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BIO CELLULAIRE > Junk RNA > Flashcards

Junk RNA Flashcards

1
Q

V ou F

ARN non-codant porte sa fonction lui-même sans passer par la traduction d’une protéien qui accomplira la fonction

A

V

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Q

V ou F

seulement 2% du gènome humain est transcrit

A

F
70%
(mais juste 30k ARN / 180k codent pour protéines donc 150k = long non-coding RNA lncRNA)

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3
Q

que régulent les ARN non-codants (ncRNA)

A
  • transcription et post-transcription, épissage pré-ARNm

- formation hétérochromatine (méthylation, modif histone et gene silencing)

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4
Q

nb de nucléotides qui détermine si le non-coding RNA est long or short

A

200 nucléotides

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5
Q

miRNA et siRNA sont-ils

a) lncRNA
b) sncRNA

A

b) sncRNA ( - de 200 nucléotides)

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6
Q

nb de nucléotides dans un miRNA

A

22

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7
Q

V ou F

on trouve des miRNA dans les bactéries

A

F

animaux, plantes et certains virus

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8
Q

quand les miRNA fonctionnent-ils (quelle phase régulent-ils)

A

post-transcription (ADN => ARN)

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9
Q

V ou F

les miRNA fonctionnent par l’appariement de bases avec les séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNt

A

F

au sein de molécules d’ARNm

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10
Q

comment le miRNA ( qui sont des small interference RNA) affectent-t-ils l’expression des gènes en protéines

A

réduction de l’ARNm disponible donc moins de protéines et moins de fonctions accomplient => silencing des gènes

  1. clivage ARNm en 2
  2. raccourcissement queue poly-A ARNm (destabilisé)
    • efficacité de traduction
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11
Q

on trouve 40% des gènes de miRNA dans quoi

A

introns ou exons d’autres gènes

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12
Q

rôle des ARN interference

A

défense contre séquences nucléotidiques parasites, virus et transposons en empêchant l’expression/traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm

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13
Q

majorité des gènes des miRNA sont transcrit par quoi

A

ARN polymérase II

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14
Q

transcrit primaire des miRNA qui en contient plusieurs et a subit un processus de coiffe, de polyadenylation et d’épissage

A

pri-miRNA

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15
Q

quels miRNA sont transcrit par ARN polymérase III

A

ceux portant des séquences Alu en amont des ARNt

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16
Q

étapes pour passer de pri-miRNA à pré-miRNA

A
  1. Pasha (invertébrés) /DGCR8 (vertébrés) reconnait la double hélice tige-boucle (hairpin) de la pri-miARN
  2. Drosha (prot) s’associe à Pasha
  3. Pasha + Drosha = complexe enzyme microprocesseur
  4. Drosha chop la base tige-boucle (hairpin) de pri-miRNA
  5. clivage libère les pré-miRNA compris à l’intérieur
  6. résultat = pré-miRNA avec 2 nucléotides libres à 3’
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17
Q

combien de précurseurs contiennent les pri-miRNA

A

1-6

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18
Q

V ou F

les pré-miRNA ont tous une structure en tige-boucle (hairpin) de 70-80 nucléotides

A

V

19
Q

comment peut-on former un pré-miRNA sans complexe de microprocesseurs

A

à partir d’introns:

Debranching enzyme clive le branching point des introns du gène hôte

20
Q

comment appelle-t-on les pré-miRNA qui n’impliquent pas de complexe de microprocesseurs

A

mirtrons, épissés directement à partir d’introns

21
Q

quels groupements se trouvent aux extrémités 3’ et 5’ des pré-miRNA

A 
3' = OH 
5' = phosphate
22
Q

comment se fait l’export des pré-miRNA vers le cytoplasme

A

exportine-5 reconnaissent nucléotides non-appariés à 3’

*transport grâce à l’énergie de Ran-GTP

23
Q

quelle enzyme ribonucléase est responsable de la maturation du pré-miRNA dans le cytoplasme? comment procède-t-elle?

A

Dicer

Coupe la tête/boucle qui relie les bras de la tige boucle (hairpin)

24
Q

qu’est-ce qui résulte du clivage de la boucle de l’épingle à cheveux pré-miRNA par Dicer

A

Duplex mi-RNA/mi-RNA*
2 brins;
brin guide => qui fera parti du complexe de gene silencing, le RISC aka micro-RNP
*brin passager => qui va être éliminé

25
Q

vrai ou faux

un ou l’autre des brins formés par Dicer (passager et guide) peut être fonctionnel comme mi-RNA

A

V

26
Q

synonyme du RISC (RNA-Induced Silencing Complex)

A

mi-RNA ribonucléoprotéine => mi-RNP

27
Q

composantes catalytiques du RISC à l’origine du silencing

A

protéines Argonautes (Ago)
=> lient les mi-RNA matures qui viennent de passer par Dicer pour les mener à interagir avec un ARNm qu’ils silenceront

Argonautes + autres protéines = répression traduction

28
Q

on parle de quoi quand on parle de Slicing

A

quand mi-RNA est parfaitement apparié avec ARNm => ARNm est clivé et dégradé

29
Q

quel type d’argonaute a le pouvoir de cliver directement les ARNm cibles

A

Ago2

30
Q

comment le mi-RNA réussit à induire le silencing de l’ARNm si son appariement avec elle est imparfait; “pas extensif”

A

utilisation de P-bodies:

On capture les ARNm dans des Processing bodies dans lesquelles on trouve des enzymes de dégradation, les Dcp1 (decaping enzymes)

31
Q

comment les miARN empêche l’ARNm d’être traduit autre que par p-bodies et par splicing

A
  1. bloque l’inititaion de la transcription
  2. accélère la dé-adénylation => dégradation ARNm
  3. modifie histone + méthylation de l’ADN des sites promoteurs: formation hétrochromatine: expression des gènes moins possible
32
Q

v ou f

tous les mi-RNA sont intracellulaire

A

F
majorité oui mais il en existe de l’extracellulaire (miRNA circulants ou extracellulaires)
=> dans fluides biologiques

33
Q

V ou F
les miRNA dérivent des régions longues d’ARN double brins (dsRNA) tandis que les siRNA dérivent des régions de transcrits qui se replient sur eux-même pour former de courte épingles à cheveux

A

F
contraire
siRNA = viennent de longues régions d’ARN double brins

34
Q

de quel type de junk-RNA parle-t-on:

  • exprimée plus faiblement que les gènes codants pour les protéines
  • expression spécifique au tissu
  • enrichis dans le noyau
  • faible conservation de séquence en majorité
  • processus de transcription/maturation similaire à celui de l’ARNm codant pour des protéines
  • ne code pas pour protéine
A

long non-coding RNA (lncRNA)

35
Q

V ou F

les lncRNA ne sont traduits mais pas en protéines

A 
F
pas traduits (mais transcrit et maturés)
36
Q

quel type de lncRNA trouve-t-on dans une zone non annoté du génome et qui sont transcrits dans le même sens que le gène codant près de lui

A

intergénique

37
Q

comment s’organise la transcription et le positionnement d’un lncRNA antisens

A

transcription dans le sens opposé du gène codant

séquence chevauche partiellement ou totalement le gène codant

38
Q

différence entre un lncRNA antisens et divergents

A

divergent = transcrit dans le sens opposé du sens du promoteur du gène codant mais ne chevauche pas les gènes codants au contraire d’antisens

39
Q

quel type de lncRNA trouve-t-on dans l’intron d’un gène codant

A

intronique

40
Q

types de lncRNA dépendemment de leur position relative aux gènes codants qui sont à proximité

A
  • antisens
  • divergent
  • intergénique
  • intronique
41
Q

on dit que les lncRNA ont une action en trans lorsqu’ils agissent sur des gènes de façon (locale ou indépendante de la distance)

A

indépendante de la distance => distale

contrôlent les gènes cibles peu importe où ils se situent

42
Q

comment appelle-t-on l’action des lncRNA sur des gènes codants voisins

A

en cis, locale

43
Q

c’est quoi la fonction éponge des lncRNA

A

compétition avec miRNA pour protéger les ARNm de leur dégradation

44
Q

rôles des lncRNA

A
  1. dirigent les modificateurs de chromatines vers gènes spécifiques
  2. empêche action des miRNA (protège ARNm)
  3. déplacent les activateurs/répresseurs de l’expression
  4. modulent épissage, bloque la traduction et dégrade l’ARNm
  5. promeuvent initiation transcription par l’asso de séquences amplificatrices et promotrices

BIO CELLULAIRE (21 decks)

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