Cours 5 Flashcards
si le code génétique n’était pas dégénéré, combien d’a.a différents pourraient etre codés par les triplet de codon de l’ADN
pourquoi on dit que le code génétique est dégénré
sachant que 61 codons codent pour des a.a, pourquoi ce n’est pas le meme nombre que dans l’équation 1
si ce netait pas des triplet mais plutot des doublets qui codaient pour un a.a, combien d’a.a différent
3 lettres (triplet): 4x4x4= 64 a.a
parce que seulement 20 a.a et non 64, ce qui veut dire que pls codon vont coder pour le meme a.a
parceque 64 inclu les codons stop (UAA, UAG, UGA) qui ne donnent pas d’a.a
2 lettres (doublet) : 4x4 =16 a.a
c’est quoi le codon d’initiation et ca code pour quel acide aminé
AUG: methionine
comment marshall Nirenberg et Heinrich Matthaei craquent le code génétique
les 20 a.a radioactifs chacun dans un tube différent
ajoute extrait bactérien d’e.coli sans ADN nin ARNm avec enzymes et ribosomes
ajout d’arn m synthétique avec un seul type de nucléotide (ply U, poly A poly C…)
ils vont obtenir les polymères des a.a correspondant
CAU AUC AUG GAU CGU AAG UAA
combien d’a.a se retrouvent dans cette sequence
la proteine encodée par cette sequence contient combien d’a.a
6
4
pour determiner l’acide aminé qui sera ajouté, on regarde le codon (ARNm ) ou l’anticodon (ARNt)
codon
lors de l’élongation de la chaine d’acide aminé, c’est la chaine d’acide aminé qui est transféré sur le nouveau a.a ajouté ou l’inverse
c’est la chaine qui est transféré sur le nouveau A.a
vrai ou faux
il peut y avoir plusieurs ARNt pour un seul acide aminé
Vrai et faux
vrai: puisque un a.a peut etre codé par plusieurs codons différent et que l’aRNt contient un seul anticodon, cela veut dire que plusieurs ARNt différents vont porter le meme acide aminé
faux: un seul acide aminé est transporté par ARNt
les arnt tenant le meme acide aminé mais n’ayant pas la meme séquence anticodon sont appelés
ARNt isoaccepteurses
iso= meme parceque un meme acide aminé peut etre sur pls ARNt diff
quelle enzyme est responsable du décodage de l’info
aminoacyl aRNt synthétase puisqu’elle permet d’attacher l’acide aminé à l’extrémité CCA de son ARNt par esterification
sur quel site du ribosome se lie l’ARNt contenant l’anticodon de départ et sur quel site se lie les autres ARNt contenant les codons suivants
lorsque la liaison covalente entre les deux a.a est fait, qu’est ce qui se passe
dans le site P (à gauche)
dans le site A (à droite)
l’aRnt qui amenait la methionine part du site P, le ribosome avance de 3 nucléo ce qui transfert l’aRNt tenant le polypeptide du site A vers le site P
le site A acceuille un nouvel ARNt avec un acide aminé et le cycle recommence de la meme facon jusqu’au codon stop
qui découvre la séquence d’un ARNt pour la première fois
qu’est ce qu’on remarque au niveau de la séquence
Robert Holley
15 nucléo invariables (toujours présents à la meme position) et 8 semi-variables (toujours purine ou toujours pyrimidine)
ces nucléo aident à la structure secondaire de l’arnt
la structure secondaire des ARNt est constitué de … et de …
en se repliant, la molécule forme une structure stabilisée par la force des… entre certaines bases. Quel empilement est le plus stable
tige (domaines helicoidaux) : provient de l’appariement de bases complémentaires dans le meme brin
Boucle: se produit lorsque le manque de complémentarité ou la presence de bases modifiées empêche l’appariement des bases
pont hydrogènes
G-C > A-U
Nomme et explique les éléments de la structure secondaire de l’ARNt
secondaire: on dirait un trèfle
5’: contient Pi
Tige acceptrice de 7 nucléotides qui accepte les acides aminés à son extrémité 3’
tige de 3-4 pb suivi d’une boucle contenant la dihydrouridine (on appelle donc la tige et cette boucle le bras D)
tige de 5 pb se termine par une boucle contenant l’anticodon (la tige et la boucle constituent le bras anticodon) on peut retrouver dans l’anticodon des inosines (dérivé de l’adénine qui peut aparier U, C ou A) en 3’ puisque la base en 3’ de l’anticodon est toujours modifiée
bras variable: région qui varie le plus
tige de 5pb qui se termine par une boucle contenant séquence T(psi)C. Constitue le bras T
Tous les ARNt se terminent en 3’ par CCA ayant un OH à l’ext 3’ (posé post traductionnelement)
jusqu’à 25% des bases sont modifiées de facon post transcriptionnelles, comment
quel est le rôle de ces modifications
methylation, acetylation, addition d’a.a
affecte le repliement et la stabilisé des ARNT ainsi que l’efficacité de traduction
BASES MODIFIÉES
la méthylation de certaines bases de l’ARNt prévient …
la i6A (N6-isopentenyl adenosine) que l’on retrouve souvent ou?
qu’Est ce qu’elle fait
les mauvais appariement donc le mauvais repliement de la chaine de nucleotide de l’aRNt
en 3’ de l’anticodon
sa faible polarité augmente la force de l’interaction avec le codon, donc augmente la fidelité de lecture
faible polarité= moins de répulsion
BASES MODIFIÉES
pseudouridine résulte d’une modification post traductionnelle de l’…. (isomérisation par rotation … degrés)
à quoi sert cette modif
uridine
180
contribue a la stabilisation de la structure 3D des ARNt
quelle est la modification des base de l’ARNt la plus fréquence
pseudouridination
BASE MODIFIÉE
inosine contient une purine particulière: …
L’inosine peut former des …
on la retrouve fréquemment à quelle position
permet de
résulte de
hypoxanthine
appariment wobble (bancaleS)
premiere position de l’anticodon
permet a l’aRnt de s’apparier à plusieurs codons synonymes (parce que l’inosine peut couplé à AUC)
résulte de la desamination de l’adénine par l’adénine desaminase
