Partie C Flashcards

1
Q

dans le concept d’opéron, le répresseur peut se lier à deux endroits pour faire son action

A

sur le gène de l’opérateur
ou sur l’ARNm au niveau de la section codante pour l’operateur

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2
Q

croissance de bactérie en présence de glucose et de lactose

A

au début beaucoup de division de bact parce quon utilise rapidement le glucose. Ensuite quand pu de glucose on doit prendre la beta-galactosidase pour transformer le lactose en galactose et glucose qui sera utiliser par la bact. Cependant on a une periode ou on a pas de croissance de bact parceque ca prend un temps pour activer l’opéron lacz qui va former l’enzyme beta galactosidase

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3
Q

à quoi ressemble l’opéron lac/ quels sont les acteurs

A
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4
Q

promoteur, répresseur et opérateur sont des elements en cis ou en trans

A

P et O en cis parceque font parti de la molécule d’ADN

répresseur en trans parceque agit sur une partie de l’ADN

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5
Q

comment fonctionne l’opéron lac

A

sans presence d’inducteurs, répresseur se lie à l’opérateur empêchant la transcription de l’opéron lac

si présence d’inducteurs (ex: allolactose ou isopropylthiogalactoside (IPTG)) ils agissent comme un ligand pour la prot represseur qui ne peut plus aller se lier sur l’opérateur et donc ne bloque pu la transcription des gènes de l’opéron lac qui permet de transformer le lactose en galactose et glucose (métabolisable par la bactérie)

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6
Q

donne deux exemple de mutation qui affecte la regulation de l’opéron lac

A

mutation du gène represseur (mutation dominante) : represseur non formé donc on transcrit toujours l’opéron

mutation de l’opérateur : répresseur ne peut pas venir se lier donc on transcrit toujours les gènes de l’opéron

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7
Q

qu’est ce qui se passe avec l’opéron lac quand
1.pas de lactose mais beaucoup de glucose
2.beaucoup de lactose et de glucose
3.beaucoup de lactose et peu de glucose

A
  1. pas de lactose donc pas d’inducteur qui s’accroche sur le represseur. L’opéron n’est pas transcrit
  2. lorsque beaucoup de glucose présent, on a peu d’AMPc parceque inhibe Adénylyl cyclase. Peu de recrutement de la polymérase donc peu de transcription de l’opéron mais on en a un peut parceque notre represseur est pas lié à l’opérateur
  3. peu de glucose= bcp d’AMPc. AMPc se lie à CAP qui va se lier au promoteur et augmente le recrutement de la pol donc on va avoir beaucoup de transcritption de l’opéron lac (en plus notre represseur est pas lié parce quon a du lactose)
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8
Q

le glucose inhibe quelle enzyme

A

adenylyl cyclase qui produit AMpc

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9
Q

le site de liaison de CAP-Ampc se situe ou

A

sur une partie du promoteur

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10
Q

décrit la liaison du represseur avec l’ADN

A

c’est un tetramère

donc chaque monomère lie l’ADN via un domaine HTH (hélice coude hélice), courbe d’ADN d’environ 60 degré

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11
Q

Décrit la liaison de CAP-Camp avec l’ADN

A

c’est un dimère de protéine

lie les motifs sur 2 tours successifs du sillon majeur de l’ADN via domaine HTH, courbure d’ADN environ 90 degrée

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12
Q

exemple d’interactions non spécifiques ADN prot

A

résidus basiques chargés positivement (LYs, Arg, His) interagissent avec le squelette phosphate-sucre acidique chargé négativement (ex: histones hautement basiques organise l’ADN en chromatine via liaisons non-spécifiques )

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13
Q

interactions séquence spécifiques

A

protéines rconnaissent les séquences spécifiques des bases azotées au niveau du sillon majeur (ex: répresseur lac et protéine CAP)

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14
Q

explique lessai de retard de mobilité sur gel

A

le fragment O1 est plus spécifique au represseur que le fragment O3

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15
Q

explique la regulation de l’operon arabinose

A

Ara C en présence d’arabinose en grande concentration est un dimère qui se lie aux site d’initiation de la transcription et qui active la transcription des gènes araBAD

Ara C avec arabinose en faible concentration va faire une boucle dans l’ADN qui empêche la transcription de AraBAD

quand ARAc est abscente, AraC est transcrit et AraBAD est transcrit a son niveau de base

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16
Q

explique la régulation de l’opéron trp

A

une augmentation de TRP empêche la transcription des enzymes formant le tryptophane (grace a l’atténuateur)

l’aporepresseur est formé, mis en dimère et sa liaison avec le TRP fait quil peut se lier au niveau de l’opérateur pour empêcher la transcription

Une diminution de TRP active la transcription des enzymes formant le tryptophane

l’aporespresseur est formé, mis en dimère mais ne peut s’accrocher à l’opérateur donc la transcription contiue d’avoir lieue

17
Q

comment l’atténuateur qui se trouve sur l’adn codant pour le gène tprL fait pour arreter ou continuer la transcription des enzymes du tryptophane

A

bcp de TrP: favorise la formation de boucle 3-4 dans l’arnm du TRPL: bloque la traduction par les ribosomes

peu de trp: favorise la formation de boucle 2-3 dans l’arnm du TRPL: favorise la traduction par les ribosomes

18
Q

la structue secondaire de l’ARNm dans la région TRPL controle la transcription du locus. en quoi l’ARNm de TRPL est traduite

A

14 a.a contenant deux codons TRp consécutifs (position 10-11)

19
Q

quels autres opérons sont connus pour influencer a prod d’a.a

A

opéron His (histidine) et ilv (isoleucine, leucine et valine)

20
Q

place les opérons Lac, Ara et TRP dans la bonne catégorie

-inactivation d’un répresseur constitutif

-Activation d’un activateur

-Activaiton d’un répresseur

-Inactivation d’un activateur constitutif

A

Lac: inactivation d’un répresseur constitutif

Ara: inactive un répresseur

TRP: activation d’un répresseur (en présence de TRP, on active notre répresseur)