Module 7

Question 1

C’est quoi la systématique?

Answer 1

Discipline dont l’objectif est de classifier les organismes et d’établir leurs liens évolutifs
Détermine l’histoire évolutif

Question 2

C’est quoi la taxonomie?

Answer 2

discipline qui désigne et qui classifie les organismes
On nomme les organismes

Question 3

C’est quoi la phylogénie?

Answer 3

discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées

Question 4

C’est quoi un arbre phylogénétique?

Answer 4

diagramme arborescent hypothétique qui rend compte de l’histoire évolutive d’un groupe d’organismes et dans lequel chaque nœud représente l’ancêtre commun de ses descendants

Question 5

C’est quoi le systèmes linnéen?

Answer 5

groupe les espèces au sein d’une hiérarchie de catégories de plus en plus inclusives, qui son basées sur des caractères communs

Question 6

C’est quoi un taxons?

Answer 6

unité de classification; rang taxonomique identifié d’un groupe partageant un certain nombre de caractères, quel que soit le niveau hiérarchique de ce groupe (p. ex: espèce, genre, famille, ordre, etc.)

Question 7

Quel est un aspect clé du système linnéen?

Answer 7

La nomenclature binomiale

Question 8

Comment fonctionne la nomenclature binomiale?

Answer 8

Ex: raton laveur:

Procyon lotor L. (En italique)
Genre espèce auteur

• Nom binomial = 2 noms = Nom du genre + nom de l’espèce
  – En Latin et en italique (à l’ordi) ou souligné (a la main)
  – Première lettre du genre majuscule, première lettre de l’espèce minuscule

Question 9

Comment est-ce que Linné a élaborer sa classification?

Answer 9

En se basant sur les similarités morphologiques/structurales des organismes
Ces similarités sont souvent dues à un ancêtre commun. On les appelle alors structures homologues (homologie)

Question 10

C’est quoi l’analogie?

Answer 10

Ressemblance entre deux espèces attributable à l’évolution convergente plutôt qu’à une ancêtre commun.

Question 11

C’est quoi l’évolution convergente?

Answer 11

Évolution indépendante de traits similaires chez des espèces soumises aux mêmes contraintes environnementales (niches écologiques similaires).

Question 12

C’est quoi un exemple d’évolution convergente?

Answer 12

Le phalanger volant est un marsupial tandis que le polatouche est un mammifère plancentaire. Plusieurs autres traits démontrent une ascendance différente. Leur trait partagé, leurs “ailes” est le résultat d’une évolution convergente.

Question 13

L’évolution convergente peut donner quoi?

Answer 13

– L’évolution convergente peut donner lieu à des traits analogues et les espèces peuvent perdre secondairement un trait clé partagé avec des espèces apparentées (p. ex: les poils des baleines)
– Regrouper en n’utilisant que quelques traits partagés spécifiques peut donc mener à des classifications linnéenes qui ne reflètent pas la phylogénie des organismes

Question 14

C’est quoi la phylogénie?

Answer 14

discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées

Question 15

Comment est-ce qu’on utilise la phylogénie?

Answer 15

– Initialement, la phylogénie était faite à l’aide de similarités morphologiques (et c’est encore le cas pour les fossiles)
– Aujourd’hui l’approche standard compare des séquences moléculaires (c.-à-d. ADN, ARN, protéines)
– Les résultats sont représentés sous la forme d’arbres phylogénétiques

Question 16

Vrai ou faux: les arbres phylogénétiques peuvent être tourner autour de leur axes?

Answer 16

Vrai: Les arbres peuvent être tournés autour de leur axe; la proximité physique des taxons aux extrémités n’indiquent une proche parenté

Question 17

Vrai ou faux: L’évolution produit des patrons de parenté entre les organismes qui sont arborescents, et non linéaires

Answer 17

Vrai

Question 18

Vrai ou faux: Les taxons peuvent être “plus haut” ou “plus bas”, ou plus ou moins avancé qu’un autre

Answer 18

Faux: Aucun taxon n’est “plus haut” ou “plus bas”, ou plus ou moins avancé qu’un autre

Question 19

Vrai ou faux: les taxons sont plus ou moins évolués?

Answer 19

Faux: Les taxons ne sont pas plus ou moins “évolués”; toutes les espèces actuellement existantes partagent un ancêtre commun (ayant vécu il y a >3.5 B d’années) et donc ne diffèrent pas en termes de la longueur de leur hisoire évolutive

Question 20

Les espèces aux extrémités de l’arbre phylogénétique sont…..

Answer 20

Des espèces apparentés

Question 21

Pourquoi est-ce que certains arbres peuvent paraître différents?

Answer 21

À cause de parties émondées et/ou englobante
Parce que les taxons ont été inclus ou exclus

Question 22

C’est quoi un groupe monophylétique?

Answer 22

Groupe composé d’une espèce ancestrale et de TOUS ses descendants

Question 23

C’est quoi un groupe paraphylétique?

Answer 23

Groupe composé d’une espèce ancestrale et certains de ses descendants

Question 24

C’est quoi un groupe polyphylétique?

Answer 24

Groupe composé d’espèces parentes mais qui exclue leur ancêtre commun le pus récent

Question 25

C’est quoi les groupes non-monophylétiques?

Answer 25

Groupes paraphylétique et polyphylétique

Question 26

C’est quoi la cladistique?

Answer 26

méthode relevant de la systématique dont le principal critère de classification est l’ancêtre commun (c.-à-d. l’homologie)

Question 27

La cladistique implique quoi?

Answer 27

– La taxonomie (c.-à-d. la classification) devrait réfléter l’histoire évolutive des organismes
– La phylogénie: les organismes devraient être organisés en séries de groupes imbriqués monophylétiques (c.-à-d. en clades) qui reflètent leur histoire évolutive

Question 28

L’évidence de l’ascendance partagée vient de…..

Answer 28

l’étude de caractères dérivés communs

Question 29

C’est quoi un clade?

Answer 29

Groupe incluant une espèce ancestrale et tous ses descendants (vivants et éteints). Par définition, les clades sont monophylétiques

Question 30

Vrai ou faux: les clades sont imbriqué les uns dans les autres?

Answer 30

Vrai

Question 31

C’est quoi un exemple de groupe taxinomique qui n’est pas monophylétique?

Answer 31

Plusieurs groupes taxonomiques existants ne sont pas monophylétiques, p. ex. la classe Reptilia est paraphylétique et le clade Dinosauria est seulement monophylétique si on inclue les oiseaux

Question 32

Les phylogénies peuvent être construite à partir de quelles données?

Answer 32

Morphologique ou moléculaire

Question 33

D’où vient l’évidence d’ascendance partagé?

Answer 33

Vient de caractères homologues (c.-à-d. la similarité due à un ancêtre commun)

Question 34

Quelles caractères peuvent être trompeurs?

Answer 34

Les caractères analogues (c-à-d. qui sont similaires à cause d’un autre facteur, comme l’évolution convergente)

Question 35

Les caractères homologues peuvent être diviser en quels 2 catégories de caractères?

Answer 35

Ancestraux ou dérivés

Question 36

C’est quoi les caractères ancestraux communs?

Answer 36

Caractère partagé par les membres d’un clade particulier, mais provenant d’un ancêtre qui n’est pas membre de ce clade. Ex: Colonne vertébrale chez les mammifères (aussi présent chez d’autres espèces qui ne sont pas des mammifères)

Question 37

C’est quoi les caractères dérivé commun?

Answer 37

Innovation apparue au cours de l’évolution qui relève exclusivement d’un clade particulier. Ex: Poils chez les mammifères (apparu lors de l’évolution des mammifères)

Question 38

Les phylogénies sont inférées en formant des clades basés sur….

Answer 38

Les caractères dérivés communs

Question 39

C’est quoi la construction de phylogénie?

Answer 39

– Les caractères dérivés communs sont, par définition, uniques à un groupe et ont été transmis de l’ancêtre commun duquel ils sont initialement apparus
– Les espèces à l’extérieur de ce clade ne présentent pas le trait, donc en échantillonnant des espèces, incluant un groupe extérieur (une ou quelques espèces à hors du groupe à l’étude), on peut inférer les relations évolutives
– Les systématiciens comparent les espèces du groupe à l’étude entre elles et avec le groupe extérieur pour différencier caractères dérivés communs et caractères ancestraux communs, en regroupant les espèces avec des traits dérivés communs, déterminant de cette façon quels caractères ont été dérivés à différents points de bifurcation de l’arbre

Question 40

C’est quoi le principe de parcimonie maximale?

Answer 40

l’arbre le plus probable est celui qui implique le plus petit nombre d’événements évolutifs (p. ex: le gain ou la perte d’un trait)

Question 41

Quels sont les 2 types d’arbres phylogénétique?

Answer 41

Cladogramme
Phylogramme

Question 42

C’est quoi un cladogramme?

Answer 42

ne montre que le patron d’embranchement sans information sur le temps ou l’ampleur du changement (c.-à-d. que la longueur des branches est arbitraire)

Question 43

C’est quoi un phylogramme?

Answer 43

montre les patrons d’embranchement ET la longueur des branches est proportionnelle soit à l’ampleur du changement génétique, soit au temps des différents points de bifurcation

Question 44

La datation peut être fait avec quels 2 concepts?

Answer 44

Les fossiles
Les horloges moléculaires

Question 45

Comment est-ce que la datation est fait avec les fossiles?

Answer 45

en combinaison avec la datation radiométrique et/ou la stratigraphie (l’étude des couches minérales)

Question 46

Comment est-ce que la datation est fait avec les horloges moléculaires?

Answer 46

assument que le taux de substitutions de nucléotides par unité de temps est constant pour un gène donné

Question 47

Quelles sont les 2 utilités des analyses phylogénétiques?

Answer 47

L’inférence phylogénétique
Les applications practique

Question 48

C’est quoi l’inférence phylogénétique?

Answer 48

Peut prédire des traits d’organismes éteints en se basant sur des caractères partagés par de multiples espèces existantes qui partagent toutes les même ancêtre
Ex: les crocodiles et les oiseaux font un nid pour mettre leurs œufs et garde/couvre leurs nid. Puisqu’ils partage un ancêtre commun avec les dinosaurs, ça veut dire que les dinosaurs aussi faisaient probablement la même chose

Question 49

C’est quoi les applications pratique?

Answer 49

• Comprendre l’origine des maladies humaines; p ex, le VIH a évolué plusieurs fois du virus de
  l’immunodéficience simienne (VIS)
• Identifier la source d’infections de VIH et condamner une personne pour avoir consciemment infecté d’autres personnes

Une 6e extinction de masse est actuellement en cours. Comment assigner nos ressources limitées pour la conservation?
– Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier des taxon avec un risque d’extinction accru
– Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier les taxons qui sont uniques d’un point de vue évolutif