Module 7 Flashcards
C’est quoi la systématique?
Discipline dont l’objectif est de classifier les organismes et d’établir leurs liens évolutifs
Détermine l’histoire évolutif
C’est quoi la taxonomie?
discipline qui désigne et qui classifie les organismes
On nomme les organismes
C’est quoi la phylogénie?
discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées
C’est quoi un arbre phylogénétique?
diagramme arborescent hypothétique qui rend compte de l’histoire évolutive d’un groupe d’organismes et dans lequel chaque nœud représente l’ancêtre commun de ses descendants
C’est quoi le systèmes linnéen?
groupe les espèces au sein d’une hiérarchie de catégories de plus en plus inclusives, qui son basées sur des caractères communs
C’est quoi un taxons?
unité de classification; rang taxonomique identifié d’un groupe partageant un certain nombre de caractères, quel que soit le niveau hiérarchique de ce groupe (p. ex: espèce, genre, famille, ordre, etc.)
Quel est un aspect clé du système linnéen?
La nomenclature binomiale
Comment fonctionne la nomenclature binomiale?
Ex: raton laveur:
Procyon lotor L. (En italique)
Genre espèce auteur
- Nom binomial = 2 noms = Nom du genre + nom de l’espèce
– En Latin et en italique (à l’ordi) ou souligné (a la main)
– Première lettre du genre majuscule, première lettre de l’espèce minuscule
Comment est-ce que Linné a élaborer sa classification?
En se basant sur les similarités morphologiques/structurales des organismes
Ces similarités sont souvent dues à un ancêtre commun. On les appelle alors structures homologues (homologie)
C’est quoi l’analogie?
Ressemblance entre deux espèces attributable à l’évolution convergente plutôt qu’à une ancêtre commun.
C’est quoi l’évolution convergente?
Évolution indépendante de traits similaires chez des espèces soumises aux mêmes contraintes environnementales (niches écologiques similaires).
C’est quoi un exemple d’évolution convergente?
Le phalanger volant est un marsupial tandis que le polatouche est un mammifère plancentaire. Plusieurs autres traits démontrent une ascendance différente. Leur trait partagé, leurs “ailes” est le résultat d’une évolution convergente.
L’évolution convergente peut donner quoi?
– L’évolution convergente peut donner lieu à des traits analogues et les espèces peuvent perdre secondairement un trait clé partagé avec des espèces apparentées (p. ex: les poils des baleines)
– Regrouper en n’utilisant que quelques traits partagés spécifiques peut donc mener à des classifications linnéenes qui ne reflètent pas la phylogénie des organismes
C’est quoi la phylogénie?
discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées
Comment est-ce qu’on utilise la phylogénie?
– Initialement, la phylogénie était faite à l’aide de similarités morphologiques (et c’est encore le cas pour les fossiles)
– Aujourd’hui l’approche standard compare des séquences moléculaires (c.-à-d. ADN, ARN, protéines)
– Les résultats sont représentés sous la forme d’arbres phylogénétiques
Vrai ou faux: les arbres phylogénétiques peuvent être tourner autour de leur axes?
Vrai: Les arbres peuvent être tournés autour de leur axe; la proximité physique des taxons aux extrémités n’indiquent une proche parenté
Vrai ou faux: L’évolution produit des patrons de parenté entre les organismes qui sont arborescents, et non linéaires
Vrai
Vrai ou faux: Les taxons peuvent être “plus haut” ou “plus bas”, ou plus ou moins avancé qu’un autre
Faux: Aucun taxon n’est “plus haut” ou “plus bas”, ou plus ou moins avancé qu’un autre
Vrai ou faux: les taxons sont plus ou moins évolués?
Faux: Les taxons ne sont pas plus ou moins “évolués”; toutes les espèces actuellement existantes partagent un ancêtre commun (ayant vécu il y a >3.5 B d’années) et donc ne diffèrent pas en termes de la longueur de leur hisoire évolutive
Les espèces aux extrémités de l’arbre phylogénétique sont…..
Des espèces apparentés
Pourquoi est-ce que certains arbres peuvent paraître différents?
À cause de parties émondées et/ou englobante
Parce que les taxons ont été inclus ou exclus
C’est quoi un groupe monophylétique?
Groupe composé d’une espèce ancestrale et de TOUS ses descendants
C’est quoi un groupe paraphylétique?
Groupe composé d’une espèce ancestrale et certains de ses descendants
C’est quoi un groupe polyphylétique?
Groupe composé d’espèces parentes mais qui exclue leur ancêtre commun le pus récent
C’est quoi les groupes non-monophylétiques?
Groupes paraphylétique et polyphylétique
C’est quoi la cladistique?
méthode relevant de la systématique dont le principal critère de classification est l’ancêtre commun (c.-à-d. l’homologie)
La cladistique implique quoi?
– La taxonomie (c.-à-d. la classification) devrait réfléter l’histoire évolutive des organismes
– La phylogénie: les organismes devraient être organisés en séries de groupes imbriqués monophylétiques (c.-à-d. en clades) qui reflètent leur histoire évolutive
L’évidence de l’ascendance partagée vient de…..
l’étude de caractères dérivés communs
C’est quoi un clade?
Groupe incluant une espèce ancestrale et tous ses descendants (vivants et éteints). Par définition, les clades sont monophylétiques
Vrai ou faux: les clades sont imbriqué les uns dans les autres?
Vrai
C’est quoi un exemple de groupe taxinomique qui n’est pas monophylétique?
Plusieurs groupes taxonomiques existants ne sont pas monophylétiques, p. ex. la classe Reptilia est paraphylétique et le clade Dinosauria est seulement monophylétique si on inclue les oiseaux
Les phylogénies peuvent être construite à partir de quelles données?
Morphologique ou moléculaire
D’où vient l’évidence d’ascendance partagé?
Vient de caractères homologues (c.-à-d. la similarité due à un ancêtre commun)
Quelles caractères peuvent être trompeurs?
Les caractères analogues (c-à-d. qui sont similaires à cause d’un autre facteur, comme l’évolution convergente)
Les caractères homologues peuvent être diviser en quels 2 catégories de caractères?
Ancestraux ou dérivés
C’est quoi les caractères ancestraux communs?
Caractère partagé par les membres d’un clade particulier, mais provenant d’un ancêtre qui n’est pas membre de ce clade. Ex: Colonne vertébrale chez les mammifères (aussi présent chez d’autres espèces qui ne sont pas des mammifères)
C’est quoi les caractères dérivé commun?
Innovation apparue au cours de l’évolution qui relève exclusivement d’un clade particulier. Ex: Poils chez les mammifères (apparu lors de l’évolution des mammifères)
Les phylogénies sont inférées en formant des clades basés sur….
Les caractères dérivés communs
C’est quoi la construction de phylogénie?
– Les caractères dérivés communs sont, par définition, uniques à un groupe et ont été transmis de l’ancêtre commun duquel ils sont initialement apparus
– Les espèces à l’extérieur de ce clade ne présentent pas le trait, donc en échantillonnant des espèces, incluant un groupe extérieur (une ou quelques espèces à hors du groupe à l’étude), on peut inférer les relations évolutives
– Les systématiciens comparent les espèces du groupe à l’étude entre elles et avec le groupe extérieur pour différencier caractères dérivés communs et caractères ancestraux communs, en regroupant les espèces avec des traits dérivés communs, déterminant de cette façon quels caractères ont été dérivés à différents points de bifurcation de l’arbre
C’est quoi le principe de parcimonie maximale?
l’arbre le plus probable est celui qui implique le plus petit nombre d’événements évolutifs (p. ex: le gain ou la perte d’un trait)
Quels sont les 2 types d’arbres phylogénétique?
Cladogramme
Phylogramme
C’est quoi un cladogramme?
ne montre que le patron d’embranchement sans information sur le temps ou l’ampleur du changement (c.-à-d. que la longueur des branches est arbitraire)
C’est quoi un phylogramme?
montre les patrons d’embranchement ET la longueur des branches est proportionnelle soit à l’ampleur du changement génétique, soit au temps des différents points de bifurcation
La datation peut être fait avec quels 2 concepts?
Les fossiles
Les horloges moléculaires
Comment est-ce que la datation est fait avec les fossiles?
en combinaison avec la datation radiométrique et/ou la stratigraphie (l’étude des couches minérales)
Comment est-ce que la datation est fait avec les horloges moléculaires?
assument que le taux de substitutions de nucléotides par unité de temps est constant pour un gène donné
Quelles sont les 2 utilités des analyses phylogénétiques?
L’inférence phylogénétique
Les applications practique
C’est quoi l’inférence phylogénétique?
Peut prédire des traits d’organismes éteints en se basant sur des caractères partagés par de multiples espèces existantes qui partagent toutes les même ancêtre
Ex: les crocodiles et les oiseaux font un nid pour mettre leurs œufs et garde/couvre leurs nid. Puisqu’ils partage un ancêtre commun avec les dinosaurs, ça veut dire que les dinosaurs aussi faisaient probablement la même chose
C’est quoi les applications pratique?
- Comprendre l’origine des maladies humaines; p ex, le VIH a évolué plusieurs fois du virus de
l’immunodéficience simienne (VIS) - Identifier la source d’infections de VIH et condamner une personne pour avoir consciemment infecté d’autres personnes
Une 6e extinction de masse est actuellement en cours. Comment assigner nos ressources limitées pour la conservation?
– Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier des taxon avec un risque d’extinction accru
– Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier les taxons qui sont uniques d’un point de vue évolutif
