transposons

Question 1

DNA-only tranposons yapısı ve işlevi

Answer 1

cut and paste mekanizması vardır
transposase enzimi sentezler ve o enzimle olduğu yerden kopar ve hemen yakınında bir DNA sekansına girer
girdiği kısımları bölmez başlangıç kısımlarına girer ve o sekansların iki katına çıkmasına neden olur
iki ucunda simetrik tekrar sekansları bulnun
hareket etme özelliği yoktur

Question 2

insrtion sequence nedir

Answer 2

transposone’ların 800-2000 nükleotide içerecn ve uçan kaçan kısmı
1-2 kb
transposase sentezleyen 50 nükleotitlik sekans içerir

Question 3

retroviral-like retrotransposon nedir nasıl işler

Answer 3

LTR transposons
uçlarında direkt aynı yöne tekrar eden 250-600 bp’lik sekans içerirler
human genomunun %8’ini kaplarlar
iki alt sınıfları vardır
HERVs ve LTR elements
yapıları retrovirus yapısına benzer
LTR elements çok fazla virüslere benzemez
copy paste mekanizması ile çalışırlar

Question 4

hangi tansposon intahrase ve reverse transcriptase sentezler

Answer 4

retrorival-like transposons

Question 5

Noretrorival retrotransposons nedir ve işleyişleri nasıldır

Answer 5

endonükleaz ve reverse transcriptase sentezlerler
copy paste mekanizmasıyla çlışırlar
bir mRNA sentezlenir ve işlenmesi tamamlanr ardından reverse transkriptaz ile cDNA oluşturulur ve bu cDNA ana DNA’ya eklenir
mRNA’da bulunan polyA tail’in karşılığı da bulunur
iki çeşidi vardır SINEs ve LINEs

Question 6

LINEs’in özellikleri nelerdir

Answer 6

boyutu 6 kb’ın üzerindedir
uzun bir tarihi geçmişi vardır ve genelde fare gibi memelilerde bulunurlar
inanlarda bulunanı 3 aileden oluşur: LINE-1 LINE-2 LINE-3
euchromatic region’da bulunurlar
aktiv olarak hareket eden L1 ailesidir
850k kopyası vardır ve genomun %21’ini kaplar

Question 7

SINEs nedir ve özellikleri nelerdir

Answer 7

genelde 400 nükleotitten bile kısadır
tek başına hareket edemez yanlarında bulunan LINE’ler ile beraber hareket edebilirler