrée par macropinocytose ou micropinocytose sera ensuite dégradée par un lysosome
d) la molécule entrée par mécanisme dépendant de la cavéoline ou clathrine sera ensuite dégradée par un endosome précoce

A

d) la molécule entrée par mécanisme dépendant de la cavéoline ou clathrine sera ensuite dégradée par un endosome précoce
a) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un lysosome

macro/micropinocytose = endosome précoce

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15
Q

les pseudopodes utilisés pour phagocytose dépendent de quoi pour leur permettre une mobilité

A

actine

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16
Q

qu’arrive-t-il si la phosphatidylsérine (PS) est exposée à la surface de la membrane plasmique (feuillet externe)?

A

corps apoptotique comme le macrophage vont reconnaître comme un signal d’apoptose et leur récepteur PS va lier la PS pour ammorcer la phagogytose

(PS sur feuillet interne = normal = pas de signal d’apoptose = survie)

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17
Q

différence entre phagocytose et pinocytose

A

pinocytose = pas de particules solides => gouttelettes fluide & Nu

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18
Q

point commun du mode d’action phagocytose et pinocytose

A

dépendants de l’actine

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19
Q

étapes de formation d’une vésicule de clathrine

A
  1. liaison ligand / récepteur de chargement = signal pour recrutement clathrine et déformation de la membrane plasmique
  2. adaptine lie récepteur et clathrine (se trouve entre les deux)
  3. polymérisation des clathrines qui forment un manteau à la surface membranaire, formation d’une vésicule qui garde un cou attaché à la membrane plasmique
  4. dynamine s’accroche et scinde le cou des vésicules (free the vésicules!!) par hydrolyse de GTP
  5. bourgeonnement complet = détachement = vésicule perd son manteau de clathrines
  6. vésicule nue ready à se fusionner avec un compartiment cible
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20
Q

forme précurseur de la clathrine dans le cytosol (clathrine qui n’est pas encore polymérisée)

A

triskèle

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21
Q

forme de la clathrine à la membrane qui permet de former la vésicule

A

polymérisation en forme polyédrale

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22
Q

protéine qui permet la scission de la vésicule de clathrine

A

dynamine

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23
Q

protéine qui facilite la formation de la vésicule mantelée de clathrine (sa polymérisation)

A

actine

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24
Q

comment agit la dynamine sur la vésicule mantelée de clathrines

A

forme des oligomères en hélices autour du cou

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25
Q

quelle vésicule est plus petite: dépendante de la cavéoline ou de la clathrine

A

cavéoline

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26
Q

endosome

A

vésicule avec membrane unique qui vient de la membrane plasmique après l’endocytose

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27
Q

différence entre un endosome précoce et un endosome tardif

A

tardif = + acide = + mature

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28
Q

qu’est-ce qui transporte le cholestérol

A

LDL => lipiprotéines de basse densité (voir slide 30 pour réviser le process complet )

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29
Q

vrai ou faux, les endosomes ont un pH plus bas (plu acide) que les lysosomes

A

faux, contraire => ce qui permet l’activation des enzymes hydrolases

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30
Q

d’où proviennent les exosomes

A

système endosomale

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31
Q

les corps multivésiculaires proviennent de quoi

A

endosome tardif => permettent aux exosomes d’être libérés quand corps multivésiculaires (MVB) se fusionnent à la membrane plasmique

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32
Q

c’est quoi un corps multivésiculaire (MVB)

A

endosome tardif dans lequel il y a des exosomes en bourgeonnement => des petites vésicules dans une plus grande vésicule

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33
Q

c’est quoi l’autophagie

A

protéine ou organites capturés dans autophagosome et dégrader après la fusion avec un lysosome

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34
Q

double membrane lipidique impliquée dans l’autophagie

A

autophagosome

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35
Q

quel élément est faux concernant les peroxysomes

a) présent dans toutes les cellules eucaryotes
b) ressemblent au lysosome, font parti du système endolysosomal
c) sphérique
d) 1 membrane
e) rôle dans métabolisme et détoxification

A

b) ressemblent au lysosome, font parti du système endolysosomal
FAUX, RESSEMBLENT PAS PAS DAND LE SYSTÈME ENDOLYSOSOMAL)

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36
Q

implication des peroxysomes dans le métabolisme

A

oxide les acides gras

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37
Q

implication des peroxysomes dans la détoxification

A

produit/dégrade le H2O2

métabolise les ROS aka esoèces réactives d’oxygène

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38
Q

quel énoncé est faux concernant les peroxysomes

a) possèdent plus de 50 enzymes
b) synthèse les acides biliaires
c) synthèse de lipides
d) catalase la plus rare pour les espèces réactives d’oxygène
e) la plupart des peroxysomes se forment de “novo” par bourgeonnement

A

d) catalase la plus rare pour les espèces réactives d’oxygène
faux, la plus abondante!

e) la plupart des peroxysomes se forment de “novo” par bourgeonnement
FAUX, par fission et croissance comme mitochondries

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39
Q

quel choix de “destiné” s’offre aux protéine endocytées

A
  1. recyclées à la membrane plasmique
  2. dégradées par lysosomes
    toutes ces options suivent le tri fait dans l’endosome précoce/ endosome de triage
40
Q

quelles structures permettent à la vésicule de bind avec la membrane cible

A 
v-Snare = petites cordes sur vésicule
t-Snare = petites cordes sur membrane du compartiment cible

v-Snare + t-Snare = fusion vésicule/membrane

=> les 2 se lient et s’unissent pour permettre la coalescence des membranes et la fusion entre vésicule et l’autre membrane cible

41
Q

qu’est-ce qui permet aux SNAREs de se désassembler pour recycler les composantes

A

hydrolye d’ATP par une ATPase

42
Q

vrai ou faux, un SNARE est spécifique à un compartiment, il en existe donc plusieurs pour différents compartiments

A

vrai, ils étiquettent et trient des compartiments en particulier

43
Q

type de GTP attaché aux vésicules pour permettre à la vésicule de s’attacher et de s’appareiller à la membrane cible

A

Rab-GTP (vient de la superfamille des Ras)

44
Q

quel intermédiaire permet à la vésicule de s’attacher à la membrane via l’activité de Rab-GTP

A

Effecteur de Rab, une protéine d’attachement

45
Q

phospholipide mineur présent sur le feuillet interne de la membrane plasmique qui est très important pour la spécificité de la membrane

A

PI: phosphadidylinositol

46
Q

PI phosphorylés donnent quoi

A

phosphoinositides

47
Q

quel élément est faux concernant la phosphorylation des PI

a) résultat = phosphoinositides
b) c’est l’anneau qui est phosphorylé
c) phosphorylation/déphosphorylation par des kinases et phosphatases
d) phosphorylation possible sur les positions 2,3 et 4 d l’anneau

A

d) phosphorylation possible sur les positions 2,3 et 4 d l’anneau
FAUX, 3,4,5 POSSIBLE

48
Q

je retire un groupement phosphate aux phosphoinositides

A

phosphatase

49
Q

j’ajoute un groupement phosphate aux phosphoinositides

A

kinase

50
Q

comment les cellules peuvent distinguer les différents compartiments?

A

via les phosphoinositides différents sur chaque membrane

51
Q

structures impliquées dans la voie endosomal => internalisation par dégradation

A

endosome précoce, endosome tardif, lysosome

52
Q

structures impliquées dans la voie de sécrétion

A

réticulum endoplasmique
appareil de Golgi
vésicule de transport

53
Q

la voie de sécrétion implique le passage de quoi vers quoi

A

protéines synthétisées par le RER vers la membrane/ exportation par sécrétion/lysosomes

54
Q

quelle structure a une lumière en continuité avec l’enveloppe nucléaire

A

réticulum endoplasmique; réseau de citernes/sacs membranaires autour du noyau

55
Q

qui est responsable de fabriquer les membranes de la cellule

A

réticulum endoplasmique

56
Q

quels énoncés sont faux à propos du REL (lisse)

a) possède des ribosomes
b) réseau tubulaire
c) synthétise des lipides et du calcium
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène

A

a) possède des ribosomes
FAUX, RER

c) synthétise des lipides et du calcium
FAUX, SYNTHÉTISE DES LIPIDES MAIS C’EST UNE RÉSERVE DE CALCIUM DANS LES MUSCLES, ÇA NE LE PRODUIT PAS

d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
FAUX

57
Q

quels énoncés sont faux à propos du RER (rugueux)

a) possède des ribosomes
b) réseau tubulaire
c) réservoir de calcium pour les muscles
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
e) synthétise des protéines
f) contrôle de la qualité
g) s’occupe de faire la glycosylation des protéines

A

b) réseau tubulaire
FAUX, LISSE = TUBES MAIS RUGUEUX = CITERNES

c) réservoir de calcium pour les muscles
FAUX, RÔLE DU REL

d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
FAUX, PAR PONTS DISULFURE (STRONG BOND)

58
Q

vrai ou faux, le RER et le REL sont deux structures indépendantes qui se sont pas reliées

A

faux, en continuité l’une avec l’autre

59
Q

composition des ribosomes

A

ARNr + protéines avec 2 sous-unités (50S et 30S)

60
Q

rôle ribosome

A

traduction de protéines (gènes => prot)

61
Q

étapes générales synthèse protéique par ribosomes

A
  1. ribosome lie chaque codon de 3 nucléotides de 5’@3’

2. acides aminés formés sont transférés à la chaîne polypeptide par ARNt (transfert) jusqu’au codon stop

62
Q

vrai ou faux, un ribosome traduit TOUJOURS un ARNm tout seul

A

faux, polysomes possibles => plusieurs ribosomes sur le même ARNm simultanément (muuuushpit)

63
Q

qu’ont de particulier les protéines transmembranaires ou destinées à être sécrétées hors de la cellule

A

séquence signal peptide au N-term => permet d’orienter le ribosome vers le RE

comme une étiquette

64
Q

les protéines nucléaires sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

a) libres dans le cytosol

65
Q

les protéines mitochondriales sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

a) libres dans le cytosol

66
Q

les protéines cytosoliques sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

a) libres dans le cytosol

67
Q

les protéines transmembranaires sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

68
Q

les protéines qui fonctionnent dans le système endomembranaire sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

69
Q

les protéines destinées à être sécrétées hors de la cellule sont:

a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

A

b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes

70
Q

vrai ou faux, la translocation d’une protéine se fait en une étape séparée et ultérieure à la fin de la traduction de la protéine en question

A

faux, simultané, translocation co-traductionnelle (les 2 process se font en même temps)

71
Q

complexe protéique qui allonge une protéine en formation dans la citerne du RER

A

translocon

72
Q

où est modifiée la protéine au cours de sa formation

A

dans la lumière du RER

73
Q

après l’allongement de la protéine en formation dans la lumière du RER par un translocon, la séquence signal sur la protéine destinées à être sécrétée ou à être transmembranaire est clivée par quoi

A

peptidase

74
Q

comment une protéine transmembranaire s’insère-t-elle dans la bicouche lipidique

A

par le translocon, un canal de translocation

75
Q

importance du glycocalyx sur les protéines transmembranaires et lipides sur le feuillet externe de la membrane

A

protection chimiques (intestin) et reconnaissance cellulaire (immunité)

76
Q

les protéines transmembranaires sont glycolysées à partir d’où

A

lumière RE à partir de glucose, mannose et N-acétylglucosamine

77
Q

2 classes de glycoprotéines dans le RE et l’Appareil de Golgi

A

N-glycosylation

O-glycosylation

78
Q

quel élément est faux concernant la N-glycosylation

a) oses = glucose
b) liés aux N de la sérine (Thr)
c) dans le RE
d) ajout de glycane (14 sucres) dans la lumière du RER

A

b) liés aux N de la sérine (Thr)

FAUX, LIÉS AUX N DE L’ASPARAGINE (ASN)

79
Q

quel élément est faux concernant la O-glycosylation

a) oses = glucose
b) liés aux O de la sérine (Thr)
c) dans l’appareil de Golgi

A

a) oses = glucose

FAUX, OSES - GALACTOSE

80
Q

quelle structure permet de contrôler la qualité du repliement protéique dans la lumière du RE

A

chaperon calnexine sur la membrane du RE (vers l’intérieur, la lumière) => les retient, les kidnappe, ne peuvent pas se diriger vers l’appareil de Golgi

81
Q

que se passe-t-il quand il y a trop de protéines mal repliées dans le RE

A

produit plus de chaperonnes calnexine, on veut la même qualité

82
Q

à quoi sert l’endoribonucléase IRE1

A
  1. contrôle épissage de XBP1 (facteur de transcription qui augmente la capacité d’une cellule à faire de la synthèse)
  2. dégrade des ARNm pour qu’ils produisent moins de protéines (- traduction)
    RÉPONSE AUX PROTÉINES MAL REPLIÉES
83
Q

c’est quoi la destinée d’une protéine mal repliée

A

capturées par les chaperonnes calnexines => rétro-transloquées par le translocon => ubiquitinées par une ligase => dégradées par protéasome

84
Q

le RER est important pour quel type de structure des protéines?

A

secondaire

85
Q

on dit que le RE contrôle sa taille via quel processus?

A

UPR; Unfolded Protein Response

86
Q

l’entrée de l’appareil de Golgi est vis-à-vis (RER/ membrane plasmique) alors que sa sortie est vis-à-vis (RER/ membrane plasmique)

A 
entrée = RER
sortie = membrane plasmique
87
Q

3 citernes de l’appareil de Golgi

A

Cis
Médianes
Trans

88
Q

qu’est-ce qui permet la rétention au RE via le transport antérograde et où se fait-il

A

COPII, dans le compartiment intermédiaire RE-Golgien [ERGIC]

89
Q

qu’est-ce qui permet le transport de récupération

A

COPI dans le réseau cis-Golgien

90
Q

rôles appareil de Golgi

A
  • finition/maturation des protéines en finissant leur glycosylation (les active et stabilise)
  • étiquetage des protéines pour savoir où elles vont se diriger (destination finale)
  • triage / concentration / emballage protéines dans vésicules/ granules de sécrétion
91
Q

qu’est-ce qui permet le transport des vésicules ou granules de sécrétion de l’appareil de Golgi vers la destination des protéines

A

microtubules sur lesquels avancent la kinésine ou la dynéine

92
Q

la partie triage se fait dans quelle région de l’appareil de Golgi

A

à la sortie, réseau trans-Golgien (TGN), de là on décide si la protéine va au lysosome, à la membrane plamique ou dans un vésicule de sécrétion

93
Q

la glycolysation des protéines dans le réticulum endoplasmique fait intervenir majoritairement du mannose ou des oligossacharides complexes?

A

enrichi au mannose dans le RE et oligosaccharides complexes dans l’appareil de Golgi

94
Q

quels éléments correspondent à une sécrétion constitutive

a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
b) fait par toutes les cellules
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes

A

b) fait par toutes les cellules
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase

95
Q

quels éléments correspondent à une sécrétion régulée

a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
b) fait par toutes les cellules
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes

A

a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes

96
Q

bouton synaptique = sécrétion régulée ou constitutive

A

régulée

97
Q

trasnport endosomale dans les cellules polarisés possible par quelle méthode

A

transcytose; ENDOCYTOSE MEMBRANE APICALE SUIVI DE TRANSPORT + FUSION AVE MEMBRANE BASOLATÉRALE

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